More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3022 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2016  fumarate hydratase  71.92 
 
 		 463 aa  676    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6106  fumarate hydratase  67.54 
 
 		 474 aa  642    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1576  fumarate hydratase  70.78 
 
 		 482 aa  681    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0866386  normal  0.827447 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0192  fumarate hydratase  94.17 
 
 		 463 aa  907    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1174  fumarate hydratase  69.11 
 
 		 462 aa  671    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.715277  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0695  fumarate hydratase, class II  70 
 
 		 469 aa  645    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.259805  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2138  fumarate hydratase  68.68 
 
 		 464 aa  656    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.273045  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2664  fumarate hydratase, class II  69.06 
 
 		 472 aa  641    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613599  normal  0.60037 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3022  fumarate hydratase  100 
 
 		 463 aa  947    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0812  fumarate hydratase  68.03 
 
 		 464 aa  640    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.661312 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0174  fumarate hydratase  94.17 
 
 		 478 aa  906    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  decreased coverage  0.000137978  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2237  fumarate hydratase  70.41 
 
 		 463 aa  665    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.416397 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2786  fumarate hydratase, class II  69.06 
 
 		 472 aa  636    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.347801 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1095  fumarate hydratase, class II  69.35 
 
 		 469 aa  637    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0144003 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1667  fumarate hydratase  71.09 
 
 		 462 aa  676    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0452593 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0355  fumarate hydratase  78.35 
 
 		 463 aa  741    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0771995  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0721  fumarate hydratase  67.82 
 
 		 464 aa  648    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.764225 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2891  fumarate hydratase, class II  69.06 
 
 		 472 aa  641    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2077  fumarate hydratase  68.47 
 
 		 463 aa  642    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1908  fumarate hydratase  68.7 
 
 		 465 aa  667    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.856676  normal  0.217565 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2445  fumarate hydratase  72.17 
 
 		 466 aa  693    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.890321  normal  0.353648 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3367  fumarate hydratase  70.78 
 
 		 463 aa  682    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.328502  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4521  fumarate hydratase, class II  68.55 
 
 		 469 aa  631  1e-180  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4014  fumarate hydratase  68.7 
 
 		 475 aa  630  1e-179  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2353  fumarate hydratase  66.67 
 
 		 469 aa  626  1e-178  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.499046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2030  fumarate hydratase  68.4 
 
 		 472 aa  627  1e-178  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.212557 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2394  fumarate hydratase  64.79 
 
 		 462 aa  624  1e-177  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.344054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0283  fumarate hydratase, class II  65.8 
 
 		 468 aa  619  1e-176  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.136542 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74587  Fumarase converts fumaric acid to L-malic acid in the TCA cycle  64.5 
 
 		 492 aa  618  1e-176  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.595402 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85745  fumarase  64.64 
 
 		 463 aa  617  1e-175  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3360  fumarate hydratase  68.48 
 
 		 472 aa  616  1e-175  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0876882  normal  0.0135144 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2732  fumarate hydratase  66.38 
 
 		 471 aa  615  1e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3242  fumarate hydratase, class II  65.22 
 
 		 465 aa  613  9.999999999999999e-175  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3271  fumarate hydratase  67.54 
 
 		 472 aa  610  1e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.126919  normal  0.943861 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1452  fumarate hydratase  62.85 
 
 		 465 aa  609  1e-173  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.315875 
 
 
-
 
NC_006685  CNC01700  fumarate hydratase, putative  63.91 
 
 		 510 aa  595  1e-169  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2334  fumarate hydratase  63.22 
 
 		 465 aa  596  1e-169  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00667023  normal  0.148736 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08707  fumarate hydratase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G02470)  63.64 
 
 		 544 aa  593  1e-168  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0492  fumarate hydratase  61.49 
 
 		 464 aa  590  1e-167  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.212311  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0637  fumarate hydratase  60.92 
 
 		 461 aa  590  1e-167  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.536555  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0376  fumarate hydratase  61.57 
 
 		 461 aa  590  1e-167  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2046  fumarase  64.15 
 
 		 464 aa  586  1e-166  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.687279 
 
 
-
 
NC_006368  lpp3005  fumarate hydratase  61.34 
 
 		 464 aa  582  1.0000000000000001e-165  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2866  fumarate hydratase  61.12 
 
 		 463 aa  579  1e-164  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2655  fumarate hydratase  60.65 
 
 		 463 aa  573  1.0000000000000001e-162  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0321342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2882  fumarate hydratase  62.01 
 
 		 463 aa  573  1.0000000000000001e-162  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.405622  normal  0.452741 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1279  fumarate hydratase  61.93 
 
 		 461 aa  570  1e-161  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2522  fumarate hydratase  62.14 
 
 		 465 aa  568  1e-161  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4239  fumarate hydratase  61.49 
 
 		 461 aa  570  1e-161  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4127  fumarate hydratase  61.49 
 
 		 461 aa  570  1e-161  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.542273  normal  0.221641 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1102  fumarate hydratase  60.13 
 
 		 464 aa  567  1e-160  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.184674  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2047  fumarate hydratase  61.27 
 
 		 474 aa  564  1.0000000000000001e-159  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.57514  normal  0.0269276 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1491  fumarate hydratase  60.92 
 
 		 461 aa  562  1.0000000000000001e-159  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0535004  normal  0.876261 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1696  fumarate hydratase  63.54 
 
 		 458 aa  560  1e-158  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.397787  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0795  fumarate hydratase  60.75 
 
 		 466 aa  560  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00749677  normal  0.0712325 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3152  fumarate hydratase  62.8 
 
 		 471 aa  561  1e-158  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1057  fumarate hydratase  61.44 
 
 		 463 aa  558  1e-157  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2715  fumarate hydratase  63.12 
 
 		 464 aa  556  1e-157  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.554775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0975  fumarate hydratase  61.66 
 
 		 463 aa  555  1e-157  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.526915  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2918  fumarate hydratase, class II  59.83 
 
 		 464 aa  555  1e-157  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0889  fumarate hydratase  60.26 
 
 		 464 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.445127  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2515  fumarate hydratase  60.26 
 
 		 464 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.324013  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0493  fumarate hydratase  60.26 
 
 		 464 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2940  fumarate hydratase  60.26 
 
 		 464 aa  553  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00014001  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1685  fumarate hydratase  60.48 
 
 		 464 aa  554  1e-156  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2826  fumarate hydratase  60.26 
 
 		 464 aa  553  1e-156  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.841054  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3201  fumarate hydratase, class II  59.61 
 
 		 464 aa  553  1e-156  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2886  fumarate hydratase  60.26 
 
 		 631 aa  552  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205063  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0966  fumarate hydratase  60.26 
 
 		 464 aa  551  1e-156  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.399399  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1795  fumarate hydratase, class II  59.22 
 
 		 465 aa  551  1e-156  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0259  fumarate hydratase  60.26 
 
 		 464 aa  553  1e-156  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389024  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1049  fumarate hydratase  59.83 
 
 		 464 aa  549  1e-155  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.994408  normal  0.827821 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1617  fumarate hydratase  60.57 
 
 		 462 aa  548  1e-155  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0970  fumarate hydratase  60.48 
 
 		 464 aa  551  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1238  fumarate hydratase  58.21 
 
 		 459 aa  549  1e-155  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4203  fumarate hydratase  59.44 
 
 		 464 aa  549  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.128177  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4795  fumarate hydratase, class II  61.21 
 
 		 464 aa  549  1e-155  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2471  fumarate hydratase  59.48 
 
 		 462 aa  549  1e-155  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0611  fumarate hydratase  59.83 
 
 		 464 aa  549  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.91536  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1090  fumarate hydratase  59.83 
 
 		 464 aa  549  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.316185  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3215  fumarate hydratase, class II  59.26 
 
 		 468 aa  546  1e-154  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.587959  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1637  fumarate hydratase  60.57 
 
 		 462 aa  547  1e-154  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.156374  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1587  fumarate hydratase  60.57 
 
 		 462 aa  546  1e-154  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1783  fumarate hydratase  60.35 
 
 		 462 aa  545  1e-154  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.943509  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1767  fumarate hydratase  60.57 
 
 		 462 aa  547  1e-154  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1071  fumarate hydratase  59.05 
 
 		 465 aa  545  1e-154  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1197  fumarate hydratase  58.21 
 
 		 459 aa  547  1e-154  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3664  fumarate hydratase  58.13 
 
 		 462 aa  545  1e-154  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2731  fumarate hydratase, class II  58.82 
 
 		 471 aa  546  1e-154  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.799595  normal  0.207959 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1819  fumarate hydratase  60.35 
 
 		 462 aa  544  1e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1841  fumarate hydratase  60.35 
 
 		 462 aa  544  1e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.194885  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1120  fumarate hydratase  58.11 
 
 		 456 aa  543  1e-153  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1415  fumarate hydratase  60.13 
 
 		 462 aa  541  1e-153  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.566531  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1049  fumarate hydratase  58.48 
 
 		 463 aa  544  1e-153  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.62891  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0424  fumarate hydratase  57.95 
 
 		 463 aa  542  1e-153  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1895  fumarate hydratase  60.13 
 
 		 462 aa  543  1e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0261938  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3561  fumarate hydratase  60.13 
 
 		 462 aa  540  9.999999999999999e-153  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1731  fumarate hydratase, class II  58.21 
 
 		 464 aa  538  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.31099  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3661  fumarate hydratase  58.21 
 
 		 464 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.42486 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0494  fumarate hydratase, class II  58.73 
 
 		 464 aa  539  9.999999999999999e-153  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.172647  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>