73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4321 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4321  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 		 200 aa  397  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.120832  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1862  putative transcriptional regulator, ArsR family  34.44 
 
 		 213 aa  74.3  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0267319 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4088  putative transcriptional regulator protein, ArsR family  31.77 
 
 		 213 aa  70.1  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2755  regulatory protein, ArsR  32.22 
 
 		 225 aa  69.7  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.083885  normal  0.132738 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1225  transcriptional regulator, ArsR family  30.51 
 
 		 193 aa  68.9  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.233594 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02100  predicted transcriptional regulator  35.26 
 
 		 192 aa  68.9  0.00000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2909  putative transcriptional regulator, ArsR family  32.34 
 
 		 243 aa  68.6  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0487501  normal  0.155618 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2961  putative transcriptional regulator, ArsR family  31.98 
 
 		 213 aa  67.8  0.00000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.878538  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2681  transcriptional regulator, ArsR family  47.89 
 
 		 214 aa  66.6  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2040  regulatory protein ArsR  32.81 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2358  transcriptional regulator, ArsR family  47.89 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.276644  normal  0.13645 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1322  transcriptional regulator, ArsR family  31.85 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.0955096 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4924  transcriptional regulator, ArsR family  30.36 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.864535  normal  0.0286248 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0521  putative transcriptional regulator  36.25 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2302  regulatory protein, ArsR  34.05 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.71264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18080  predicted transcriptional regulator  34.15 
 
 		 211 aa  61.6  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.493664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1338  putative transcriptional regulator  31.22 
 
 		 230 aa  61.6  0.000000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5019  transcriptional regulator, ArsR family  32.78 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36740  ArsR family regulatory protein  45.71 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.929416  normal  0.251119 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1441  transcriptional regulator, ArsR family  37.08 
 
 		 192 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7118  transcriptional regulator, ArsR family  29.83 
 
 		 180 aa  57.8  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20540  ArsR family regulatory protein  29.61 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4545  ArsR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 187 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0707495  normal  0.191523 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3356  ArsR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08060  ArsR family regulatory protein  27.17 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.365451  normal  0.146174 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1822  regulatory protein, ArsR  42.67 
 
 		 198 aa  53.9  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00289732  normal  0.850355 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4497  regulatory protein, ArsR  31.68 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.175286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1813  ArsR family transcriptional regulator  42.67 
 
 		 198 aa  52  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0789444  hitchhiker  0.0000651262 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05590  hypothetical protein  26.74 
 
 		 197 aa  51.6  0.000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.604639  normal  0.83451 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4753  transcriptional regulator, ArsR family  30.72 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1212  transcriptional regulator, ArsR family  28.88 
 
 		 212 aa  50.8  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.838465 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0075  regulatory protein ArsR  23.5 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.493033  normal  0.853303 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2503  transcriptional regulator, MarR family  39.71 
 
 		 182 aa  49.7  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.118338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1779  putative transcriptional regulator  43.75 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.304494  normal  0.74945 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4536  ArsR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 224 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.482904  normal  0.619073 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2257  transcriptional regulator, ArsR family  37.33 
 
 		 183 aa  49.3  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587807  normal  0.865774 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1047  transcriptional regulator, ArsR family  41.38 
 
 		 194 aa  48.9  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0265584 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1488  regulatory protein ArsR  34.44 
 
 		 104 aa  47  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.486972  normal  0.347049 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3149  regulatory protein ArsR  27.5 
 
 		 109 aa  46.2  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.224354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1012  putative transcriptional regulator  26.5 
 
 		 205 aa  46.2  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.27626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0166  transcriptional repressor PagR  35.19 
 
 		 99 aa  44.3  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0468  regulatory protein, ArsR  39.73 
 
 		 113 aa  44.3  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1584  ArsR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 108 aa  44.3  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1962  putative transcriptional regulator, ArsR family  36.49 
 
 		 105 aa  43.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.166956  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2852  ArsR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 230 aa  43.5  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260551  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4825  regulatory protein, ArsR  43.64 
 
 		 128 aa  43.5  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.114611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27290  hypothetical protein  28.99 
 
 		 212 aa  43.1  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.109442  normal  0.290934 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0566  hypothetical protein  37.04 
 
 		 113 aa  42.7  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4382  ArsR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 107 aa  42.7  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1549  putative transcriptional regulator  35.19 
 
 		 282 aa  43.1  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.493713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0148  ArsR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 107 aa  42.7  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1129  putative arsenical resistance operon repressor transcription regulator protein  37.84 
 
 		 107 aa  42.4  0.005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.997144 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3796  ArsR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 106 aa  42.4  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.315297 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7390  hypothetical protein  35.44 
 
 		 196 aa  42.4  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2711  regulatory protein ArsR  31.94 
 
 		 306 aa  42.4  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3410  ArsR family transcriptional regulator  35 
 
 		 329 aa  42  0.006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0187563  normal  0.0416707 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3346  hypothetical protein  37.63 
 
 		 384 aa  41.6  0.007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.909269  normal  0.156044 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2339  ArsR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 114 aa  42  0.007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.479129  normal  0.428363 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2809  hypothetical protein  27.92 
 
 		 249 aa  41.6  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3987  ArsR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 98 aa  41.6  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2044  hypothetical protein  35.48 
 
 		 383 aa  41.6  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3055  ArsR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 106 aa  41.6  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.572382  normal  0.538726 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4095  putative transcriptional regulator  42.03 
 
 		 196 aa  41.6  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.475604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0667  transcriptional regulator, ArsR family  33.93 
 
 		 95 aa  41.6  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.44996e-48 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0612  ArsR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 95 aa  41.6  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000261335  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0522  ArsR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 95 aa  41.6  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000193474  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0522  ArsR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 95 aa  41.6  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.61865e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0578  ArsR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 95 aa  41.6  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000313265  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0680  ArsR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 95 aa  41.6  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000146838  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_876  transcriptional regulator, ArsR family  33.77 
 
 		 112 aa  41.2  0.01  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31180  transcriptional regulator, ArsR family  38.18 
 
 		 121 aa  41.2  0.01  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0740  transcriptional regulator, ArsR family  33.93 
 
 		 95 aa  41.2  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116934  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0526  ArsR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 95 aa  41.2  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000387166  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>