More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2142 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2142  succinyldiaminopimelate transaminase  100 
 
 		 388 aa  807    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3869  succinyldiaminopimelate transaminase  72.94 
 
 		 392 aa  599  1e-170  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3918  succinyldiaminopimelate transaminase  72.42 
 
 		 392 aa  599  1e-170  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000686397  normal  0.381945 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0911  class I/II aminotransferase  71.32 
 
 		 400 aa  594  1e-169  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.638659  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0159  succinyldiaminopimelate transaminase  68.81 
 
 		 407 aa  583  1.0000000000000001e-165  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.899498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5101  succinyldiaminopimelate transaminase  69.33 
 
 		 390 aa  580  1e-164  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.26447 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0944  succinyldiaminopimelate transaminase  68.56 
 
 		 390 aa  571  1.0000000000000001e-162  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.989177  normal  0.168301 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1794  succinyldiaminopimelate transaminase  63.31 
 
 		 392 aa  515  1.0000000000000001e-145  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.455812  decreased coverage  0.0036927 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3098  aminotransferase class I and II  42.86 
 
 		 388 aa  352  8e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00347911  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1913  aminotransferase, class I and II  42.45 
 
 		 389 aa  350  2e-95  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0045539  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3010  aminotransferase class I and II  45.48 
 
 		 388 aa  349  5e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0774933 
 
 
-
 
NC_002936  DET0739  LL-diaminopimelate aminotransferase  43.41 
 
 		 388 aa  347  2e-94  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_646  class I/II aminotransferase  42.64 
 
 		 390 aa  345  1e-93  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.552452  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2605  LL-diaminopimelate aminotransferase  43.31 
 
 		 385 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.121492  normal  0.427052 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1915  aminotransferase, class I and II  42.78 
 
 		 382 aa  342  8e-93  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2943  aminotransferase, class I and II  42.04 
 
 		 382 aa  341  1e-92  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00452348  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0669  LL-diaminopimelate aminotransferase  41.86 
 
 		 388 aa  340  2e-92  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000400869  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0361  LL-diaminopimelate aminotransferase  39.9 
 
 		 389 aa  339  5e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0125788 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1431  LL-diaminopimelate aminotransferase  41.45 
 
 		 388 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.379208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0633  aminotransferase  41.73 
 
 		 384 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1758  aminotransferase, class I and II  43.64 
 
 		 391 aa  335  7.999999999999999e-91  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.125179 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0037  aminotransferase class I and II  41.67 
 
 		 382 aa  332  6e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1970  LL-diaminopimelate aminotransferase  40.78 
 
 		 388 aa  328  8e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0420706  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1446  aminotransferase  41.51 
 
 		 411 aa  325  6e-88  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1334  aminotransferase  41.51 
 
 		 411 aa  325  6e-88  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2726  aminotransferase  41.51 
 
 		 411 aa  325  6e-88  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11560  LL-diaminopimelate aminotransferase  39.12 
 
 		 389 aa  325  7e-88  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1013  LL-diaminopimelate aminotransferase  40.94 
 
 		 385 aa  324  2e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3401  aminotransferase  41.25 
 
 		 411 aa  324  2e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.313714  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3182  aminotransferase class I and II  45.41 
 
 		 384 aa  322  9.000000000000001e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0525687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2096  aminotransferase, class I and II  40.16 
 
 		 382 aa  322  9.999999999999999e-87  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.875672  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23430  Aminotransferase, class I and II  40.73 
 
 		 414 aa  320  1.9999999999999998e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1987  aspartate aminotransferase  40.1 
 
 		 399 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4334  aminotransferase  40.79 
 
 		 402 aa  320  3e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.095923  normal  0.699737 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3600  aspartate aminotransferase  41.99 
 
 		 391 aa  320  3e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.954111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62400  aminotransferase  40.99 
 
 		 411 aa  320  3e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0817  aminotransferase  41.05 
 
 		 402 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.241529  normal  0.324364 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4371  aminotransferase  41.05 
 
 		 402 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0054  aminotransferase, class I and II  40.94 
 
 		 388 aa  319  3.9999999999999996e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.848733 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0854  aminotransferase  41.05 
 
 		 402 aa  319  5e-86  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5058  aminotransferase, classes I and II  40.73 
 
 		 402 aa  318  7e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5431  aminotransferase  40.73 
 
 		 411 aa  318  7e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2583  aminotransferase  40.47 
 
 		 409 aa  318  7e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.117889  normal  0.0369649 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0468  aminotransferase  40.73 
 
 		 402 aa  318  1e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2093  aminotransferase, class I and II  39.84 
 
 		 397 aa  318  1e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.474721  normal  0.0303336 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2916  aspartate aminotransferase  39.79 
 
 		 399 aa  317  2e-85  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2331  aspartate aminotransferase  39.79 
 
 		 399 aa  317  2e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000457199 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1466  aminotransferase  40.47 
 
 		 411 aa  317  2e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0840  aminotransferase  40.79 
 
 		 402 aa  317  2e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.450019  normal  0.811052 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0017  aspartate aminotransferase  40.68 
 
 		 403 aa  317  3e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2531  aminotransferase  40.47 
 
 		 412 aa  316  4e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1407  aminotransferase  39.69 
 
 		 413 aa  315  6e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1295  aminotransferase  40.47 
 
 		 407 aa  315  8e-85  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2455  aminotransferase  41.32 
 
 		 393 aa  315  9e-85  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02289  hypothetical protein  40.21 
 
 		 412 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.695528  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1278  aminotransferase class I and II  40.21 
 
 		 412 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2516  aminotransferase  40.21 
 
 		 412 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4268  aminotransferase  41.51 
 
 		 418 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.835771  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02250  hypothetical protein  40.21 
 
 		 412 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.550748  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3611  aminotransferase  40.41 
 
 		 412 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.890867 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2668  aminotransferase  40.21 
 
 		 412 aa  313  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1023  aspartate aminotransferase  40.79 
 
 		 392 aa  314  1.9999999999999998e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2948  aspartate aminotransferase  39.27 
 
 		 399 aa  313  2.9999999999999996e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00498644  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0487  LL-diaminopimelate aminotransferase  41.45 
 
 		 387 aa  313  2.9999999999999996e-84  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2866  aminotransferase  39.95 
 
 		 413 aa  313  2.9999999999999996e-84  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.847477  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2627  aspartate aminotransferase  39.53 
 
 		 400 aa  313  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1774  aminotransferase  41.62 
 
 		 396 aa  313  4.999999999999999e-84  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.472622  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1290  aminotransferase  39.95 
 
 		 412 aa  312  6.999999999999999e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2650  aspartate aminotransferase  39.27 
 
 		 400 aa  311  1e-83  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.036454  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4201  aminotransferase  41.25 
 
 		 405 aa  311  1e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1381  LL-diaminopimelate aminotransferase  40.21 
 
 		 391 aa  311  1e-83  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.704356  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1695  LL-diaminopimelate aminotransferase  38.7 
 
 		 392 aa  311  1e-83  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.126823  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2748  aminotransferase  39.95 
 
 		 412 aa  311  2e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2593  aminotransferase  40.47 
 
 		 412 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2634  aminotransferase  40.47 
 
 		 412 aa  311  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1277  LL-diaminopimelate aminotransferase  41.56 
 
 		 390 aa  311  2e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.306005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2730  aminotransferase  38.28 
 
 		 394 aa  311  2e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2545  aminotransferase  40.47 
 
 		 412 aa  311  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2659  aminotransferase  40.47 
 
 		 412 aa  311  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0150191 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2918  aminotransferase  40.79 
 
 		 411 aa  310  2e-83  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.116672 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2764  aminotransferase  40.47 
 
 		 412 aa  311  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2238  aspartate aminotransferase  41.15 
 
 		 394 aa  311  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2938  aspartate aminotransferase  39.01 
 
 		 399 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00063979  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2705  aspartate aminotransferase  39.58 
 
 		 399 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00685194  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2292  aspartate aminotransferase  40.89 
 
 		 394 aa  309  4e-83  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.088512  normal  0.0360985 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1272  aminotransferase class I and II  40.31 
 
 		 386 aa  309  5.9999999999999995e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2901  aspartate aminotransferase  39.01 
 
 		 399 aa  308  8e-83  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000246294 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2700  aspartate aminotransferase  39.01 
 
 		 400 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.546945  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1411  aminotransferase class I and II  39.84 
 
 		 394 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.80446 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2592  aspartate aminotransferase  39.9 
 
 		 394 aa  308  1.0000000000000001e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2899  aspartate aminotransferase  39.01 
 
 		 399 aa  308  1.0000000000000001e-82  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1410  aminotransferase  40.73 
 
 		 403 aa  308  1.0000000000000001e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3357  class I/II aminotransferase  38.68 
 
 		 402 aa  307  2.0000000000000002e-82  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.676088  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1282  aminotransferase class I and II  39.69 
 
 		 409 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.888913  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0849  transaminase  40 
 
 		 390 aa  308  2.0000000000000002e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000011377  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4019  aspartate aminotransferase  39.63 
 
 		 400 aa  306  5.0000000000000004e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.199022 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0082  aminotransferase  40.73 
 
 		 428 aa  306  6e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0510162 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0472  aminotransferase, class I/II  39.9 
 
 		 393 aa  305  8.000000000000001e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0632  aminotransferase class I and II  39.9 
 
 		 393 aa  305  8.000000000000001e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1219  aminotransferase, class I and II  38.48 
 
 		 395 aa  303  3.0000000000000004e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000967263  normal  0.143983 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>