More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0086 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0086  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  100 
 
 
604 aa  1241  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.389821 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3093  DEAD/DEAH box helicase domain protein  52.67 
 
 
581 aa  571  1e-161  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0434047 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0467  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.73 
 
 
584 aa  560  1e-158  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0666  DEAD/DEAH box helicase domain protein  49.64 
 
 
625 aa  559  1e-158  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.477317  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2402  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.72 
 
 
634 aa  547  1e-154  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.208521  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08811  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family protein  47.13 
 
 
623 aa  499  1e-140  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.490393  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4969  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.76 
 
 
584 aa  404  1e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.465149  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1472  DEAD/DEAH box helicase domain protein  42.05 
 
 
541 aa  400  1e-110  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  4.40496e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3118  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.88 
 
 
530 aa  393  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1182  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.25 
 
 
541 aa  390  1e-107  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00431867  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0145  ATP-dependent RNA helicase  38.59 
 
 
579 aa  387  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.432053  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05480  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.78 
 
 
527 aa  387  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  4.71221e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0423  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.36 
 
 
550 aa  386  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.109819  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1921  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.94 
 
 
532 aa  385  1e-105  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000118371  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0456  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.35 
 
 
546 aa  382  1e-105  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.441946  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3818  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.9 
 
 
527 aa  383  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00215503  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1040  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40 
 
 
550 aa  380  1e-104  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1120  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.38 
 
 
530 aa  382  1e-104  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  3.41148e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1452  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.17 
 
 
546 aa  382  1e-104  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.661924  normal  0.15207 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1629  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.64 
 
 
538 aa  379  1e-104  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.343673  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2125  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.23 
 
 
531 aa  376  1e-103  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2009  DEAD/DEAH box helicase-like  38.26 
 
 
574 aa  376  1e-103  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03693  ATP-dependent RNA helicase  39.21 
 
 
589 aa  377  1e-103  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0202  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.65 
 
 
590 aa  373  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.940477  normal  0.073291 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1225  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.2 
 
 
646 aa  372  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.115574 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2488  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.06 
 
 
565 aa  372  1e-101  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000211561  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0079  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  40.73 
 
 
532 aa  372  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0522  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.68 
 
 
562 aa  372  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1397  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.04 
 
 
533 aa  369  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.796672  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2267  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.57 
 
 
561 aa  371  1e-101  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0152  DEAD/DEAH box helicase-like  38.21 
 
 
572 aa  367  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2473  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.98 
 
 
530 aa  365  1e-99  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3104  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.23 
 
 
539 aa  365  2e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  9.55018e-07  normal  0.89853 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1365  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.16 
 
 
529 aa  364  3e-99  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0234  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  46.08 
 
 
511 aa  363  7e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0368  ATP-independent RNA helicase  38.42 
 
 
561 aa  361  2e-98  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1725  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.83 
 
 
595 aa  361  2e-98  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18210  DNA/RNA helicase, superfamily II  44.7 
 
 
614 aa  360  3e-98  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.461192  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1389  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  38.43 
 
 
528 aa  360  6e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  6.67125e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1650  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  38.43 
 
 
528 aa  360  6e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  1.09109e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0225  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45.82 
 
 
538 aa  360  6e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0722  DEAD/DEAH box helicase domain protein  36.31 
 
 
607 aa  359  7e-98  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.017054  normal  0.720031 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0948  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.77 
 
 
530 aa  358  1e-97  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0636  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.1 
 
 
571 aa  358  1e-97  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0067613  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0206  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.84 
 
 
466 aa  358  1e-97  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00471201  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5063  DEAD/DEAH box helicase  46.02 
 
 
529 aa  358  1e-97  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0262  DEAD/DEAH box helicase  46.08 
 
 
533 aa  358  2e-97  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0219  DEAD/DEAH box helicase  46.08 
 
 
528 aa  358  2e-97  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0221  DEAD/DEAH box helicase  46.08 
 
 
528 aa  358  2e-97  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.983114  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0259  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  46.08 
 
 
528 aa  358  2e-97  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0233  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  46.08 
 
 
528 aa  358  2e-97  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.714358  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0247  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  46.08 
 
 
528 aa  358  2e-97  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0281  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  46.08 
 
 
525 aa  358  2e-97  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0267  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  46.08 
 
 
525 aa  358  2e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1087  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.84 
 
 
467 aa  357  3e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04825  ATP-dependent RNA helicase  36.54 
 
 
614 aa  357  3e-97  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0531  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.08 
 
 
599 aa  357  3e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1897  ATP-dependent RNA helicase  38.16 
 
 
530 aa  357  4e-97  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0589  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family  45.62 
 
 
617 aa  356  7e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.159875  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0741  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.62 
 
 
617 aa  356  7e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  3.24399e-05  unclonable  8.03743e-11 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1893  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.84 
 
 
581 aa  355  1e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0980839  normal  0.349593 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1440  helicase, C-terminal:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  37.94 
 
 
562 aa  353  4e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.706802  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0220  ATP-dependent RNA helicase  35.5 
 
 
609 aa  353  5e-96  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.986223  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4601  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  45 
 
 
589 aa  353  7e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0191  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.5 
 
 
609 aa  353  7e-96  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1854  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.97 
 
 
610 aa  353  7e-96  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0371  hypothetical protein  37.09 
 
 
656 aa  352  8e-96  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2378  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  44.86 
 
 
632 aa  352  1e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.856742  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0636  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  35.34 
 
 
605 aa  352  1e-95  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0593463 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0097  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.96 
 
 
602 aa  351  2e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0250  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.84 
 
 
643 aa  351  2e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.173354  decreased coverage  0.00154512 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1774  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.21 
 
 
589 aa  351  2e-95  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4029  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.91 
 
 
610 aa  351  2e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00643169 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09353  ATP-dependent RNA helicase, DEAD/DEAH box family protein  48.07 
 
 
372 aa  350  3e-95  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.170333  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0587  DEAD/DEAH box helicase-like  44.59 
 
 
590 aa  350  4e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.795312  normal  0.95213 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28600  DNA/RNA helicase, superfamily II  37.84 
 
 
570 aa  350  5e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.219312 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14060  DNA/RNA helicase, superfamily II  38.03 
 
 
669 aa  350  5e-95  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17560  DNA/RNA helicase, superfamily II  35.69 
 
 
731 aa  349  8e-95  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0588083  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1118  helicase, C-terminal:DbpA, RNA-binding:DEAD/DEAH box helicase, N-terminal  41.75 
 
 
606 aa  349  8e-95  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.892999  normal  0.51461 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3714  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  34.54 
 
 
634 aa  349  8e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00250632  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1927  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.45 
 
 
594 aa  349  9e-95  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.118281  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3048  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  36.23 
 
 
747 aa  348  1e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1259  DEAD/DEAH box helicase domain protein  34.6 
 
 
608 aa  348  1e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3317  DEAD/DEAH box helicase-like protein  35.62 
 
 
611 aa  348  1e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.289713  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0706  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.23 
 
 
543 aa  348  2e-94  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0512  ATP-dependent RNA helicase DeaD  36.27 
 
 
637 aa  345  1e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.782929 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1760  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  38.14 
 
 
527 aa  345  1e-93  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0924  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.68 
 
 
599 aa  345  1e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1116  DEAD/DEAH box helicase-like  44.42 
 
 
640 aa  345  1e-93  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0838  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  37.87 
 
 
514 aa  345  1e-93  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3034  ATP-dependent RNA helicase DeaD  45.87 
 
 
595 aa  345  1e-93  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  4.7314e-06  decreased coverage  1.37402e-06 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3590  ATP-dependent RNA helicase DeaD  44.44 
 
 
664 aa  344  2e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4001  ATP-dependent RNA helicase DeaD  44.44 
 
 
664 aa  344  2e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1046  DEAD/DEAH box helicase domain protein  35.55 
 
 
627 aa  344  2e-93  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.835563  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2250  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  39.34 
 
 
574 aa  344  3e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.460178  normal  0.714612 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3724  ATP-dependent RNA helicase DeaD  44.44 
 
 
664 aa  343  4e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0495  ATP-dependent RNA helicase DeaD  43.56 
 
 
653 aa  343  4e-93  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.148315  normal  0.959969 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3389  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.52 
 
 
590 aa  343  5e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0812  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45 
 
 
591 aa  343  7e-93  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_09651  putative ATP-dependent RNA helicase  36.62 
 
 
636 aa  343  8e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>