23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_30610 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_30610  predicted methyltransferase  100 
 
 		 464 aa  917    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.603423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6272  protein of unknown function DUF43  47.09 
 
 		 519 aa  363  5.0000000000000005e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3028  methyltransferases-like  40.19 
 
 		 610 aa  276  5e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.274424 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2478  hypothetical protein  38.9 
 
 		 585 aa  267  2.9999999999999995e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.627901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2948  methyltransferase-like protein  38.2 
 
 		 516 aa  225  1e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1172  methyltransferase  38.04 
 
 		 552 aa  223  4e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.318984  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3167  protein of unknown function DUF43  35.08 
 
 		 600 aa  203  5e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0142  hypothetical protein  34.01 
 
 		 393 aa  110  7.000000000000001e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195972  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1016  hypothetical protein  31.71 
 
 		 390 aa  106  9e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.145107  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0929  hypothetical protein  29.41 
 
 		 390 aa  105  2e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0957  hypothetical protein  30.41 
 
 		 396 aa  105  2e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1752  hypothetical protein  30.73 
 
 		 390 aa  100  8e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.739696  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1087  protein of unknown function DUF43  28.51 
 
 		 391 aa  97.1  7e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2044  hypothetical protein  35.04 
 
 		 383 aa  95.1  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0296  protein of unknown function DUF43  27.54 
 
 		 386 aa  94.4  4e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1462  hypothetical protein  35.52 
 
 		 402 aa  93.6  6e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3346  hypothetical protein  33.99 
 
 		 384 aa  92.8  1e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.909269  normal  0.156044 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0499  protein of unknown function DUF43  25.41 
 
 		 323 aa  63.9  0.000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1121  hypothetical protein  26.9 
 
 		 358 aa  62.4  0.00000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.36872  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0834  protein of unknown function DUF43  32.56 
 
 		 358 aa  61.2  0.00000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0154  protein of unknown function DUF43  29.51 
 
 		 359 aa  59.3  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2198  protein of unknown function DUF43  27.43 
 
 		 355 aa  51.6  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000324238  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0533  protein of unknown function DUF43  27.43 
 
 		 364 aa  48.5  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.745438  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>