25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1172 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_1172  methyltransferase  100 
 
 		 552 aa  1072    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.318984  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3167  protein of unknown function DUF43  51.57 
 
 		 600 aa  429  1e-119  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2948  methyltransferase-like protein  44.44 
 
 		 516 aa  327  5e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6272  protein of unknown function DUF43  38.48 
 
 		 519 aa  246  9.999999999999999e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3028  methyltransferases-like  35.23 
 
 		 610 aa  230  4e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.274424 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2478  hypothetical protein  38.8 
 
 		 585 aa  224  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.627901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30610  predicted methyltransferase  38.04 
 
 		 464 aa  224  4e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.603423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1087  protein of unknown function DUF43  30.53 
 
 		 391 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0296  protein of unknown function DUF43  34.43 
 
 		 386 aa  113  8.000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1462  hypothetical protein  37.13 
 
 		 402 aa  111  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0142  hypothetical protein  33.5 
 
 		 393 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195972  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2044  hypothetical protein  35.98 
 
 		 383 aa  107  7e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1016  hypothetical protein  31.55 
 
 		 390 aa  105  3e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.145107  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0929  hypothetical protein  31.07 
 
 		 390 aa  102  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3346  hypothetical protein  34.58 
 
 		 384 aa  101  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.909269  normal  0.156044 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0957  hypothetical protein  32.79 
 
 		 396 aa  100  5e-20  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1752  hypothetical protein  31.4 
 
 		 390 aa  96.7  9e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.739696  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0499  protein of unknown function DUF43  26.02 
 
 		 323 aa  79  0.0000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0834  protein of unknown function DUF43  29.44 
 
 		 358 aa  77.4  0.0000000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1121  hypothetical protein  32.79 
 
 		 358 aa  74.3  0.000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.36872  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2198  protein of unknown function DUF43  25 
 
 		 355 aa  69.3  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000324238  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0533  protein of unknown function DUF43  32.12 
 
 		 364 aa  60.8  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.745438  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0154  protein of unknown function DUF43  33.08 
 
 		 359 aa  60.5  0.00000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0209  protein of unknown function DUF43  28.43 
 
 		 358 aa  60.1  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0242846  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3741  hypothetical protein  27.56 
 
 		 282 aa  49.7  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0952103  normal  0.220518 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>