More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0315 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002950  PG0315  50S ribosomal protein L27  100 
 
 		 85 aa  169  9e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.385897 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0454  50S ribosomal protein L27  75.31 
 
 		 89 aa  130  5e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4883  ribosomal protein L27  75.61 
 
 		 92 aa  129  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.113157  normal  0.111687 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02725  50S ribosomal protein L27  75.31 
 
 		 86 aa  124  3e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1546  50S ribosomal protein L27  74.07 
 
 		 86 aa  122  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.653067  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1625  ribosomal protein L27  69.14 
 
 		 143 aa  121  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.388698 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2480  ribosomal protein L27  70.37 
 
 		 100 aa  118  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.782187  normal  0.22295 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3460  50S ribosomal protein L27  67.9 
 
 		 89 aa  118  3e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.159862  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0310  50S ribosomal protein L27  70.37 
 
 		 89 aa  117  3.9999999999999996e-26  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1466  50S ribosomal protein L27  69.14 
 
 		 86 aa  115  1.9999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.55318  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0643  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 84 aa  113  6.9999999999999995e-25  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.301948  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2046  ribosomal protein L27  62.65 
 
 		 90 aa  113  6.9999999999999995e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0108  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 		 87 aa  112  2.0000000000000002e-24  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1051  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.212456  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0417  50S ribosomal protein L27  65.43 
 
 		 91 aa  111  3e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.302693 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3006  50S ribosomal protein L27  67.9 
 
 		 89 aa  111  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.549132 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3196  50S ribosomal protein L27  67.06 
 
 		 85 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000840306  unclonable  7.875010000000001e-24 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1632  50S ribosomal protein L27  72.37 
 
 		 87 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.848306  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1849  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 89 aa  110  6e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1781  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 89 aa  110  6e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.810643  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3235  50S ribosomal protein L27  67.9 
 
 		 85 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000158281  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2006  ribosomal protein L27  62.79 
 
 		 86 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.962508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2143  50S ribosomal protein L27  64.2 
 
 		 90 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.672881 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4194  50S ribosomal protein L27  65.43 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3870  50S ribosomal protein L27  65.43 
 
 		 89 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.403314  normal  0.0137956 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0475  50S ribosomal protein L27  64.63 
 
 		 85 aa  108  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0828621  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4287  50S ribosomal protein L27  64.2 
 
 		 90 aa  108  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.835773  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0424  50S ribosomal protein L27  61.73 
 
 		 92 aa  108  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.85685  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3589  50S ribosomal protein L27  65.43 
 
 		 84 aa  108  3e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000197888  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0846  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 86 aa  108  3e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3207  ribosomal protein L27  65.85 
 
 		 85 aa  107  5e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3242  50S ribosomal protein L27  64.2 
 
 		 95 aa  107  5e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1537  50S ribosomal protein L27  61.73 
 
 		 85 aa  107  5e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4102  50S ribosomal protein L27  60.49 
 
 		 90 aa  107  5e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.500877 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0193  50S ribosomal protein L27  60.49 
 
 		 90 aa  107  8.000000000000001e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.451706 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3465  50S ribosomal protein L27  64.2 
 
 		 94 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.360708 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2854  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 86 aa  106  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000234792  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2582  50S ribosomal protein L27  64.29 
 
 		 84 aa  106  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.6027199999999998e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03730  50S ribosomal protein L27  65.88 
 
 		 85 aa  105  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00000322672  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2651  50S ribosomal protein L27  75 
 
 		 86 aa  105  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0231869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1415  50S ribosomal protein L27  62.96 
 
 		 85 aa  105  2e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0559  50S ribosomal protein L27  66.67 
 
 		 90 aa  105  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3282  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 91 aa  105  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0455195 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0647  50S ribosomal protein L27  62.96 
 
 		 89 aa  105  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.908873 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3448  50S ribosomal protein L27  73.61 
 
 		 87 aa  105  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0232252  hitchhiker  0.00744788 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0163  50S ribosomal protein L27  64.2 
 
 		 85 aa  104  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000390958  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3471  50S ribosomal protein L27  68.06 
 
 		 87 aa  105  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00282639  normal  0.386116 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1482  50S ribosomal protein L27  62.96 
 
 		 93 aa  104  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1009  50S ribosomal protein L27  67.07 
 
 		 85 aa  105  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000911893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2217  50S ribosomal protein L27  61.18 
 
 		 91 aa  105  3e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.856627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2115  50S ribosomal protein L27  65.48 
 
 		 95 aa  104  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000381623  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0146  50S ribosomal protein L27  64.2 
 
 		 85 aa  104  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1515  50S ribosomal protein L27  64.2 
 
 		 93 aa  104  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0090282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0508  50S ribosomal protein L27  72.22 
 
 		 87 aa  104  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.868007  normal  0.531544 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1611  50S ribosomal protein L27  65.43 
 
 		 97 aa  104  4e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000833239  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0552  50S ribosomal protein L27  65.43 
 
 		 87 aa  103  6e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000367957  normal  0.045539 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3667  50S ribosomal protein L27  65.43 
 
 		 87 aa  103  6e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000345306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0510  50S ribosomal protein L27  65.43 
 
 		 87 aa  103  6e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0309377  normal  0.755964 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2237  ribosomal protein L27  62.96 
 
 		 91 aa  103  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.140821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0100  50S ribosomal protein L27  65.43 
 
 		 87 aa  103  6e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00352754  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0485  50S ribosomal protein L27  65.43 
 
 		 87 aa  103  6e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0162621  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0582  50S ribosomal protein L27  65.43 
 
 		 87 aa  103  6e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00040366  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0090  50S ribosomal protein L27  60.49 
 
 		 84 aa  103  7e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0327893  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00801  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 		 85 aa  103  7e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0099  50S ribosomal protein L27  60.49 
 
 		 84 aa  103  7e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0130  50S ribosomal protein L27  60.49 
 
 		 84 aa  103  7e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0162  50S ribosomal protein L27  67.9 
 
 		 92 aa  103  7e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000470304  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001672  LSU ribosomal protein L27p  64.71 
 
 		 85 aa  103  7e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000226464  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0362  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 		 85 aa  103  9e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000249852  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2801  50S ribosomal protein L27  65.43 
 
 		 87 aa  103  9e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000884705  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0865  50S ribosomal protein L27  67.09 
 
 		 87 aa  102  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.437144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4211  50S ribosomal protein L27  62.96 
 
 		 93 aa  102  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.121619 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0348  50S ribosomal protein L27  61.73 
 
 		 84 aa  102  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000453633  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0526  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 		 85 aa  102  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0856  50S ribosomal protein L27  64.63 
 
 		 86 aa  102  1e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.701213  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3681  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4724  50S ribosomal protein L27  61.73 
 
 		 88 aa  102  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0668122  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40780  50S ribosomal protein L27  64.63 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4334  50S ribosomal protein L27  61.73 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3651  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1070  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000153229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1037  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000911721  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4312  50S ribosomal protein L27  61.73 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3478  ribosomal protein L27  63.53 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000653762  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0980  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000110997  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1322  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 93 aa  102  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202247  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3322  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000182867  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4181  50S ribosomal protein L27  61.73 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.186505  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0305  50S ribosomal protein L27  61.73 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000393871  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15461  50S ribosomal protein L27  71.01 
 
 		 86 aa  102  2e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.120914  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3892  50S ribosomal protein L27  61.45 
 
 		 89 aa  102  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.624543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2926  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000309766  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0968  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000160226  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0269  50S ribosomal protein L27  62.2 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.876975  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3737  50S ribosomal protein L27  64.71 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000346028  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3088  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60450  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0112062 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3218  50S ribosomal protein L27  63.1 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2828  50S ribosomal protein L27  65.06 
 
 		 84 aa  102  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000113295  normal  0.198807 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5207  50S ribosomal protein L27  65.85 
 
 		 85 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.121929  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>