More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET0441 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00746  excinuclease ABC subunit B  57.7 
 
 		 673 aa  748    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000144798  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2863  excinuclease ABC, B subunit  57.7 
 
 		 673 aa  748    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000294362  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0441  excinuclease ABC subunit B  100 
 
 		 668 aa  1358    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3262  excinuclease ABC subunit B  56.86 
 
 		 664 aa  782    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1974  excinuclease ABC subunit B  55.99 
 
 		 671 aa  777    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.238105  hitchhiker  0.00441093 
 
 
-
 
NC_002950  PG0380  excinuclease ABC subunit B  54.68 
 
 		 678 aa  731    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1369  excinuclease ABC subunit B  55.62 
 
 		 662 aa  759    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0426  excinuclease ABC subunit B  61.76 
 
 		 661 aa  830    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2201  excinuclease ABC subunit B  58.17 
 
 		 664 aa  775    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1011  excinuclease ABC subunit B  54.71 
 
 		 696 aa  748    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.771852  normal  0.613992 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5272  excinuclease ABC subunit B  63.4 
 
 		 658 aa  835    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2887  excinuclease ABC subunit B  55.17 
 
 		 673 aa  753    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.149884  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1464  excinuclease ABC subunit B  59.2 
 
 		 663 aa  823    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1512  excinuclease ABC subunit B  54.04 
 
 		 940 aa  734    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2506  excinuclease ABC subunit B  56.54 
 
 		 673 aa  752    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2164  excinuclease ABC, B subunit  55.54 
 
 		 671 aa  775    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.155475  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5016  excinuclease ABC subunit B  63.66 
 
 		 658 aa  840    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4845  excinuclease ABC subunit B  63.82 
 
 		 658 aa  842    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4860  excinuclease ABC subunit B  63.66 
 
 		 658 aa  839    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0880  excinuclease ABC subunit B  54.71 
 
 		 696 aa  746    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0086  excinuclease ABC subunit B  55.84 
 
 		 663 aa  766    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0074  excinuclease ABC subunit B  55.99 
 
 		 663 aa  768    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1974  excinuclease ABC subunit B  55.39 
 
 		 671 aa  773    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.292507 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0744  excinuclease ABC subunit B  56.22 
 
 		 703 aa  765    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2003  excinuclease ABC subunit B  56.86 
 
 		 690 aa  777    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.138887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1196  excinuclease ABC subunit B  59.06 
 
 		 701 aa  795    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1247  excinuclease ABC subunit B  56 
 
 		 678 aa  783    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.118971  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1051  excinuclease ABC subunit B  55.69 
 
 		 695 aa  768    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1568  excinuclease ABC subunit B  57.06 
 
 		 675 aa  789    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4680  excinuclease ABC subunit B  57.98 
 
 		 665 aa  801    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1920  excinuclease ABC subunit B  54.71 
 
 		 707 aa  746    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1139  excinuclease ABC subunit B  54.45 
 
 		 687 aa  746    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0652505  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1875  excinuclease ABC subunit B  55.54 
 
 		 671 aa  775    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0099  excinuclease ABC subunit B  57.34 
 
 		 667 aa  773    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5538  excinuclease ABC subunit B  54.86 
 
 		 707 aa  746    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0077  excinuclease ABC subunit B  57.44 
 
 		 679 aa  789    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.5939  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0080  excinuclease ABC subunit B  56.55 
 
 		 702 aa  781    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.935466  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3219  excinuclease ABC subunit B  57.88 
 
 		 665 aa  790    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0533109  hitchhiker  0.000839421 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2096  excinuclease ABC subunit B  55.57 
 
 		 682 aa  750    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.587064  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1754  excinuclease ABC subunit B  55.84 
 
 		 678 aa  764    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5396  excinuclease ABC subunit B  63.66 
 
 		 658 aa  840    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1741  excinuclease ABC subunit B  53.97 
 
 		 679 aa  768    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0563  excinuclease ABC subunit B  59.21 
 
 		 666 aa  819    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.733421  normal  0.043063 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1361  excinuclease ABC subunit B  55.22 
 
 		 695 aa  760    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1133  excinuclease ABC subunit B  56.15 
 
 		 733 aa  763    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0668171  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0251  excinuclease ABC subunit B  62.82 
 
 		 663 aa  850    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2036  excinuclease ABC subunit B  54.56 
 
 		 696 aa  745    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1275  excinuclease ABC subunit B  58.55 
 
 		 699 aa  803    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.668  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1626  excinuclease ABC subunit B  56.95 
 
 		 714 aa  798    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2175  excinuclease ABC subunit B  55.54 
 
 		 710 aa  759    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00395254  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1753  excinuclease ABC subunit B  56.65 
 
 		 666 aa  789    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1320  excinuclease ABC subunit B  56.21 
 
 		 679 aa  767    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.350926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2176  excinuclease ABC subunit B  56.02 
 
 		 706 aa  766    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00882926  normal  0.14877 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3153  excinuclease ABC subunit B  55.03 
 
 		 701 aa  750    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.414181 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1797  excinuclease ABC subunit B  55.24 
 
 		 676 aa  739    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000373442  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2303  excinuclease ABC subunit B  56.9 
 
 		 660 aa  772    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1833  excinuclease ABC subunit B  55.24 
 
 		 676 aa  750    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0737  excinuclease ABC subunit B  56.39 
 
 		 662 aa  760    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1019  excinuclease ABC subunit B  55.71 
 
 		 697 aa  764    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.231406  normal  0.390908 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1782  excinuclease ABC subunit B  55.62 
 
 		 662 aa  773    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.753339  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1890  excinuclease ABC subunit B  56.4 
 
 		 676 aa  782    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.570377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0275  excinuclease ABC subunit B  56.1 
 
 		 728 aa  746    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.249968 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5867  excinuclease ABC subunit B  54.88 
 
 		 707 aa  745    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3001  excinuclease ABC subunit B  56.95 
 
 		 719 aa  795    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2021  excinuclease ABC subunit B  59.74 
 
 		 625 aa  768    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.39565  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2963  excinuclease ABC subunit B  56.67 
 
 		 669 aa  767    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000919416  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0008  excinuclease ABC subunit B  52.84 
 
 		 673 aa  739    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.847114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0300  excinuclease ABC subunit B  58.99 
 
 		 659 aa  810    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0295  excinuclease ABC subunit B  58.99 
 
 		 659 aa  809    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.837943  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1617  excinuclease ABC subunit B  55.96 
 
 		 677 aa  750    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2678  excinuclease ABC subunit B  58.05 
 
 		 677 aa  801    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.292307 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2061  excinuclease ABC subunit B  56.37 
 
 		 673 aa  754    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000836148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1914  excinuclease ABC subunit B  56.52 
 
 		 673 aa  755    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00112158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1088  excinuclease ABC subunit B  56.86 
 
 		 675 aa  769    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2170  excinuclease ABC subunit B  56.11 
 
 		 673 aa  741    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00276805  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0251  excinuclease ABC subunit B  59.43 
 
 		 665 aa  814    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00546906  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2160  excinuclease ABC subunit B  53.41 
 
 		 721 aa  732    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2248  excinuclease ABC subunit B  55.03 
 
 		 696 aa  746    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23510  excinuclease ABC subunit B  55.92 
 
 		 670 aa  763    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00672603 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0583  excinuclease ABC subunit B  56.53 
 
 		 692 aa  798    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0372  excinuclease ABC subunit B  58.22 
 
 		 673 aa  802    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1318  excinuclease ABC subunit B  57.29 
 
 		 671 aa  806    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000791691  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0392  excinuclease ABC subunit B  56.45 
 
 		 669 aa  787    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1457  excinuclease ABC subunit B  60.43 
 
 		 668 aa  836    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.174778  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2070  excinuclease ABC subunit B  58.42 
 
 		 693 aa  809    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.12882  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2210  excinuclease ABC subunit B  54.88 
 
 		 707 aa  745    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0801  excinuclease ABC subunit B  59.06 
 
 		 691 aa  806    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.177675 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0699  excinuclease ABC subunit B  57.29 
 
 		 675 aa  787    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.301254  normal  0.648791 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2166  excinuclease ABC subunit B  56.37 
 
 		 673 aa  753    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000274119  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1106  excinuclease ABC subunit B  57.69 
 
 		 705 aa  803    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.442429  normal  0.317752 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3485  excinuclease ABC subunit B  54.31 
 
 		 701 aa  764    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2837  excinuclease ABC subunit B  57.6 
 
 		 706 aa  800    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1828  excinuclease ABC subunit B  56.72 
 
 		 672 aa  753    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00277406  normal  0.439002 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3047  excinuclease ABC subunit B  56.95 
 
 		 719 aa  795    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.741685 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1082  excinuclease ABC subunit B  56.5 
 
 		 670 aa  760    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00208033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3350  excinuclease ABC subunit B  57.56 
 
 		 722 aa  785    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0910729  normal  0.613367 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1033  excinuclease ABC subunit B  55.06 
 
 		 685 aa  760    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.568445  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1529  excinuclease ABC subunit B  56.55 
 
 		 677 aa  783    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.521978 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2441  excinuclease ABC subunit B  54.94 
 
 		 696 aa  756    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.869915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1563  excinuclease ABC subunit B  55.85 
 
 		 702 aa  767    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.027574  normal  0.692797 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>