More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0240 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0389  sodium/panthothenate symporter  77.69 
 
 		 484 aa  742    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00229851  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03116  sodium/panthothenate symporter  76.58 
 
 		 483 aa  718    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.735141  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0448  sodium/pantothenate symporter  76.58 
 
 		 483 aa  718    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.293948  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3742  sodium/panthothenate symporter  76.58 
 
 		 483 aa  718    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000150129  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3573  sodium/panthothenate symporter  75.93 
 
 		 483 aa  709    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0131777  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3574  sodium/panthothenate symporter  75.93 
 
 		 483 aa  709    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4420  sodium/panthothenate symporter  82.84 
 
 		 481 aa  766    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0607009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1209  sodium/panthothenate symporter  77.69 
 
 		 484 aa  742    Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00169799  normal  0.818802 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3450  sodium/panthothenate symporter  76.58 
 
 		 483 aa  718    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000724112  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3844  sodium/panthothenate symporter  85.62 
 
 		 483 aa  791    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.325661  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3553  sodium/panthothenate symporter  76.16 
 
 		 483 aa  730    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000280994  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3686  sodium/panthothenate symporter  82.99 
 
 		 483 aa  768    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.925299  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03067  hypothetical protein  76.58 
 
 		 483 aa  718    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.647307  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0244  sodium/panthothenate symporter  99.38 
 
 		 483 aa  943    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3696  sodium/panthothenate symporter  77.04 
 
 		 483 aa  743    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4575  sodium/panthothenate symporter  76.58 
 
 		 483 aa  718    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000690231  normal  0.130163 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3680  sodium/panthothenate symporter  76.14 
 
 		 483 aa  710    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.433126 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3641  sodium/panthothenate symporter  76.58 
 
 		 483 aa  719    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000698464  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0448  sodium/panthothenate symporter  76.58 
 
 		 483 aa  718    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.024979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3645  sodium/panthothenate symporter  75.93 
 
 		 483 aa  710    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060524 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3742  sodium/panthothenate symporter  76.14 
 
 		 483 aa  709    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.133198 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0455  sodium/panthothenate symporter  77.69 
 
 		 484 aa  742    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0240  sodium/panthothenate symporter  100 
 
 		 483 aa  946    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0567  sodium/panthothenate symporter  59.2 
 
 		 480 aa  545  1e-154  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.868181  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1379  sodium/panthothenate symporter  54.15 
 
 		 492 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0385274  normal  0.372154 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2874  sodium/panthothenate symporter  51.57 
 
 		 495 aa  456  1e-127  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3321  sodium/panthothenate symporter  50.42 
 
 		 494 aa  450  1e-125  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0552  sodium/pantothenate symporter  43.32 
 
 		 482 aa  419  1e-116  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2541  sodium/pantothenate symporter  46.42 
 
 		 487 aa  416  9.999999999999999e-116  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000222476  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3567  sodium/panthothenate symporter  47.23 
 
 		 477 aa  414  1e-114  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1657  sodium/panthothenate symporter  47.02 
 
 		 477 aa  414  1e-114  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00343419 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3660  sodium/panthothenate symporter  46.81 
 
 		 477 aa  412  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3570  sodium/panthothenate symporter  46.81 
 
 		 477 aa  412  1e-114  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3346  sodium/panthothenate symporter  46.6 
 
 		 479 aa  410  1e-113  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000197319  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3311  sodium/panthothenate symporter  46.6 
 
 		 479 aa  410  1e-113  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0172387  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3261  sodium/panthothenate symporter  46.6 
 
 		 479 aa  410  1e-113  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0182263  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3607  sodium/panthothenate symporter  46.6 
 
 		 479 aa  410  1e-113  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.258245  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3255  sodium/panthothenate symporter  46.6 
 
 		 477 aa  409  1e-113  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.344037  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3560  sodium/panthothenate symporter  46.6 
 
 		 479 aa  410  1e-113  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000874922 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2227  sodium/panthothenate symporter  47.25 
 
 		 477 aa  399  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0585956  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1677  sodium/panthothenate symporter  43.83 
 
 		 479 aa  363  3e-99  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.874122  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2877  sodium/panthothenate symporter  43.24 
 
 		 481 aa  360  2e-98  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510653 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1714  sodium/panthothenate symporter  40.94 
 
 		 483 aa  354  2e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000601067 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1901  sodium/panthothenate symporter  38.38 
 
 		 512 aa  322  9.000000000000001e-87  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000150828 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04650  sodium/panthothenate symporter  37.61 
 
 		 496 aa  308  2.0000000000000002e-82  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00393427  hitchhiker  0.0000895838 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11200  sodium/panthothenate symporter  38.61 
 
 		 540 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.556211  normal  0.356279 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0844  sodium/panthothenate symporter  31.97 
 
 		 444 aa  227  5.0000000000000005e-58  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3191  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  32.68 
 
 		 504 aa  186  7e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.205305  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0457  sodium/proline symporter  26.19 
 
 		 492 aa  158  2e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1002  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  27.1 
 
 		 533 aa  153  5e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1113  SSS sodium solute transporter superfamily  28.22 
 
 		 529 aa  152  1e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00736856  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3090  Na+/solute symporter  27.33 
 
 		 508 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000664536  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3705  sodium/proline symporter family protein  27.8 
 
 		 492 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.338299  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3677  sodium/proline symporter family protein  27.59 
 
 		 492 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.289137  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3673  sodium/proline symporter family protein  27.59 
 
 		 492 aa  147  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.257529  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0468  Na+/solute symporter  26.64 
 
 		 528 aa  147  3e-34  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.280127  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3655  sodium/proline symporter family protein  27.8 
 
 		 492 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4055  sodium/proline symporter family protein  28.18 
 
 		 492 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000025968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1564  sodium/proline symporter family protein  27.37 
 
 		 492 aa  147  5e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.286578 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1242  sodium/proline symporter  26.53 
 
 		 491 aa  147  5e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3435  sodium/proline symporter family protein  27.59 
 
 		 493 aa  146  6e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3752  sodium/proline symporter family protein  27.37 
 
 		 492 aa  146  9e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3396  sodium/proline symporter  27.59 
 
 		 493 aa  146  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.435875  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3347  sodium/proline symporter  27.59 
 
 		 493 aa  146  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2308  sodium/proline symporter  27.42 
 
 		 492 aa  145  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.591948  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0364  sodium/proline symporter  26.01 
 
 		 493 aa  145  2e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2326  Na+/solute symporter  29.56 
 
 		 520 aa  144  3e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1706  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.64 
 
 		 533 aa  144  4e-33  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3331  sodium/proline symporter  27.55 
 
 		 487 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.825412  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0975  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.2 
 
 		 533 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07099  hypothetical protein  27.85 
 
 		 518 aa  142  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1675  sodium/proline permease  26.56 
 
 		 489 aa  140  3e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0971  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  26.42 
 
 		 533 aa  141  3e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1494  sodium/proline permease  26.56 
 
 		 489 aa  140  3.9999999999999997e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.858456  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1128  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  27.08 
 
 		 492 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000418657  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2686  sodium/proline symporter  27.63 
 
 		 486 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0529769  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1991  high affinity proline permease  28.23 
 
 		 512 aa  139  7.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1134  sodium/proline symporter; osmoregulated proline transporter  27.29 
 
 		 492 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000164333  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1314  sodium/proline symporter family protein  27.29 
 
 		 492 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.01893e-22 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1957  high affinity proline permease  28.23 
 
 		 512 aa  139  7.999999999999999e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1154  sodium/proline symporter family protein  27.08 
 
 		 492 aa  139  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000094389  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1415  SSS family Na(+)/proline symporter  27.61 
 
 		 499 aa  139  1e-31  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.631202 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1246  sodium/proline symporter family protein  27.08 
 
 		 492 aa  139  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000709794  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1326  Sodium/proline symporter  26.84 
 
 		 488 aa  139  1e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0529188  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1391  sodium/proline symporter family protein  27.08 
 
 		 492 aa  139  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000288563  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1440  proline permease  27.88 
 
 		 511 aa  138  2e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0406998  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1353  sodium/proline symporter family protein  26.87 
 
 		 492 aa  138  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000718577  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0036  Na+ symporter  27.87 
 
 		 537 aa  138  2e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.90526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1289  sodium/proline symporter family protein  26.87 
 
 		 492 aa  138  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000753427  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0882  Na+/solute symporter  25.75 
 
 		 500 aa  138  2e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.984718  normal  0.413071 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001019  proline/sodium symporter PutP  28.21 
 
 		 497 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.858432  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1961  sodium/proline symporter  27.27 
 
 		 482 aa  137  5e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0044995 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1854  sodium/proline permease  26.61 
 
 		 489 aa  137  6.0000000000000005e-31  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.794377  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2279  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  28.26 
 
 		 504 aa  135  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.257788  hitchhiker  0.0000218485 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2177  sodium/proline symporter  28.23 
 
 		 482 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000107736  normal  0.0804917 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1142  sodium/proline symporter  27.07 
 
 		 492 aa  134  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000269484  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1398  sodium/proline symporter  27.7 
 
 		 483 aa  134  3e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0934266  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1463  sodium/proline symporter  27.35 
 
 		 483 aa  133  6e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.169082  unclonable  0.0000343135 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1525  Na+/solute symporter  27.27 
 
 		 479 aa  133  6.999999999999999e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1576  Sodium/proline symporter  27.61 
 
 		 499 aa  133  7.999999999999999e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.84214  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>