165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3329 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3329  protein of unknown function YGGT  100 
 
 
98 aa  189  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2521  protein of unknown function YGGT  64.29 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3585  protein of unknown function YGGT  64.29 
 
 
91 aa  94.7  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0833218  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15401  hypothetical protein  55.42 
 
 
99 aa  90.5  7e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.393994 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09511  hypothetical protein  57.5 
 
 
92 aa  90.1  8e-18  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.545335  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0890  hypothetical protein  57.5 
 
 
92 aa  90.1  8e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09931  hypothetical protein  59.49 
 
 
92 aa  90.1  9e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1433  hypothetical protein  53.75 
 
 
98 aa  90.1  1e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.116879 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3109  hypothetical protein  61.33 
 
 
92 aa  88.6  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.264306  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09491  hypothetical protein  56.25 
 
 
92 aa  87.8  5e-17  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.291422  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0994  hypothetical protein  60.53 
 
 
92 aa  86.7  9e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0252519  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08491  integral membrane protein  52.87 
 
 
102 aa  85.1  3e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.321113  hitchhiker  0.00153658 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2189  protein of unknown function YGGT  48.91 
 
 
96 aa  83.2  1e-15  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.318304  normal  0.111036 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4335  protein of unknown function YGGT  54.55 
 
 
97 aa  82.4  2e-15  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.680603  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09691  hypothetical protein  47.78 
 
 
100 aa  80.9  6e-15  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0755134  normal  0.205345 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0297  hypothetical protein  47.78 
 
 
100 aa  80.9  6e-15  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.475908  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_36034  predicted protein  53.66 
 
 
237 aa  76.6  1e-13  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.119025  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0477  hypothetical protein  51.14 
 
 
99 aa  75.1  3e-13  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1066  hypothetical protein  51.25 
 
 
98 aa  74.3  5e-13  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0714  protein of unknown function YGGT  50.7 
 
 
84 aa  69.7  1e-11  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.674624  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1411  protein of unknown function YGGT  49.23 
 
 
84 aa  68.2  4e-11  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  7.59704e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1085  protein of unknown function YGGT  40 
 
 
87 aa  67  7e-11  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  1.50484e-08  normal 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_10630  predicted protein  53.97 
 
 
76 aa  66.2  1e-10  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1036  protein of unknown function YGGT  46.99 
 
 
89 aa  63.2  1e-09  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  1.19033e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1906  protein of unknown function YGGT  47.3 
 
 
90 aa  62.4  2e-09  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2547  protein of unknown function YGGT  52.38 
 
 
87 aa  59.7  1e-08  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.167983  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3725  protein of unknown function YGGT  46.58 
 
 
87 aa  58.9  2e-08  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00556578  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_41246  predicted protein  43.86 
 
 
91 aa  58.2  3e-08  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0509332  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2082  protein of unknown function YGGT  40.51 
 
 
86 aa  58.2  4e-08  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0261764  hitchhiker  9.96106e-13 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4037  hypothetical protein  50 
 
 
87 aa  55.8  2e-07  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000926366  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3912  ylmG protein  50 
 
 
87 aa  55.8  2e-07  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.38636e-11 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3749  ylmG protein  50 
 
 
87 aa  55.8  2e-07  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0442014  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3950  ylmG protein  50 
 
 
87 aa  55.8  2e-07  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  3.61919e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3640  hypothetical protein  50 
 
 
87 aa  55.8  2e-07  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.38235e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3657  hypothetical protein  50 
 
 
87 aa  55.8  2e-07  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.516535  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1490  cell division membrane protein  42.67 
 
 
87 aa  55.1  3e-07  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3943  ylmG protein  50 
 
 
87 aa  55.1  3e-07  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00794391  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3999  ylmG protein  54.24 
 
 
87 aa  55.5  3e-07  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000449706  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5048  YGGT family protein  39.74 
 
 
196 aa  54.7  4e-07  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.710638  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0475  hypothetical protein  39.74 
 
 
196 aa  54.7  4e-07  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1242  ylmG protein  45.21 
 
 
87 aa  55.1  4e-07  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000199997  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3655  protein of unknown function YGGT  35.56 
 
 
199 aa  53.5  8e-07  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1981  protein of unknown function YGGT  39.29 
 
 
87 aa  53.5  8e-07  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  8.63861e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0493  protein of unknown function YGGT  33.77 
 
 
92 aa  52.8  1e-06  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.197871  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1018  protein of unknown function YGGT  36.49 
 
 
85 aa  52.8  2e-06  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08930  YGGT family protein  38.27 
 
 
84 aa  52.4  2e-06  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.384516  hitchhiker  2.51444e-08 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09420  YGGT family protein  39.13 
 
 
86 aa  52.4  2e-06  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0374287  normal  0.111305 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1166  protein of unknown function YGGT  34.18 
 
 
105 aa  51.6  3e-06  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  8.66748e-08  hitchhiker  0.00575832 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1165  protein of unknown function YGGT  35.62 
 
 
105 aa  52  3e-06  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  8.35508e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5321  hypothetical protein  39.74 
 
 
196 aa  51.6  3e-06  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05130  hypothetical protein  37.18 
 
 
197 aa  51.6  3e-06  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.409368  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0492  hypothetical protein  37.18 
 
 
197 aa  51.2  4e-06  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0866  YGGT family protein  38.36 
 
 
104 aa  51.2  4e-06  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1481  protein of unknown function YGGT  35.71 
 
 
94 aa  50.8  5e-06  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0271  hypothetical protein  38.82 
 
 
96 aa  50.8  6e-06  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2479  protein of unknown function YGGT  45.59 
 
 
182 aa  50.4  7e-06  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.619107  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0956  protein of unknown function YGGT  36.92 
 
 
89 aa  50.8  7e-06  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00321355  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2689  protein of unknown function YGGT  45.45 
 
 
182 aa  49.7  1e-05  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.885228  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0508  protein of unknown function YGGT  38.96 
 
 
96 aa  50.1  1e-05  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.842199  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03060  hypothetical protein  35.9 
 
 
197 aa  49.7  1e-05  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0479202  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3355  hypothetical protein  45.59 
 
 
182 aa  49.3  2e-05  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1191  protein of unknown function YGGT  45.59 
 
 
182 aa  49.3  2e-05  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0253033  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4152  protein of unknown function YGGT  35.53 
 
 
197 aa  49.3  2e-05  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.762639 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1192  protein of unknown function YGGT  45.59 
 
 
182 aa  49.3  2e-05  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0499744  normal  0.653735 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0861  hypothetical protein  40.58 
 
 
88 aa  48.9  2e-05  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00343102  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2684  protein of unknown function YGGT  42.65 
 
 
184 aa  48.5  3e-05  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  4.26882e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0989  protein of unknown function YGGT  35.53 
 
 
114 aa  48.1  4e-05  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0933  protein of unknown function YGGT  38.57 
 
 
85 aa  48.1  4e-05  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0945487  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1262  protein of unknown function YGGT  44.12 
 
 
182 aa  48.1  4e-05  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0091593  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0020  protein of unknown function YGGT  34.29 
 
 
94 aa  47.4  6e-05  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.310945  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00691  hypothetical protein  34.85 
 
 
102 aa  47.4  7e-05  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.82447 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1336  protein of unknown function YGGT  42.42 
 
 
182 aa  47  8e-05  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000680586  hitchhiker  2.19253e-05 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1230  protein of unknown function YGGT  41.18 
 
 
182 aa  47  8e-05  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  8.25612e-07  normal  0.409234 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3042  protein of unknown function YGGT  42.42 
 
 
182 aa  47  8e-05  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  2.45532e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3185  protein of unknown function YGGT  42.42 
 
 
182 aa  47  8e-05  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  4.91839e-05  normal  0.0847291 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3027  protein of unknown function YGGT  42.42 
 
 
182 aa  47  9e-05  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  5.0243e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1199  cell division membrane protein  29.35 
 
 
98 aa  47  9e-05  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0053  protein of unknown function YGGT  55.56 
 
 
99 aa  46.6  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.941254 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0415  protein of unknown function YGGT  32.93 
 
 
107 aa  46.2  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  3.37721e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2017  hypothetical protein  36.49 
 
 
97 aa  46.6  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.314161 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3113  protein of unknown function YGGT  37.88 
 
 
187 aa  47  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.143528  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3527  hypothetical protein  38.57 
 
 
99 aa  46.2  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.12787  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1522  hypothetical protein  40 
 
 
187 aa  46.2  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0153866  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0369  protein of unknown function YGGT  35.37 
 
 
196 aa  47  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.758714  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0880  hypothetical protein  37.88 
 
 
187 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.123554  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2449  protein of unknown function YGGT  38.96 
 
 
187 aa  45.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.550896  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4761  protein of unknown function YGGT  44 
 
 
106 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.211635 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4969  protein of unknown function YGGT  34.15 
 
 
196 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0057  protein of unknown function YGGT  37.66 
 
 
96 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5146  protein of unknown function YGGT  34.15 
 
 
196 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.605809  normal  0.987937 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2862  protein of unknown function YGGT  37.88 
 
 
182 aa  45.4  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0177844  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4049  protein of unknown function YGGT  40.26 
 
 
187 aa  45.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0807  protein of unknown function YGGT  40 
 
 
187 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.968375  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0910  protein of unknown function YGGT  38.96 
 
 
187 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0339  protein of unknown function YGGT  29.85 
 
 
192 aa  45.4  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0948  protein of unknown function YGGT  38.96 
 
 
187 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.199708  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5096  hypothetical protein  32.93 
 
 
196 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.109817  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0469  protein of unknown function YGGT  38.96 
 
 
187 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0818  protein of unknown function YGGT  40 
 
 
187 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03211  hypothetical protein  31.88 
 
 
119 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.97846 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>