More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0206 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_0206  LSU ribosomal protein L5P  100 
 
 
179 aa  364  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0272605  normal  0.414841 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0879  50S ribosomal protein L5  69.1 
 
 
179 aa  270  5.000000000000001e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2699  ribosomal protein L5  64.97 
 
 
179 aa  266  1e-70  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2448  50S ribosomal protein L5  66.67 
 
 
180 aa  263  8e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2702  50S ribosomal protein L5  64.61 
 
 
179 aa  259  1e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2387  50S ribosomal protein L5  64.61 
 
 
179 aa  259  1e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0638  50S ribosomal protein L5  66.67 
 
 
179 aa  258  3e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000002891  hitchhiker  0.0000000142331 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0119  50S ribosomal protein L5  66.67 
 
 
179 aa  258  4e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0123  50S ribosomal protein L5  66.67 
 
 
179 aa  257  7e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2306  50S ribosomal protein L5  66.1 
 
 
179 aa  256  8e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00313059  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2265  50S ribosomal protein L5  66.1 
 
 
179 aa  256  8e-68  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00132272  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1512  ribosomal protein L5  65.71 
 
 
183 aa  257  8e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.527961  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0143  50S ribosomal protein L5  63.28 
 
 
179 aa  255  2e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000984973  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0122  50S ribosomal protein L5  63.28 
 
 
179 aa  256  2e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000110602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0118  50S ribosomal protein L5  63.28 
 
 
179 aa  255  2e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000024971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0116  50S ribosomal protein L5  63.28 
 
 
179 aa  255  2e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167515  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0122  50S ribosomal protein L5  63.28 
 
 
179 aa  256  2e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0134  50S ribosomal protein L5  63.28 
 
 
179 aa  255  2e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.52131e-62 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2321  50S ribosomal protein L5  62.71 
 
 
178 aa  255  2e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000058995  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0298  ribosomal protein L5  63.84 
 
 
180 aa  254  3e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal  0.102158 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5183  50S ribosomal protein L5  63.28 
 
 
179 aa  254  4e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000305231  unclonable  1.92416e-25 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1819  50S ribosomal protein L5  65.54 
 
 
179 aa  254  5e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.160424  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0117  50S ribosomal protein L5  62.71 
 
 
179 aa  253  7e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000973841  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0434  50S ribosomal protein L5  64.97 
 
 
179 aa  253  9e-67  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000357124  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0122  50S ribosomal protein L5  62.71 
 
 
179 aa  253  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000641034  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0153  50S ribosomal protein L5  62.71 
 
 
179 aa  253  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0116  50S ribosomal protein L5  62.15 
 
 
179 aa  252  2.0000000000000002e-66  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000121875  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1733  ribosomal protein L5  63.28 
 
 
180 aa  252  2.0000000000000002e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000736649  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2845  50S ribosomal protein L5  64.97 
 
 
179 aa  251  3e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3655  50S ribosomal protein L5  61.24 
 
 
179 aa  250  7e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000538083  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0770  50S ribosomal protein L5  61.8 
 
 
180 aa  249  1e-65  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000253341  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2390  50S ribosomal protein L5  62.5 
 
 
180 aa  248  3e-65  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000832727  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2915  50S ribosomal protein L5  63.48 
 
 
182 aa  248  3e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1078  50S ribosomal protein L5  63.28 
 
 
179 aa  248  4e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0364811  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0227  50S ribosomal protein L5  63.28 
 
 
181 aa  247  5e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836347  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0945  50S ribosomal protein L5  63.28 
 
 
179 aa  246  9e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0195859  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1358  50S ribosomal protein L5  63.28 
 
 
179 aa  246  1e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000000713607  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1567  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 
179 aa  246  1e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2143  50S ribosomal protein L5  63.28 
 
 
180 aa  246  2e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.244881  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3316  50S ribosomal protein L5  62.71 
 
 
179 aa  245  3e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000267314 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0692  50S ribosomal protein L5  63.28 
 
 
179 aa  244  3e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.182498  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1923  50S ribosomal protein L5  61.36 
 
 
180 aa  244  6e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.360867 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2360  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 
179 aa  243  8e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.65428  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1471  50S ribosomal protein L5  60.8 
 
 
180 aa  243  9e-64  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000027583  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0846  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 
179 aa  242  1.9999999999999999e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.85914  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0993  50S ribosomal protein L5  65.54 
 
 
179 aa  242  1.9999999999999999e-63  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.188772  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0433  50S ribosomal protein L5  57.63 
 
 
179 aa  243  1.9999999999999999e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0138752  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0303  50S ribosomal protein L5  59.43 
 
 
180 aa  242  1.9999999999999999e-63  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0918778  unclonable  1.5322100000000002e-28 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl135  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 
180 aa  242  3e-63  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01290  ribosomal protein L5  59.55 
 
 
179 aa  241  5e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.388904  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0720  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 
179 aa  239  1e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.195379  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0607  50S ribosomal protein L5  62.86 
 
 
180 aa  239  1e-62  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000230236  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3993  ribosomal protein L5  60.57 
 
 
223 aa  239  2e-62  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.13137  normal  0.956876 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0208  50S ribosomal protein L5  60 
 
 
180 aa  239  2e-62  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0237  ribosomal protein L5  60.45 
 
 
180 aa  238  4e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.588088  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1945  50S ribosomal protein L5  59.09 
 
 
180 aa  238  5e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2157  ribosomal protein L5  59.32 
 
 
179 aa  238  5e-62  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.101528  normal  0.341111 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2030  50S ribosomal protein L5  59.09 
 
 
180 aa  238  5e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0708246  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4264  ribosomal protein L5  58.19 
 
 
179 aa  238  5e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000140666  unclonable  0.00000000000331495 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0307  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 
180 aa  237  5e-62  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000563605  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1934  50S ribosomal protein L5  59.09 
 
 
180 aa  238  5e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1855  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 
179 aa  238  5e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.215848  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3000  50S ribosomal protein L5  59.77 
 
 
181 aa  237  8e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.414556  hitchhiker  0.00644408 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0291  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 
179 aa  237  9e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000251494  hitchhiker  0.00000215768 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2676  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 
179 aa  236  1e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.365679  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0496  50S ribosomal protein L5  57.06 
 
 
178 aa  236  1e-61  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000102637  normal  0.067435 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0501  50S ribosomal protein L5  56.5 
 
 
178 aa  236  2e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000650709  hitchhiker  0.0042207 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0779  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 
179 aa  236  2e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000823313  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1562  ribosomal protein L5  59.66 
 
 
180 aa  235  2e-61  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00268047  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0731  50S ribosomal protein L5  55.37 
 
 
179 aa  236  2e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00207885  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0070  50S ribosomal protein L5  59.09 
 
 
180 aa  234  4e-61  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.488123  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1261  50S ribosomal protein L5  57.14 
 
 
193 aa  234  4e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.479244  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0240  50S ribosomal protein L5  58.86 
 
 
180 aa  234  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0237  50S ribosomal protein L5  58.86 
 
 
180 aa  234  5.0000000000000005e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.922109 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0438  50S ribosomal protein L5  56.5 
 
 
178 aa  234  6e-61  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000121232  hitchhiker  0.000103446 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1895  50S ribosomal protein L5  58.52 
 
 
180 aa  234  6e-61  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000163356  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0417  ribosomal protein L5  54.24 
 
 
179 aa  234  6e-61  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000637588  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3739  50S ribosomal protein L5P  54.8 
 
 
179 aa  234  7e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000568765  hitchhiker  0.00392049 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0364  50S ribosomal protein L5  59.2 
 
 
179 aa  233  9e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.731196  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001730  LSU ribosomal protein L5p (L11e)  53.67 
 
 
179 aa  233  9e-61  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000273991  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2806  50S ribosomal protein L5  58.86 
 
 
192 aa  233  9e-61  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.452001  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0417  50S ribosomal protein L5  57.63 
 
 
179 aa  232  2.0000000000000002e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000918773  normal  0.235995 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0065  50S ribosomal protein L5  59.66 
 
 
180 aa  232  2.0000000000000002e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000146206  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3732  50S ribosomal protein L5  54.24 
 
 
179 aa  231  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0475697  normal  0.0194704 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3697  50S ribosomal protein L5  54.24 
 
 
179 aa  231  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3795  50S ribosomal protein L5  54.24 
 
 
179 aa  231  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0138381  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0684  50S ribosomal protein L5  59.09 
 
 
180 aa  231  3e-60  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23151  50S ribosomal protein L5  58.05 
 
 
179 aa  231  3e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3624  50S ribosomal protein L5  54.24 
 
 
179 aa  231  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000960301  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0072  50S ribosomal protein L5  54.24 
 
 
179 aa  231  3e-60  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000153515  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3624  50S ribosomal protein L5  54.24 
 
 
179 aa  231  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000930132  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0335  ribosomal protein L5  53.11 
 
 
179 aa  231  4.0000000000000004e-60  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0713  50S ribosomal protein L5  59.66 
 
 
184 aa  231  4.0000000000000004e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000209145  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08970  50S ribosomal protein L5  57.06 
 
 
179 aa  231  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0918826  normal  0.075966 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1238  50S ribosomal protein L5  58.52 
 
 
220 aa  231  6e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.467467  hitchhiker  0.000847503 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0849  50S ribosomal protein L5  56.5 
 
 
179 aa  231  6e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.148837  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0062  ribosomal protein L5  59.09 
 
 
180 aa  230  7.000000000000001e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145784  hitchhiker  1.96626e-17 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0470  50S ribosomal protein L5  55.37 
 
 
179 aa  230  7.000000000000001e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20750  LSU ribosomal protein L5P  57.71 
 
 
192 aa  230  8.000000000000001e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.995416 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06370  50S ribosomal protein L5  56.5 
 
 
179 aa  230  9e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000337696  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>