More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_12605 on replicon NC_011677
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011677  PHATRDRAFT_12605  predicted protein  100 
 
 
615 aa  1282    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0563  excinuclease ABC subunit B  50.41 
 
 
666 aa  604  1.0000000000000001e-171  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.733421  normal  0.043063 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2678  excinuclease ABC subunit B  50.73 
 
 
677 aa  604  1.0000000000000001e-171  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.292307 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00791  excinuclease ABC subunit B  49.43 
 
 
679 aa  601  1e-170  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.152915 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3669  excinuclease ABC subunit B  49.19 
 
 
667 aa  595  1e-169  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4680  excinuclease ABC subunit B  49.76 
 
 
665 aa  598  1e-169  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3723  excinuclease ABC subunit B  49.19 
 
 
667 aa  595  1e-169  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.22049  normal  0.128382 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21171  excinuclease ABC subunit B  49.19 
 
 
678 aa  595  1e-169  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5213  excinuclease ABC subunit B  50.24 
 
 
665 aa  595  1e-168  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.100311  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1247  excinuclease ABC subunit B  49.19 
 
 
678 aa  595  1e-168  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.118971  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18581  excinuclease ABC subunit B  48.78 
 
 
679 aa  594  1e-168  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0077  excinuclease ABC subunit B  49.76 
 
 
679 aa  588  1e-167  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.5939  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0080  excinuclease ABC subunit B  49.43 
 
 
702 aa  590  1e-167  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.935466  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1741  excinuclease ABC subunit B  48.62 
 
 
679 aa  590  1e-167  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18391  excinuclease ABC subunit B  48.62 
 
 
679 aa  590  1e-167  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1767  excinuclease ABC subunit B  49.27 
 
 
665 aa  585  1e-166  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18391  excinuclease ABC subunit B  48.46 
 
 
679 aa  587  1e-166  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17751  excinuclease ABC subunit B  48.7 
 
 
679 aa  578  1e-164  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3236  excinuclease ABC subunit B  48.05 
 
 
665 aa  578  1e-164  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1416  excinuclease ABC subunit B  51.09 
 
 
664 aa  572  1.0000000000000001e-162  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1438  excinuclease ABC subunit B  49.75 
 
 
661 aa  574  1.0000000000000001e-162  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1464  excinuclease ABC subunit B  47.75 
 
 
663 aa  565  1e-160  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2845  excinuclease ABC, B subunit  50.75 
 
 
704 aa  566  1e-160  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000519968  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1457  excinuclease ABC subunit B  48.16 
 
 
668 aa  567  1e-160  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.174778  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5516  excinuclease ABC subunit B  49.83 
 
 
723 aa  566  1e-160  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2184  excinuclease ABC subunit B  49.67 
 
 
698 aa  562  1.0000000000000001e-159  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.383397  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25880  excinuclease ABC subunit B  49.17 
 
 
719 aa  564  1.0000000000000001e-159  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0047  excinuclease ABC, B subunit  50.25 
 
 
687 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.63144  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1052  excinuclease ABC subunit B  47.26 
 
 
661 aa  561  1.0000000000000001e-159  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0552725  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3030  excinuclease ABC subunit B  50.51 
 
 
739 aa  565  1.0000000000000001e-159  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00520932  hitchhiker  0.00289702 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2427  excinuclease ABC, B subunit  49.83 
 
 
720 aa  561  1.0000000000000001e-159  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0309  excinuclease ABC subunit B  48.18 
 
 
660 aa  562  1.0000000000000001e-159  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00254602  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20160  Excinuclease ABC subunit B  49.5 
 
 
699 aa  563  1.0000000000000001e-159  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.639576 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0965  excinuclease ABC, B subunit  49.25 
 
 
699 aa  559  1e-158  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1529  excinuclease ABC, B subunit  49.5 
 
 
701 aa  560  1e-158  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1280  excinuclease ABC, B subunit  49.25 
 
 
658 aa  557  1e-157  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5652  excinuclease ABC subunit B  49.08 
 
 
703 aa  558  1e-157  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.25933  normal  0.126171 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2983  excinuclease ABC subunit B  48.76 
 
 
711 aa  557  1e-157  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.293164 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1106  excinuclease ABC subunit B  48.67 
 
 
705 aa  555  1e-157  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.442429  normal  0.317752 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0291  excinuclease ABC subunit B  47.93 
 
 
664 aa  553  1e-156  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00669418  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11190  excinuclease ABC subunit B  48.24 
 
 
709 aa  552  1e-156  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2865  excinuclease ABC, B subunit  49.08 
 
 
718 aa  553  1e-156  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3066  excinuclease ABC subunit B  48.33 
 
 
672 aa  552  1e-156  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000537997  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0884  excinuclease ABC, B subunit  46.93 
 
 
662 aa  553  1e-156  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3556  excinuclease ABC subunit B  48.58 
 
 
719 aa  551  1e-155  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.48659 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1960  excinuclease ABC, B subunit  48.76 
 
 
704 aa  550  1e-155  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.385865  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1810  excinuclease ABC subunit B  48.74 
 
 
704 aa  550  1e-155  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000239572 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1957  excinuclease ABC, B subunit  48.34 
 
 
701 aa  550  1e-155  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.815633  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1407  excinuclease ABC, B subunit  49.58 
 
 
656 aa  550  1e-155  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0295  excinuclease ABC subunit B  47.66 
 
 
659 aa  549  1e-155  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.837943  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3957  excinuclease ABC subunit B  49.16 
 
 
674 aa  550  1e-155  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000186158  hitchhiker  0.0000000163265 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0801  excinuclease ABC subunit B  48.36 
 
 
691 aa  551  1e-155  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.177675 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1485  excinuclease ABC subunit B  49.49 
 
 
702 aa  551  1e-155  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2050  excinuclease ABC subunit B  48.18 
 
 
731 aa  549  1e-155  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.462256 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3710  excinuclease ABC subunit B  48.6 
 
 
658 aa  548  1e-154  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.343081  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13020  excinuclease ABC subunit B  48.76 
 
 
705 aa  547  1e-154  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.144  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3001  excinuclease ABC subunit B  48.41 
 
 
719 aa  545  1e-154  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0300  excinuclease ABC subunit B  47.49 
 
 
659 aa  547  1e-154  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0583  excinuclease ABC subunit B  45.45 
 
 
692 aa  546  1e-154  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3047  excinuclease ABC subunit B  48.41 
 
 
719 aa  545  1e-154  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.741685 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2493  excinuclease ABC subunit B  47.63 
 
 
729 aa  545  1e-153  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.220361  decreased coverage  0.00080111 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2942  excinuclease ABC subunit B  48.49 
 
 
708 aa  543  1e-153  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.347437  normal  0.592754 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3175  excinuclease ABC subunit B  48.27 
 
 
658 aa  545  1e-153  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1754  excinuclease ABC subunit B  46.72 
 
 
678 aa  544  1e-153  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1626  excinuclease ABC subunit B  47.57 
 
 
714 aa  543  1e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2070  excinuclease ABC subunit B  47.91 
 
 
693 aa  545  1e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.12882  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3444  excinuclease ABC subunit B  47.59 
 
 
665 aa  543  1e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00237393  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0441  excinuclease ABC subunit B  47.58 
 
 
668 aa  539  9.999999999999999e-153  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3705  excinuclease ABC subunit B  48.33 
 
 
670 aa  541  9.999999999999999e-153  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0318232 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0293  excinuclease ABC subunit B  49.58 
 
 
674 aa  540  9.999999999999999e-153  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1275  excinuclease ABC subunit B  48.09 
 
 
699 aa  539  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.668  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3530  excinuclease ABC subunit B  48 
 
 
670 aa  539  9.999999999999999e-153  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.220409  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11649  excinuclease ABC subunit B  49.25 
 
 
698 aa  539  9.999999999999999e-153  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.548636  normal  0.697699 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0418  excinuclease ABC subunit B  47.83 
 
 
664 aa  539  9.999999999999999e-153  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1782  excinuclease ABC subunit B  47.35 
 
 
662 aa  539  9.999999999999999e-153  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.753339  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1318  excinuclease ABC subunit B  45.86 
 
 
671 aa  541  9.999999999999999e-153  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000791691  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1413  excinuclease ABC subunit B  47.17 
 
 
660 aa  541  9.999999999999999e-153  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000981349  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1082  excinuclease ABC subunit B  46.58 
 
 
670 aa  540  9.999999999999999e-153  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00208033  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3350  excinuclease ABC subunit B  48.91 
 
 
722 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0910729  normal  0.613367 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1825  excinuclease ABC, B subunit  47.94 
 
 
681 aa  537  1e-151  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0508947  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_383  excinuclease ABC, B subunit  47.41 
 
 
668 aa  538  1e-151  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0150  excinuclease ABC subunit B  47.76 
 
 
662 aa  537  1e-151  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00713104  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0134  excinuclease ABC subunit B  47.76 
 
 
662 aa  536  1e-151  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16230  excinuclease ABC, B subunit  45.82 
 
 
672 aa  537  1e-151  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0099  excinuclease ABC subunit B  47.45 
 
 
667 aa  535  1e-151  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0383  excinuclease ABC subunit B  44.98 
 
 
690 aa  536  1e-151  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.629136  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0293  excinuclease ABC subunit B  47.45 
 
 
676 aa  538  1e-151  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0614567 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2963  excinuclease ABC subunit B  46.88 
 
 
669 aa  537  1e-151  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000919416  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2037  Excinuclease ABC subunit B  47.32 
 
 
658 aa  537  1e-151  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000674762 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1013  excinuclease ABC, B subunit  47.12 
 
 
667 aa  536  1e-151  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2992  excinuclease ABC subunit B  48.27 
 
 
659 aa  537  1e-151  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000124238  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1529  excinuclease ABC subunit B  48.83 
 
 
677 aa  536  1e-151  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.521978 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02961  excinuclease ABC subunit B  47.4 
 
 
676 aa  537  1e-151  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002950  excinuclease ABC subunit B  47.57 
 
 
676 aa  535  1e-150  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000433983  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0782  excinuclease ABC subunit B  46.69 
 
 
661 aa  533  1e-150  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.24339  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0540  excinuclease ABC subunit B  47.74 
 
 
676 aa  532  1e-150  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4735  excinuclease ABC subunit B  48 
 
 
683 aa  534  1e-150  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0259  excinuclease ABC subunit B  46.49 
 
 
662 aa  532  1e-150  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000897839  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1617  excinuclease ABC subunit B  46.52 
 
 
677 aa  533  1e-150  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15070  excinuclease ABC subunit B  50.42 
 
 
700 aa  532  1e-150  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.663509  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>