More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1973 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_1973  amino acid carrier protein  100 
 
 
458 aa  910    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.123631 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2767  amino acid carrier protein  69.61 
 
 
450 aa  605  9.999999999999999e-173  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.070089  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3541  amino acid carrier protein  48.31 
 
 
457 aa  389  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3842  amino acid/cation symporter  48.18 
 
 
460 aa  387  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.489392  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0685  amino acid carrier protein  47.97 
 
 
449 aa  384  1e-105  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0152054  normal  0.458275 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0424  amino acid carrier protein  47.52 
 
 
457 aa  379  1e-104  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3734  amino acid carrier protein  47.07 
 
 
459 aa  381  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0255  amino acid carrier protein  48.88 
 
 
453 aa  378  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0910  amino acid carrier protein  50.78 
 
 
454 aa  376  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000627243  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28840  Sodium:alanine symporter  48.1 
 
 
447 aa  378  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3333  amino acid carrier protein  46.62 
 
 
458 aa  377  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4364  amino acid carrier protein  45.93 
 
 
459 aa  377  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0649  amino acid carrier protein  47.18 
 
 
456 aa  377  1e-103  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31800  putative sodium:alanine symporter  48.75 
 
 
449 aa  378  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0139777  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2411  sodium/alanine symporter family protein  47.26 
 
 
455 aa  374  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3952  amino acid carrier protein  45.82 
 
 
458 aa  375  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3770  amino acid carrier protein  45.82 
 
 
458 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0498  amino acid carrier protein  45.82 
 
 
458 aa  375  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2346  sodium/alanine symporter family protein  47.03 
 
 
455 aa  374  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3826  amino acid carrier protein  45.82 
 
 
458 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2703  amino acid carrier protein  48.07 
 
 
464 aa  373  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2481  sodium/alanine symporter family protein  47.03 
 
 
455 aa  372  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.624372  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2155  amino acid carrier protein  46.58 
 
 
464 aa  370  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.733934  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2217  sodium/alanine symporter family protein  47.03 
 
 
455 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00259878  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2979  sodium/alanine symporter family protein  46.35 
 
 
455 aa  369  1e-101  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.626895 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2156  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  47.03 
 
 
455 aa  371  1e-101  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.185543  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1695  amino acid carrier protein  44.8 
 
 
458 aa  369  1e-101  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.374608  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2140  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  47.03 
 
 
455 aa  371  1e-101  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.889677  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2381  sodium/alanine symporter family protein  47.03 
 
 
455 aa  370  1e-101  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2399  sodium/alanine symporter family protein  47.03 
 
 
455 aa  369  1e-101  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0584  amino acid carrier protein  47.52 
 
 
459 aa  371  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000603825 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2187  amino acid carrier protein  46.35 
 
 
455 aa  366  1e-100  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.617077  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0607  amino acid carrier protein  46.4 
 
 
456 aa  365  1e-99  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1483  amino acid carrier protein  46.05 
 
 
445 aa  364  2e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.511941  hitchhiker  0.0000051081 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1846  amino acid carrier protein  46.98 
 
 
445 aa  356  5e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.256454  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2492  sodium/alanine symporter  46.26 
 
 
448 aa  355  7.999999999999999e-97  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5157  amino acid carrier protein  45.78 
 
 
458 aa  355  1e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1814  amino acid carrier protein  51.15 
 
 
461 aa  353  4e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.135362  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0195  amino acid carrier protein  45.84 
 
 
460 aa  353  5e-96  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0134  amino acid carrier protein  48.74 
 
 
459 aa  351  2e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.183257 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3166  amino acid carrier protein  46.28 
 
 
459 aa  343  5e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1408  sodium/alanine symporter  41.61 
 
 
462 aa  340  2.9999999999999998e-92  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1672  sodium:alanine symporter family protein  41.61 
 
 
462 aa  338  9.999999999999999e-92  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.251428  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18710  amino acid carrier protein  45.35 
 
 
476 aa  337  1.9999999999999998e-91  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.961427  normal  0.254894 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0259  amino acid carrier protein  46.22 
 
 
446 aa  337  2.9999999999999997e-91  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0573  amino acid carrier protein  45.7 
 
 
443 aa  335  1e-90  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21681  Sodium:alanine symporter family protein  45.39 
 
 
464 aa  331  2e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0888234 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2247  amino acid carrier protein  45.35 
 
 
443 aa  330  3e-89  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.308467  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_06131  Na+/alanine symporter  45.07 
 
 
447 aa  328  9e-89  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.407748  normal  0.332279 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3038  amino acid carrier protein  45.33 
 
 
470 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1796  sodium/alanine symporter  39.47 
 
 
460 aa  327  2.0000000000000001e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.466203  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1145  sodium:alanine symporter family protein  43.08 
 
 
448 aa  326  4.0000000000000003e-88  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00166768  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0834  Sodium:alanine symporter  44.44 
 
 
456 aa  326  4.0000000000000003e-88  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2953  sodium:alanine symporter family protein  42.28 
 
 
464 aa  326  5e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.206004 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0799  sodium/alanine symporter  45.73 
 
 
458 aa  326  6e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1032  sodium/alanine symporter  39.69 
 
 
456 aa  325  2e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.065178  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1133  amino acid carrier protein  44.12 
 
 
456 aa  323  6e-87  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4884  amino acid carrier protein  40.76 
 
 
460 aa  322  8e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.182378  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2852  amino acid carrier protein  41.02 
 
 
463 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3143  amino acid carrier protein  43.44 
 
 
452 aa  320  3e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0792  amino acid carrier protein  42.14 
 
 
443 aa  320  3.9999999999999996e-86  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.839726  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0858  sodium:alanine symporter family protein  43.15 
 
 
452 aa  320  5e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3886  amino acid carrier protein  43.12 
 
 
459 aa  319  7e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00728667  normal  0.343174 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3308  amino acid carrier protein  42.76 
 
 
452 aa  318  9e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3785  amino acid carrier protein  41.1 
 
 
457 aa  318  1e-85  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000668387  hitchhiker  0.0000307467 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3420  amino acid carrier protein  42.53 
 
 
452 aa  318  2e-85  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1156  amino acid carrier protein  40.82 
 
 
456 aa  317  3e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.086195 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0714  amino acid carrier protein  42.76 
 
 
452 aa  317  3e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0869  amino acid carrier protein  41.76 
 
 
452 aa  316  4e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0834  amino acid carrier protein  41.76 
 
 
452 aa  316  4e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0857  amino acid carrier protein  41.76 
 
 
452 aa  316  4e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3506  amino acid carrier protein  41.76 
 
 
452 aa  316  5e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0092  amino acid carrier protein  43.3 
 
 
455 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0715  amino acid carrier protein  42.04 
 
 
456 aa  313  2.9999999999999996e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.734479  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1336  amino acid carrier protein  41.56 
 
 
457 aa  313  5.999999999999999e-84  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000270325  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2159  Na+/alanine symporter  41.7 
 
 
460 aa  311  1e-83  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003625  sodium/alanine symporter  38.41 
 
 
458 aa  311  2e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2730  amino acid carrier protein  41.29 
 
 
469 aa  310  4e-83  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000227579  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1664  seryl-tRNA synthetase, class IIA  43.76 
 
 
452 aa  310  5e-83  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0197857  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0496  amino acid carrier protein  42.7 
 
 
457 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0368  amino acid carrier protein  41.46 
 
 
451 aa  308  1.0000000000000001e-82  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000970174  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1722  amino acid carrier protein  44.57 
 
 
471 aa  307  2.0000000000000002e-82  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.878155 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1161  amino acid carrier protein  44.12 
 
 
453 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0819225  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2245  amino acid carrier protein  42.76 
 
 
468 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0757  amino acid carrier protein  44.12 
 
 
453 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.537285  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1578  amino acid carrier protein  40.94 
 
 
441 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.152771  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1821  amino acid carrier protein  42.67 
 
 
467 aa  305  1.0000000000000001e-81  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02469  hypothetical protein  38.53 
 
 
458 aa  304  3.0000000000000004e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1608  amino acid carrier protein  42.86 
 
 
456 aa  302  1e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00276602  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0993  Na+/alanine symporter  39.86 
 
 
447 aa  301  2e-80  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000614522  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0064  amino acid carrier protein  44.91 
 
 
435 aa  300  3e-80  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.194531  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1827  branched-chain amino acid transport protein  38.44 
 
 
472 aa  296  6e-79  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0450  amino acid carrier protein  41.7 
 
 
458 aa  295  1e-78  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.829579  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0666  amino acid carrier protein  44.44 
 
 
487 aa  293  4e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.761891  normal  0.627654 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0823  amino acid carrier protein  43.88 
 
 
424 aa  292  7e-78  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0163  amino acid carrier protein  41.23 
 
 
457 aa  286  4e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17880  amino acid carrier protein  37.9 
 
 
492 aa  286  8e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2656  Na(+)-linked D-alanine glycine permease  41.6 
 
 
426 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.168097  normal  0.203849 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0461  D-alanine glycine permease  44.09 
 
 
458 aa  284  2.0000000000000002e-75  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0104177  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1259  amino acid carrier family protein  40.53 
 
 
474 aa  283  4.0000000000000003e-75  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000459573  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>