24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3028 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3028  methyltransferases-like  100 
 
 		 610 aa  1186    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.274424 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2478  hypothetical protein  39.42 
 
 		 585 aa  316  8e-85  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.627901  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6272  protein of unknown function DUF43  37.68 
 
 		 519 aa  287  2.9999999999999996e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30610  predicted methyltransferase  39.85 
 
 		 464 aa  285  2.0000000000000002e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.603423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2948  methyltransferase-like protein  38.5 
 
 		 516 aa  266  8.999999999999999e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1172  methyltransferase  35.69 
 
 		 552 aa  239  1e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.318984  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3167  protein of unknown function DUF43  35.66 
 
 		 600 aa  225  2e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1087  protein of unknown function DUF43  32.37 
 
 		 391 aa  117  5e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0142  hypothetical protein  33.01 
 
 		 393 aa  111  3e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195972  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1016  hypothetical protein  34.78 
 
 		 390 aa  106  1e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.145107  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0929  hypothetical protein  34.24 
 
 		 390 aa  103  1e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0957  hypothetical protein  32.97 
 
 		 396 aa  100  1e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1752  hypothetical protein  34.24 
 
 		 390 aa  100  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.739696  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3346  hypothetical protein  34.22 
 
 		 384 aa  99  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.909269  normal  0.156044 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2044  hypothetical protein  36.22 
 
 		 383 aa  98.2  4e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0296  protein of unknown function DUF43  28.12 
 
 		 386 aa  87.8  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1462  hypothetical protein  33.86 
 
 		 402 aa  86.7  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1121  hypothetical protein  33.57 
 
 		 358 aa  80.1  0.0000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.36872  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0499  protein of unknown function DUF43  26.73 
 
 		 323 aa  75.5  0.000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0209  protein of unknown function DUF43  29.55 
 
 		 358 aa  58.5  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0242846  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0834  protein of unknown function DUF43  31.3 
 
 		 358 aa  57.8  0.0000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0154  protein of unknown function DUF43  30.68 
 
 		 359 aa  57.4  0.0000007  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0533  protein of unknown function DUF43  34.09 
 
 		 364 aa  56.6  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.745438  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2198  protein of unknown function DUF43  27.82 
 
 		 355 aa  56.2  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000324238  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>