24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3167 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3167  protein of unknown function DUF43  100 
 
 		 600 aa  1139    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1172  methyltransferase  51.65 
 
 		 552 aa  437  1e-121  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.318984  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2948  methyltransferase-like protein  41.82 
 
 		 516 aa  303  4.0000000000000003e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6272  protein of unknown function DUF43  38.69 
 
 		 519 aa  229  1e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3028  methyltransferases-like  35.24 
 
 		 610 aa  222  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.274424 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30610  predicted methyltransferase  35.08 
 
 		 464 aa  209  1e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.603423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2478  hypothetical protein  33.8 
 
 		 585 aa  201  3e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.627901  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1087  protein of unknown function DUF43  28.74 
 
 		 391 aa  127  9e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0142  hypothetical protein  34.36 
 
 		 393 aa  110  6e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195972  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0957  hypothetical protein  31.4 
 
 		 396 aa  110  6e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1016  hypothetical protein  30.04 
 
 		 390 aa  110  7.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.145107  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1462  hypothetical protein  35.06 
 
 		 402 aa  110  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0929  hypothetical protein  28.51 
 
 		 390 aa  107  5e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0296  protein of unknown function DUF43  30.23 
 
 		 386 aa  107  7e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2044  hypothetical protein  36.1 
 
 		 383 aa  105  3e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1752  hypothetical protein  29.15 
 
 		 390 aa  104  6e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.739696  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3346  hypothetical protein  35.12 
 
 		 384 aa  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.909269  normal  0.156044 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0499  protein of unknown function DUF43  28.64 
 
 		 323 aa  81.6  0.00000000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1121  hypothetical protein  31.75 
 
 		 358 aa  72  0.00000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.36872  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0154  protein of unknown function DUF43  33.33 
 
 		 359 aa  69.3  0.0000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0209  protein of unknown function DUF43  28.38 
 
 		 358 aa  67.4  0.0000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0242846  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0834  protein of unknown function DUF43  30.28 
 
 		 358 aa  67  0.000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2198  protein of unknown function DUF43  24.68 
 
 		 355 aa  61.2  0.00000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000324238  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0533  protein of unknown function DUF43  29.91 
 
 		 364 aa  58.2  0.0000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.745438  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>