27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_3346 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2044  hypothetical protein  94.78 
 
 		 383 aa  700    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3346  hypothetical protein  100 
 
 		 384 aa  761    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.909269  normal  0.156044 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0929  hypothetical protein  36.34 
 
 		 390 aa  266  4e-70  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0957  hypothetical protein  36.6 
 
 		 396 aa  266  5e-70  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1752  hypothetical protein  35.81 
 
 		 390 aa  262  6.999999999999999e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.739696  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0296  protein of unknown function DUF43  38.12 
 
 		 386 aa  261  1e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1016  hypothetical protein  35.81 
 
 		 390 aa  259  4e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.145107  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0142  hypothetical protein  34.84 
 
 		 393 aa  253  5.000000000000001e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195972  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1087  protein of unknown function DUF43  32.28 
 
 		 391 aa  235  1.0000000000000001e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1462  hypothetical protein  35.26 
 
 		 402 aa  205  1e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2198  protein of unknown function DUF43  28.21 
 
 		 355 aa  123  6e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000324238  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0533  protein of unknown function DUF43  33.21 
 
 		 364 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.745438  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1121  hypothetical protein  26.25 
 
 		 358 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.36872  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0209  protein of unknown function DUF43  34.75 
 
 		 358 aa  112  9e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0242846  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3167  protein of unknown function DUF43  34.17 
 
 		 600 aa  109  9.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0154  protein of unknown function DUF43  29.32 
 
 		 359 aa  104  2e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2948  methyltransferase-like protein  37.25 
 
 		 516 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0499  protein of unknown function DUF43  28.57 
 
 		 323 aa  102  8e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0834  protein of unknown function DUF43  29.32 
 
 		 358 aa  102  9e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1172  methyltransferase  34.7 
 
 		 552 aa  102  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.318984  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3028  methyltransferases-like  34.22 
 
 		 610 aa  99  1e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.274424 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2478  hypothetical protein  35.32 
 
 		 585 aa  95.1  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.627901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30610  predicted methyltransferase  33.99 
 
 		 464 aa  93.6  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.603423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6272  protein of unknown function DUF43  37.69 
 
 		 519 aa  86.7  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3741  hypothetical protein  29.08 
 
 		 282 aa  62.4  0.00000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0952103  normal  0.220518 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2257  hypothetical protein  28.03 
 
 		 283 aa  52.8  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0106481  hitchhiker  0.00981057 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5395  hypothetical protein  24.84 
 
 		 281 aa  47.4  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00837362 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>