27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2044 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2044  hypothetical protein  100 
 
 		 383 aa  758    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3346  hypothetical protein  94.78 
 
 		 384 aa  700    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.909269  normal  0.156044 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1752  hypothetical protein  36.07 
 
 		 390 aa  265  1e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.739696  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0957  hypothetical protein  36.87 
 
 		 396 aa  264  2e-69  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0929  hypothetical protein  35.81 
 
 		 390 aa  263  3e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1016  hypothetical protein  36.07 
 
 		 390 aa  263  4e-69  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.145107  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0296  protein of unknown function DUF43  37.56 
 
 		 386 aa  261  1e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0142  hypothetical protein  34.4 
 
 		 393 aa  250  2e-65  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195972  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1087  protein of unknown function DUF43  31.94 
 
 		 391 aa  232  7.000000000000001e-60  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1462  hypothetical protein  36.05 
 
 		 402 aa  211  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2198  protein of unknown function DUF43  24.43 
 
 		 355 aa  125  1e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000324238  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1121  hypothetical protein  26.47 
 
 		 358 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.36872  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0533  protein of unknown function DUF43  32.48 
 
 		 364 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.745438  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0209  protein of unknown function DUF43  34.75 
 
 		 358 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0242846  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3167  protein of unknown function DUF43  34.43 
 
 		 600 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1172  methyltransferase  36.07 
 
 		 552 aa  108  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.318984  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0834  protein of unknown function DUF43  28.47 
 
 		 358 aa  107  3e-22  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0499  protein of unknown function DUF43  29.39 
 
 		 323 aa  106  7e-22  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2948  methyltransferase-like protein  37.75 
 
 		 516 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0154  protein of unknown function DUF43  28.52 
 
 		 359 aa  103  5e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3028  methyltransferases-like  36.22 
 
 		 610 aa  98.2  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.274424 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2478  hypothetical protein  35.82 
 
 		 585 aa  97.1  5e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.627901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30610  predicted methyltransferase  35.04 
 
 		 464 aa  95.1  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.603423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6272  protein of unknown function DUF43  37.63 
 
 		 519 aa  89.7  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3741  hypothetical protein  28.22 
 
 		 282 aa  63.5  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0952103  normal  0.220518 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2257  hypothetical protein  24.14 
 
 		 283 aa  54.7  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0106481  hitchhiker  0.00981057 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5395  hypothetical protein  20.87 
 
 		 281 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00837362 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>