28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2948 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2948  methyltransferase-like protein  100 
 
 		 516 aa  998    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1172  methyltransferase  44.93 
 
 		 552 aa  336  5e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.318984  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3167  protein of unknown function DUF43  42.04 
 
 		 600 aa  312  9e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2478  hypothetical protein  38.74 
 
 		 585 aa  287  2.9999999999999996e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.627901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6272  protein of unknown function DUF43  42.25 
 
 		 519 aa  264  4e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3028  methyltransferases-like  39.68 
 
 		 610 aa  259  9e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.274424 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30610  predicted methyltransferase  38.54 
 
 		 464 aa  227  3e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.603423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1462  hypothetical protein  35 
 
 		 402 aa  122  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1087  protein of unknown function DUF43  28.52 
 
 		 391 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0296  protein of unknown function DUF43  33.8 
 
 		 386 aa  118  3e-25  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0142  hypothetical protein  38.8 
 
 		 393 aa  116  7.999999999999999e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195972  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1016  hypothetical protein  32.65 
 
 		 390 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.145107  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0957  hypothetical protein  34.18 
 
 		 396 aa  114  5e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0929  hypothetical protein  31.43 
 
 		 390 aa  111  3e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1752  hypothetical protein  29.89 
 
 		 390 aa  108  2e-22  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.739696  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2044  hypothetical protein  37.16 
 
 		 383 aa  104  4e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3346  hypothetical protein  35.91 
 
 		 384 aa  103  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.909269  normal  0.156044 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1121  hypothetical protein  28.77 
 
 		 358 aa  84.7  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.36872  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0499  protein of unknown function DUF43  28.5 
 
 		 323 aa  78.2  0.0000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0834  protein of unknown function DUF43  34.62 
 
 		 358 aa  69.7  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2198  protein of unknown function DUF43  31.85 
 
 		 355 aa  67.8  0.0000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000324238  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0209  protein of unknown function DUF43  31.25 
 
 		 358 aa  66.6  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0242846  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0154  protein of unknown function DUF43  32.58 
 
 		 359 aa  65.9  0.000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0533  protein of unknown function DUF43  34.29 
 
 		 364 aa  58.2  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.745438  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3741  hypothetical protein  27.78 
 
 		 282 aa  48.1  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0952103  normal  0.220518 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09440  phenazine biosynthesis protein PhzE  27.31 
 
 		 627 aa  45.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39910  phenazine biosynthesis protein PhzE  27.31 
 
 		 627 aa  45.1  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2257  hypothetical protein  25.16 
 
 		 283 aa  44.7  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0106481  hitchhiker  0.00981057 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>