More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0125 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0125  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  100 
 
 
277 aa  558  1e-158  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.249783 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2673  Rieske (2Fe-2S) oxidoreductase  34.75 
 
 
270 aa  142  9e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0895  hypothetical protein  30.77 
 
 
315 aa  112  6e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0773726  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0124  hypothetical protein  38.51 
 
 
171 aa  102  7e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.658752  normal  0.409828 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3428  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.5 
 
 
296 aa  97.4  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4533  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.1 
 
 
294 aa  95.1  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.441672  normal  0.86514 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1196  Rieske (2Fe-2S) domain protein  27.99 
 
 
289 aa  94.7  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4736  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  28.96 
 
 
293 aa  87.8  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4000  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.5 
 
 
322 aa  85.9  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.649548 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2871  Rieske (2Fe-2S) region  29.63 
 
 
292 aa  84.3  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0232  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.91 
 
 
303 aa  80.5  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0716  hypothetical protein  37.67 
 
 
185 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.158068  normal  0.475844 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0722  hypothetical protein  36.99 
 
 
185 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0736  hypothetical protein  36.99 
 
 
185 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.141568 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2118  hypothetical protein  39.29 
 
 
173 aa  71.6  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3979  hypothetical protein  39.16 
 
 
162 aa  72  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0513  Ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase-like protein  29.68 
 
 
303 aa  70.5  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0308  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.52 
 
 
102 aa  69.7  0.00000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.359094 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1482  Rieske (2Fe-2S) region  35.11 
 
 
110 aa  69.7  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2444  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.49 
 
 
117 aa  68.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.44307  normal  0.0794581 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2708  hypothetical protein  34.06 
 
 
173 aa  68.6  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4288  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.36 
 
 
105 aa  67  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2392  protein of unknown function DUF59  39.36 
 
 
238 aa  66.2  0.0000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2821  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.37 
 
 
106 aa  65.5  0.0000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.541392  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3214  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.58 
 
 
137 aa  64.7  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.18886 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2708  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  34.44 
 
 
107 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3220  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.68 
 
 
508 aa  64.7  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00102574 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1008  hypothetical protein  31.06 
 
 
189 aa  63.9  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4812  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.18 
 
 
304 aa  63.5  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2821  Rieske (2Fe-2S) region  36 
 
 
102 aa  63.5  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2693  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.44 
 
 
506 aa  62.8  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.563055  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2820  membrane protein-like protein  33.57 
 
 
175 aa  63.2  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1088  ferredoxin subunit of A ring-hydroxylating dioxygenase oxidoreductase protein  32.97 
 
 
103 aa  62.8  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.173698  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2153  hypothetical protein  34.25 
 
 
153 aa  62.8  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4131  Protein of unknown function DUF2231, transmembrane  33.09 
 
 
165 aa  62.4  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.159201 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1616  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.33 
 
 
101 aa  62.4  0.000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1428  hypothetical protein  31.79 
 
 
170 aa  62.4  0.000000008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.536406 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3175  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.07 
 
 
506 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0759164  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3778  Rieske (2Fe-2S) region  29.29 
 
 
101 aa  62  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0991  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  33.33 
 
 
103 aa  62  0.00000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.220686  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5941  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.83 
 
 
526 aa  61.6  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0987  Rieske 2Fe-2S family protein  35.44 
 
 
106 aa  60.8  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2541  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.97 
 
 
506 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0167  Rieske (2Fe-2S) region  32.97 
 
 
119 aa  60.8  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3908  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.21 
 
 
115 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0333  Rieske (2Fe-2S) protein  26.55 
 
 
298 aa  60.1  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2552  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.63 
 
 
116 aa  59.7  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2675  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.87 
 
 
506 aa  58.9  0.00000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.148641  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01479  dioxygenase, ferredoxin reductase component, putative  32.93 
 
 
559 aa  58.9  0.00000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0181  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.53 
 
 
509 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.529445  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7008  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.46 
 
 
527 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144463  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0969  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32 
 
 
101 aa  58.5  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0535859  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0662  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.51 
 
 
506 aa  58.5  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0819  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.2 
 
 
294 aa  57.4  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2790  hypothetical protein  30.94 
 
 
173 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.49529 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0271  putative dioxygenase ferredoxin subunit  29.9 
 
 
102 aa  57.8  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0940  putative Rieske (2Fe-2S) ferredoxin  35.37 
 
 
114 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1397  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.46 
 
 
509 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6432  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.46 
 
 
509 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5685  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  46.55 
 
 
353 aa  57  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0319041  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0396  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  33.67 
 
 
125 aa  57  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.7121  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5347  Rieske (2Fe-2S) domain protein  35.06 
 
 
105 aa  57  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.210101  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0570  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.25 
 
 
506 aa  57  0.0000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0198905  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0795  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.43 
 
 
105 aa  57  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1329  putative dioxygenase, ferredoxin reductase component  30.39 
 
 
521 aa  57  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0248077 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3347  Rieske (2Fe-2S) oxidoreductase  36.9 
 
 
102 aa  57  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6022  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  31.46 
 
 
509 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0194312 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2135  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30 
 
 
116 aa  57  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4332  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.34 
 
 
121 aa  57  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0502301  normal  0.233969 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0985  Rieske (2Fe-2S) region  38.1 
 
 
106 aa  56.6  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.750027  hitchhiker  0.00017635 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2486  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30.68 
 
 
112 aa  56.6  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.812063  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0893  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.33 
 
 
504 aa  56.2  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.6615 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4721  Rieske (2Fe-2S) region  32.91 
 
 
104 aa  56.2  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1739  Rieske (2Fe-2S) domain protein  30.53 
 
 
101 aa  55.8  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0173  Rieske (2Fe-2S) region  27.17 
 
 
104 aa  55.5  0.0000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2461  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.55 
 
 
104 aa  55.1  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.601158  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6409  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.36 
 
 
512 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0971185  normal  0.172531 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2671  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.58 
 
 
104 aa  55.1  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.506336  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2768  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30 
 
 
109 aa  55.5  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3462  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.36 
 
 
116 aa  55.1  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3478  hypothetical protein  30.6 
 
 
175 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1694  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.17 
 
 
105 aa  54.7  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2894  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.52 
 
 
118 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.519291 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1985  putative dioxygenase  33.71 
 
 
110 aa  54.7  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.51691  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0914  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.43 
 
 
518 aa  54.7  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0653376  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0616  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.18 
 
 
102 aa  54.3  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2734  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  30 
 
 
102 aa  54.3  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1488  hypothetical protein  27.74 
 
 
180 aa  54.3  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2226  Rieske (2Fe-2S) domain protein  33.71 
 
 
114 aa  54.7  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000457155  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1861  Rieske (2Fe-2S) domain protein  28.26 
 
 
105 aa  53.9  0.000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1503  naphthalene 1,2-dioxygenase system ferredoxin component  27.68 
 
 
105 aa  53.9  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1847  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.02 
 
 
118 aa  53.9  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000145916 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4231  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.21 
 
 
105 aa  53.9  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7057  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25 
 
 
104 aa  53.1  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.250016  normal  0.403256 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5285  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30 
 
 
521 aa  53.5  0.000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4364  hypothetical protein  35.66 
 
 
168 aa  53.1  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.801295  normal  0.025652 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2739  hypothetical protein  30.82 
 
 
189 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.504849 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1305  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  27.68 
 
 
105 aa  53.1  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.935545  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0970  naphthalene 1,2-dioxygenase system ferredoxin component  27.68 
 
 
105 aa  53.1  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0597  naphthalene 1,2-dioxygenase system ferredoxin component  27.68 
 
 
105 aa  53.1  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0893389  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>