More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3705 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00746  excinuclease ABC subunit B  56.86 
 
 
673 aa  729    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000144798  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2863  excinuclease ABC, B subunit  56.86 
 
 
673 aa  729    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000294362  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0441  excinuclease ABC subunit B  65.71 
 
 
668 aa  902    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3262  excinuclease ABC subunit B  59.51 
 
 
664 aa  800    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1974  excinuclease ABC subunit B  57.66 
 
 
671 aa  770    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.238105  hitchhiker  0.00441093 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1369  excinuclease ABC subunit B  54.95 
 
 
662 aa  750    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0426  excinuclease ABC subunit B  60.76 
 
 
661 aa  825    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2201  excinuclease ABC subunit B  56.71 
 
 
664 aa  758    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1011  excinuclease ABC subunit B  56.31 
 
 
696 aa  757    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.771852  normal  0.613992 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5272  excinuclease ABC subunit B  61.37 
 
 
658 aa  825    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2887  excinuclease ABC subunit B  55.74 
 
 
673 aa  744    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.149884  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1464  excinuclease ABC subunit B  59.54 
 
 
663 aa  812    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1512  excinuclease ABC subunit B  55.37 
 
 
940 aa  739    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2506  excinuclease ABC subunit B  55.19 
 
 
673 aa  737    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2164  excinuclease ABC, B subunit  57.36 
 
 
671 aa  762    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.155475  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5016  excinuclease ABC subunit B  61.83 
 
 
658 aa  830    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4845  excinuclease ABC subunit B  61.83 
 
 
658 aa  831    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4860  excinuclease ABC subunit B  61.68 
 
 
658 aa  828    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0880  excinuclease ABC subunit B  55.95 
 
 
696 aa  748    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0086  excinuclease ABC subunit B  55.62 
 
 
663 aa  757    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0074  excinuclease ABC subunit B  55.62 
 
 
663 aa  757    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1974  excinuclease ABC subunit B  57.66 
 
 
671 aa  763    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.292507 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0744  excinuclease ABC subunit B  54.04 
 
 
703 aa  745    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2003  excinuclease ABC subunit B  56.48 
 
 
690 aa  772    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.138887  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1196  excinuclease ABC subunit B  57.37 
 
 
701 aa  756    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1247  excinuclease ABC subunit B  55.51 
 
 
678 aa  748    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.118971  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1051  excinuclease ABC subunit B  56.59 
 
 
695 aa  773    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1568  excinuclease ABC subunit B  57.36 
 
 
675 aa  780    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4680  excinuclease ABC subunit B  58.46 
 
 
665 aa  782    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1920  excinuclease ABC subunit B  55.95 
 
 
707 aa  748    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1139  excinuclease ABC subunit B  54.48 
 
 
687 aa  727    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0652505  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1875  excinuclease ABC subunit B  56.93 
 
 
671 aa  756    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0099  excinuclease ABC subunit B  59.03 
 
 
667 aa  777    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5538  excinuclease ABC subunit B  55.03 
 
 
707 aa  740    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0391  excinuclease ABC subunit B  55.82 
 
 
695 aa  744    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.301443  normal  0.603789 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0077  excinuclease ABC subunit B  55.79 
 
 
679 aa  754    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.5939  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0314  excinuclease ABC subunit B  54.63 
 
 
681 aa  735    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0080  excinuclease ABC subunit B  55.88 
 
 
702 aa  763    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.935466  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3219  excinuclease ABC subunit B  59.91 
 
 
665 aa  796    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0533109  hitchhiker  0.000839421 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2096  excinuclease ABC subunit B  58.1 
 
 
682 aa  778    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.587064  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1754  excinuclease ABC subunit B  55.52 
 
 
678 aa  767    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5396  excinuclease ABC subunit B  61.83 
 
 
658 aa  830    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1741  excinuclease ABC subunit B  53.56 
 
 
679 aa  746    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0563  excinuclease ABC subunit B  58.31 
 
 
666 aa  776    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.733421  normal  0.043063 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1361  excinuclease ABC subunit B  56.15 
 
 
695 aa  754    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1133  excinuclease ABC subunit B  54.83 
 
 
733 aa  733    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0668171  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0251  excinuclease ABC subunit B  65.6 
 
 
663 aa  865    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2036  excinuclease ABC subunit B  56.1 
 
 
696 aa  749    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1275  excinuclease ABC subunit B  57.81 
 
 
699 aa  778    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.668  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1626  excinuclease ABC subunit B  57.83 
 
 
714 aa  774    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2175  excinuclease ABC subunit B  56.84 
 
 
710 aa  748    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00395254  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1753  excinuclease ABC subunit B  56.84 
 
 
666 aa  777    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1320  excinuclease ABC subunit B  56.44 
 
 
679 aa  768    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.350926  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2176  excinuclease ABC subunit B  56.32 
 
 
706 aa  750    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00882926  normal  0.14877 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3153  excinuclease ABC subunit B  55.56 
 
 
701 aa  751    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.414181 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1797  excinuclease ABC subunit B  54.65 
 
 
676 aa  733    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000373442  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2303  excinuclease ABC subunit B  55.26 
 
 
660 aa  743    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1833  excinuclease ABC subunit B  57.63 
 
 
676 aa  775    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0737  excinuclease ABC subunit B  54.61 
 
 
662 aa  743    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1019  excinuclease ABC subunit B  55.94 
 
 
697 aa  770    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.231406  normal  0.390908 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1782  excinuclease ABC subunit B  57.36 
 
 
662 aa  775    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.753339  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1890  excinuclease ABC subunit B  58.15 
 
 
676 aa  775    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.570377  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0275  excinuclease ABC subunit B  55.4 
 
 
728 aa  723    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.249968 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5867  excinuclease ABC subunit B  55.64 
 
 
707 aa  744    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3001  excinuclease ABC subunit B  56.22 
 
 
719 aa  772    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2021  excinuclease ABC subunit B  62.28 
 
 
625 aa  772    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.39565  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2963  excinuclease ABC subunit B  56.42 
 
 
669 aa  765    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000919416  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0008  excinuclease ABC subunit B  53.43 
 
 
673 aa  737    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.847114  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0300  excinuclease ABC subunit B  60.21 
 
 
659 aa  828    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0295  excinuclease ABC subunit B  60.37 
 
 
659 aa  832    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.837943  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1617  excinuclease ABC subunit B  56.35 
 
 
677 aa  754    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2678  excinuclease ABC subunit B  57.55 
 
 
677 aa  776    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.292307 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2061  excinuclease ABC subunit B  55.34 
 
 
673 aa  744    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000836148  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1914  excinuclease ABC subunit B  55.79 
 
 
673 aa  747    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00112158  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1088  excinuclease ABC subunit B  57.53 
 
 
675 aa  771    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0251  excinuclease ABC subunit B  60.06 
 
 
665 aa  804    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00546906  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2160  excinuclease ABC subunit B  53.05 
 
 
721 aa  726    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2248  excinuclease ABC subunit B  55.79 
 
 
696 aa  747    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23510  excinuclease ABC subunit B  56.93 
 
 
670 aa  764    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00672603 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0583  excinuclease ABC subunit B  58.19 
 
 
692 aa  811    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0372  excinuclease ABC subunit B  59.33 
 
 
673 aa  811    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1318  excinuclease ABC subunit B  58.37 
 
 
671 aa  808    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000791691  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0392  excinuclease ABC subunit B  59.51 
 
 
669 aa  819    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1457  excinuclease ABC subunit B  60.06 
 
 
668 aa  818    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.174778  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2070  excinuclease ABC subunit B  57.38 
 
 
693 aa  785    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.12882  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2210  excinuclease ABC subunit B  55.64 
 
 
707 aa  744    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0801  excinuclease ABC subunit B  58.64 
 
 
691 aa  782    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.177675 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0699  excinuclease ABC subunit B  56.14 
 
 
675 aa  763    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.301254  normal  0.648791 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2166  excinuclease ABC subunit B  55.34 
 
 
673 aa  741    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000274119  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1106  excinuclease ABC subunit B  57.98 
 
 
705 aa  782    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.442429  normal  0.317752 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3485  excinuclease ABC subunit B  56.15 
 
 
701 aa  777    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2024  excinuclease ABC subunit B  54.06 
 
 
685 aa  731    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00725134  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2837  excinuclease ABC subunit B  56.14 
 
 
706 aa  769    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1828  excinuclease ABC subunit B  56.02 
 
 
672 aa  749    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00277406  normal  0.439002 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3047  excinuclease ABC subunit B  56.22 
 
 
719 aa  772    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.741685 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1082  excinuclease ABC subunit B  55.74 
 
 
670 aa  740    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00208033  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3350  excinuclease ABC subunit B  56.21 
 
 
722 aa  756    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0910729  normal  0.613367 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1033  excinuclease ABC subunit B  57.53 
 
 
685 aa  780    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.568445  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1529  excinuclease ABC subunit B  57.61 
 
 
677 aa  780    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.521978 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2441  excinuclease ABC subunit B  56.21 
 
 
696 aa  743    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.869915  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>