More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0404 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004310  BR0311  dihydroorotate dehydrogenase 2  87.57 
 
 
364 aa  652    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0404  dihydroorotate dehydrogenase 2  100 
 
 
364 aa  729    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.15486  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0325  dihydroorotate dehydrogenase 2  87.57 
 
 
364 aa  652    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  69.08 
 
 
362 aa  487  1e-136  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.551343 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0222  dihydroorotate dehydrogenase 2  68.52 
 
 
362 aa  480  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0161  dihydroorotate dehydrogenase 2  66.76 
 
 
362 aa  477  1e-133  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.46747  normal  0.733228 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0586  dihydroorotate dehydrogenase 2  67.51 
 
 
363 aa  472  1e-132  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0094  dihydroorotate dehydrogenase 2  64.29 
 
 
363 aa  462  1e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0293  dihydroorotate dehydrogenase 2  57.5 
 
 
362 aa  427  1e-118  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0437  dihydroorotate dehydrogenase  58.53 
 
 
348 aa  367  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0788  dihydroorotate dehydrogenase 2  55.2 
 
 
364 aa  359  4e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.564423 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0793  dihydroorotate dehydrogenase 2  54.04 
 
 
364 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.01088 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4622  dihydroorotate dehydrogenase 2  54.87 
 
 
364 aa  352  5e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3807  dihydroorotate dehydrogenase  55.07 
 
 
374 aa  348  6e-95  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0649715 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0865  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.76 
 
 
364 aa  348  7e-95  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.207108  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2058  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.26 
 
 
358 aa  346  3e-94  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4535  dihydroorotate dehydrogenase 2  55.22 
 
 
359 aa  345  8.999999999999999e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.764504  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0555  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.7 
 
 
364 aa  340  2e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0464  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.25 
 
 
364 aa  339  4e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0755  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.53 
 
 
364 aa  339  4e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.736815  normal  0.263292 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1550  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.38 
 
 
352 aa  338  9.999999999999999e-92  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11793  normal  0.477736 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2382  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.67 
 
 
358 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2106  dihydroorotate dehydrogenase 2  53.67 
 
 
358 aa  335  5.999999999999999e-91  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0121785 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0193  dihydroorotate dehydrogenase 2  54.02 
 
 
349 aa  332  5e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0388  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.72 
 
 
354 aa  326  4.0000000000000003e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0056  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.88 
 
 
357 aa  325  1e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.183663 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2920  dihydroorotate dehydrogenase 2  54.6 
 
 
356 aa  323  2e-87  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.818371 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0518  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.01 
 
 
343 aa  322  9.000000000000001e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.565795 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1068  dihydroorotate oxidase  55.45 
 
 
361 aa  321  1.9999999999999998e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.108109 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0547  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.56 
 
 
358 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.110484 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3012  dihydroorotate dehydrogenase 2  49.86 
 
 
355 aa  320  3e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.294679  normal  0.208267 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0847  dihydroorotate dehydrogenase 2  51.12 
 
 
352 aa  315  9.999999999999999e-85  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.211753  normal  0.196757 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2617  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.42 
 
 
354 aa  311  7.999999999999999e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0957  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.42 
 
 
354 aa  311  9e-84  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2884  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.23 
 
 
352 aa  311  2e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.604119  normal  0.126993 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3258  dihydroorotate dehydrogenase 2  52.22 
 
 
359 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.107503 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2963  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.63 
 
 
348 aa  306  5.0000000000000004e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.265581  normal  0.013734 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0927  dihydroorotate dehydrogenase 2  50.69 
 
 
377 aa  303  2.0000000000000002e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0680  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.25 
 
 
356 aa  300  3e-80  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.233007 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0514  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.11 
 
 
367 aa  298  1e-79  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.72272  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2800  dihydroorotate dehydrogenase  48.97 
 
 
336 aa  296  3e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.30241  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1549  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.13 
 
 
336 aa  293  3e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_13090  dihydroorotate dehydrogenase  47.58 
 
 
384 aa  292  7e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00338155 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3988  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.41 
 
 
348 aa  292  7e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.055299  normal  0.021613 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2701  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.1 
 
 
361 aa  292  7e-78  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.86 
 
 
339 aa  289  7e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1048  dihydroorotate dehydrogenase  47.62 
 
 
377 aa  288  1e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0741  dihydroorotate oxidase  46.13 
 
 
344 aa  287  2e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2593  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.65 
 
 
335 aa  287  2e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.144879  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5856  dihydroorotate dehydrogenase  47.65 
 
 
349 aa  287  2e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2706  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.08 
 
 
349 aa  285  5.999999999999999e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1786  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.15 
 
 
339 aa  285  7e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1681  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.92 
 
 
339 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0429717  normal  0.0725537 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1756  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.92 
 
 
339 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.341837  normal  0.144271 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3190  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.38 
 
 
343 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.924979  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1786  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.92 
 
 
339 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.287133  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0981  dihydroorotate dehydrogenase  46.24 
 
 
357 aa  283  3.0000000000000004e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1912  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.92 
 
 
339 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.103041  normal  0.350428 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2432  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.92 
 
 
339 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.160194  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2552  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.92 
 
 
339 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.050028 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1077  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.04 
 
 
347 aa  282  6.000000000000001e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2507  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.65 
 
 
353 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0969  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.04 
 
 
347 aa  282  6.000000000000001e-75  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1098  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.54 
 
 
336 aa  281  1e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.730125  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2455  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.18 
 
 
359 aa  281  1e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.17369  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003436  dihydroorotate dehydrogenase  45.83 
 
 
336 aa  281  2e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2166  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.54 
 
 
348 aa  280  2e-74  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.684778  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1476  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.71 
 
 
356 aa  281  2e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1342  dihydroorotate oxidase A  45.43 
 
 
371 aa  281  2e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1455  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.71 
 
 
356 aa  281  2e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1266  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.59 
 
 
344 aa  280  3e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.568421 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1730  dihydroorotate dehydrogenase 2  48.35 
 
 
353 aa  280  3e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.658492  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD1239  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.7 
 
 
355 aa  280  3e-74  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0506  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.45 
 
 
337 aa  280  3e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08446  dihydroorotate dehydrogenase  44.67 
 
 
339 aa  280  3e-74  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00808  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.31 
 
 
351 aa  280  4e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.353317  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1613  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.15 
 
 
341 aa  280  4e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000426002 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0799  dihydroorotate dehydrogenase  48.62 
 
 
389 aa  279  5e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.795428 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02339  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.94 
 
 
336 aa  279  5e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2439  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.32 
 
 
339 aa  279  6e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2592  dihydroorotate dehydrogenase 2  47.32 
 
 
339 aa  279  7e-74  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1037  dihydroorotate oxidase  45.93 
 
 
340 aa  279  7e-74  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2220  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.88 
 
 
339 aa  278  9e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1080  Dihydroorotate oxidase  46.39 
 
 
344 aa  278  1e-73  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.106041  normal  0.333003 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1606  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.27 
 
 
341 aa  277  2e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.806586  normal  0.155671 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1242  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.61 
 
 
340 aa  277  2e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2210  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.13 
 
 
344 aa  277  2e-73  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229719  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2194  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.76 
 
 
339 aa  277  2e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3359  dihydroorotate dehydrogenase  46.78 
 
 
396 aa  277  2e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0375  Dihydroorotate oxidase  42.32 
 
 
348 aa  277  2e-73  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18900  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.6 
 
 
347 aa  277  2e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.388059  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2132  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.78 
 
 
351 aa  277  2e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.968408  normal  0.0597535 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2095  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.43 
 
 
340 aa  276  3e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0895487 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2511  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.59 
 
 
345 aa  277  3e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0626314  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2858  dihydroorotate dehydrogenase 2  45.07 
 
 
350 aa  276  3e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.547026  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1650  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.78 
 
 
351 aa  277  3e-73  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1678  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.41 
 
 
345 aa  277  3e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.289485 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2174  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.51 
 
 
336 aa  276  4e-73  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000000792039  normal  0.661729 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02009  dihydroorotate dehydrogenase 2  44.11 
 
 
331 aa  276  4e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0256343  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2087  dihydroorotate dehydrogenase 2  46.78 
 
 
342 aa  276  4e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>