25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1087 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1087  protein of unknown function DUF43  100 
 
 
391 aa  795    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0296  protein of unknown function DUF43  33.85 
 
 
386 aa  233  3e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3346  hypothetical protein  32.02 
 
 
384 aa  227  2e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.909269  normal  0.156044 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2044  hypothetical protein  31.68 
 
 
383 aa  225  1e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1462  hypothetical protein  32.56 
 
 
402 aa  224  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0142  hypothetical protein  32.83 
 
 
393 aa  192  7e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195972  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0929  hypothetical protein  32.03 
 
 
390 aa  186  7e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1016  hypothetical protein  31.25 
 
 
390 aa  186  7e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.145107  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1752  hypothetical protein  31.51 
 
 
390 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.739696  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0957  hypothetical protein  31.89 
 
 
396 aa  178  1e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3167  protein of unknown function DUF43  28.74 
 
 
600 aa  126  6e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1172  methyltransferase  30.53 
 
 
552 aa  122  9e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.318984  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2478  hypothetical protein  31.28 
 
 
585 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.627901  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2948  methyltransferase-like protein  31.92 
 
 
516 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3028  methyltransferases-like  32.37 
 
 
610 aa  117  3.9999999999999997e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.274424 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1121  hypothetical protein  33.01 
 
 
358 aa  109  8.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.36872  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2198  protein of unknown function DUF43  29.08 
 
 
355 aa  108  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000324238  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6272  protein of unknown function DUF43  26.54 
 
 
519 aa  100  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30610  predicted methyltransferase  28.51 
 
 
464 aa  97.1  5e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.603423  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0834  protein of unknown function DUF43  30.45 
 
 
358 aa  94.4  3e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0533  protein of unknown function DUF43  25.09 
 
 
364 aa  93.2  7e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.745438  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0154  protein of unknown function DUF43  27.07 
 
 
359 aa  90.5  4e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0499  protein of unknown function DUF43  28.5 
 
 
323 aa  87  6e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0209  protein of unknown function DUF43  27.57 
 
 
358 aa  85.5  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0242846  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2257  hypothetical protein  26.85 
 
 
283 aa  63.5  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0106481  hitchhiker  0.00981057 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>