28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0499 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0499  protein of unknown function DUF43  100 
 
 
323 aa  647    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2198  protein of unknown function DUF43  41.55 
 
 
355 aa  220  1.9999999999999999e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000324238  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1121  hypothetical protein  42.49 
 
 
358 aa  211  2e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.36872  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0209  protein of unknown function DUF43  39.88 
 
 
358 aa  205  1e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0242846  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0533  protein of unknown function DUF43  36.81 
 
 
364 aa  204  1e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.745438  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0154  protein of unknown function DUF43  36.74 
 
 
359 aa  182  6e-45  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0834  protein of unknown function DUF43  35.02 
 
 
358 aa  157  2e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0142  hypothetical protein  37.1 
 
 
393 aa  157  3e-37  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195972  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0929  hypothetical protein  37.62 
 
 
390 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1016  hypothetical protein  36.63 
 
 
390 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.145107  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1752  hypothetical protein  36.63 
 
 
390 aa  139  4.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.739696  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0957  hypothetical protein  33.2 
 
 
396 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2044  hypothetical protein  29.08 
 
 
383 aa  105  8e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3346  hypothetical protein  28.29 
 
 
384 aa  102  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.909269  normal  0.156044 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0296  protein of unknown function DUF43  27.4 
 
 
386 aa  97.4  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1087  protein of unknown function DUF43  28.5 
 
 
391 aa  87  4e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1462  hypothetical protein  29.51 
 
 
402 aa  85.5  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3167  protein of unknown function DUF43  28.16 
 
 
600 aa  81.6  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2948  methyltransferase-like protein  28.5 
 
 
516 aa  78.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1172  methyltransferase  26.02 
 
 
552 aa  79  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.318984  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3028  methyltransferases-like  26.73 
 
 
610 aa  75.9  0.000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.274424 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2478  hypothetical protein  26.98 
 
 
585 aa  70.9  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.627901  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30610  predicted methyltransferase  25.41 
 
 
464 aa  63.9  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.603423  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3741  hypothetical protein  23 
 
 
282 aa  57  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0952103  normal  0.220518 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0036  hypothetical protein  27.33 
 
 
279 aa  53.1  0.000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5395  hypothetical protein  20.18 
 
 
281 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00837362 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6272  protein of unknown function DUF43  24.69 
 
 
519 aa  48.1  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2257  hypothetical protein  22.89 
 
 
283 aa  47.8  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0106481  hitchhiker  0.00981057 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>