97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_40850 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_40850  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  474  1e-133  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3465  hypothetical protein  94.07 
 
 		 236 aa  451  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.940841  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2531  phosphoglycerate mutase  72.46 
 
 		 232 aa  356  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.186608  normal  0.226457 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3115  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  69.49 
 
 		 236 aa  340  8e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.217101  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3923  phosphoglycerate mutase  62.71 
 
 		 236 aa  321  6e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.807091  normal  0.0493015 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1912  phosphoglycerate mutase  61.86 
 
 		 288 aa  317  9e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.210112  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3212  phosphoglycerate mutase  62.29 
 
 		 236 aa  314  9e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.719805 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3557  phosphoglycerate mutase  61.44 
 
 		 236 aa  313  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.370519  normal  0.395273 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2459  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  62.29 
 
 		 236 aa  304  7e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00611929  normal  0.037414 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2726  hypothetical protein  61.44 
 
 		 236 aa  299  2e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27570  fructose-2,6-bisphosphatase  60.43 
 
 		 238 aa  276  1e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1922  phosphoglycerate mutase  38.91 
 
 		 236 aa  167  9e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.165977  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5438  Phosphoglycerate mutase  41.84 
 
 		 230 aa  162  5.0000000000000005e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0736619 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0633  phosphoglycerate mutase  34.32 
 
 		 234 aa  143  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2217  phosphoglycerate mutase  39.46 
 
 		 235 aa  142  6e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2201  phosphoglycerate mutase  37.71 
 
 		 229 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.295745  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5077  phosphoglycerate mutase  35.56 
 
 		 236 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4443  phosphoglycerate mutase  36.4 
 
 		 224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.769879 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4339  phosphoglycerate mutase  35.32 
 
 		 224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5275  phosphoglycerate mutase  36.02 
 
 		 236 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5020  phosphoglycerate mutase  34.89 
 
 		 224 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.706116  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5840  phosphoglycerate mutase  34.89 
 
 		 224 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3851  phosphoglycerate mutase  34.67 
 
 		 223 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3124  Phosphoglycerate mutase  34.67 
 
 		 223 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0522  phosphoglycerate mutase family protein  33.9 
 
 		 229 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.848966  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3732  phosphoglycerate mutase  35.32 
 
 		 222 aa  125  6e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2514  phosphoglycerate mutase family protein  33.47 
 
 		 229 aa  124  9e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0407111  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0945  phosphoglycerate mutase family protein  33.47 
 
 		 229 aa  124  9e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0244  phosphoglycerate mutase family protein  33.47 
 
 		 229 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1427  phosphoglycerate mutase family protein  33.47 
 
 		 229 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1624  phosphoglycerate mutase family protein  33.47 
 
 		 229 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2652  phosphoglycerate mutase family protein  33.47 
 
 		 229 aa  124  1e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0280  phosphoglycerate mutase family protein  33.47 
 
 		 229 aa  124  1e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.852489  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3217  phosphoglycerate mutase  35.11 
 
 		 224 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2516  phosphoglycerate mutase  35.65 
 
 		 234 aa  124  2e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4560  phosphoglycerate mutase  37.86 
 
 		 223 aa  123  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2072  phosphoglycerate mutase  32.4 
 
 		 244 aa  121  7e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1791  Phosphoglycerate mutase  33.62 
 
 		 224 aa  121  9e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0396  phosphoglycerate mutase  34.47 
 
 		 222 aa  121  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.240142 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0365  phosphoglycerate mutase  34.33 
 
 		 224 aa  121  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.602447 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3612  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  33.91 
 
 		 224 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.40878  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3912  putative phosphoglycerate / bisphosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 224 aa  116  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.554732  normal  0.639977 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3039  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  33.19 
 
 		 224 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.192648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01060  Phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  34.2 
 
 		 222 aa  115  8.999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1187  phosphoglycerate mutase  30.16 
 
 		 250 aa  114  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.115538  normal  0.139993 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0591  phosphoglycerate mutase  32 
 
 		 227 aa  112  4.0000000000000004e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13480  fructose-2,6-bisphosphatase  33.47 
 
 		 220 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2859  phosphoglycerate mutase  31.91 
 
 		 224 aa  109  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4246  phosphoglycerate mutase  30.14 
 
 		 271 aa  108  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0470  phosphoglycerate mutase  30.34 
 
 		 244 aa  108  1e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5047  phosphoglycerate mutase  34.75 
 
 		 225 aa  106  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4713  Phosphoglycerate mutase  32.77 
 
 		 224 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.119868  decreased coverage  0.00406557 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3636  Phosphoglycerate mutase  32.77 
 
 		 224 aa  104  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1584  Phosphoglycerate mutase  35 
 
 		 211 aa  96.7  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0147945 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1811  phosphoglycerate mutase  29.66 
 
 		 225 aa  96.3  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0109  phosphoglycerate mutase  32.33 
 
 		 218 aa  85.5  7e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4516  Phosphoglycerate mutase  30.96 
 
 		 231 aa  74.3  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  29.79 
 
 		 237 aa  62  0.000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1250  phosphoglycerate mutase  28.07 
 
 		 209 aa  60.1  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000119558  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4970  phosphoglycerate mutase  29.65 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5058  phosphoglycerate mutase  29.65 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.639819  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5351  phosphoglycerate mutase  29.65 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1203  phosphoglycerate mutase  27.43 
 
 		 203 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1967  Phosphoglycerate mutase  26.48 
 
 		 447 aa  52.4  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  27.19 
 
 		 220 aa  51.6  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0074  Phosphoglycerate mutase  27.57 
 
 		 210 aa  49.7  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.107325  normal  0.82394 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2988  alpha-ribazole phosphatase  33.73 
 
 		 203 aa  48.5  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000161375  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  26.17 
 
 		 188 aa  47.4  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  26.94 
 
 		 225 aa  47  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0658  alpha-ribazole phosphatase  33.13 
 
 		 203 aa  46.2  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000037528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0251  phosphoglycerate mutase family protein  23.53 
 
 		 223 aa  46.2  0.0005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1599  phosphoglycerate mutase  26.32 
 
 		 223 aa  45.4  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0664  alpha-ribazole phosphatase  33.13 
 
 		 203 aa  45.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000732678  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00607  predicted alpha-ribazole-5'-P phosphatase  33.13 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000725652  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00596  hypothetical protein  33.13 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0000603804  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0727  alpha-ribazole phosphatase  33.13 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000487704  normal  0.192993 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0690  alpha-ribazole phosphatase  33.13 
 
 		 203 aa  45.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  27.13 
 
 		 223 aa  44.3  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1369  Phosphoglycerate mutase  31.37 
 
 		 238 aa  43.9  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.252939  hitchhiker  0.00300055 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2350  phosphoglycerate mutase  28.57 
 
 		 221 aa  43.9  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.111724 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0235  phosphoglyceromutase  34.44 
 
 		 211 aa  43.1  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  26.81 
 
 		 214 aa  43.1  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1520  phosphoglycerate mutase 1 family  32.95 
 
 		 212 aa  42.7  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1950  putative phosphoglycerate mutase protein  37.31 
 
 		 236 aa  42.7  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.101421 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  35.87 
 
 		 210 aa  42.4  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000110333  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3007  alpha-ribazole phosphatase  31.93 
 
 		 203 aa  42.4  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000150204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0291  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 		 236 aa  42  0.008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0246325  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1155  putative phosphoglycerate mutase  29.95 
 
 		 237 aa  42  0.009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0632256  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1461  phosphoglycerate mutase family protein  29.95 
 
 		 237 aa  42  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.861833  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0438  putative phosphoglycerate mutase  29.95 
 
 		 237 aa  42  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0713  putative phosphoglycerate mutase  29.95 
 
 		 237 aa  42  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.107866  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1324  phosphoglycerate mutase family protein  29.95 
 
 		 237 aa  42  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3372  phosphoglyceromutase  33.33 
 
 		 211 aa  41.6  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0528  phosphoglycerate mutase  25.58 
 
 		 216 aa  41.6  0.01  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3186  putative phosphoglycerate mutase  30.39 
 
 		 238 aa  41.6  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0803  alpha-ribazole phosphatase  31.93 
 
 		 202 aa  41.6  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00133737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0700  alpha-ribazole phosphatase  31.93 
 
 		 202 aa  41.6  0.01  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00606561  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>