27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2198 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_2198  protein of unknown function DUF43  100 
 
 
355 aa  721    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000324238  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1121  hypothetical protein  54.52 
 
 
358 aa  408  1e-113  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.36872  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0209  protein of unknown function DUF43  46.63 
 
 
358 aa  306  3e-82  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0242846  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0533  protein of unknown function DUF43  39.83 
 
 
364 aa  281  9e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.745438  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0154  protein of unknown function DUF43  39.65 
 
 
359 aa  268  1e-70  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0834  protein of unknown function DUF43  38.6 
 
 
358 aa  244  1.9999999999999999e-63  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0499  protein of unknown function DUF43  41.55 
 
 
323 aa  220  1.9999999999999999e-56  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0929  hypothetical protein  34.67 
 
 
390 aa  160  5e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1016  hypothetical protein  33.67 
 
 
390 aa  159  6e-38  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.145107  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1752  hypothetical protein  33 
 
 
390 aa  155  1e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.739696  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0142  hypothetical protein  34.84 
 
 
393 aa  150  4e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195972  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0957  hypothetical protein  34.15 
 
 
396 aa  146  6e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2044  hypothetical protein  25.99 
 
 
383 aa  123  4e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3346  hypothetical protein  29.34 
 
 
384 aa  120  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.909269  normal  0.156044 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1087  protein of unknown function DUF43  29.08 
 
 
391 aa  108  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0296  protein of unknown function DUF43  26.14 
 
 
386 aa  99.8  7e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1462  hypothetical protein  23.96 
 
 
402 aa  97.1  4e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1172  methyltransferase  25 
 
 
552 aa  69.7  0.00000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.318984  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2948  methyltransferase-like protein  31.85 
 
 
516 aa  68.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2478  hypothetical protein  26.67 
 
 
585 aa  67.4  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.627901  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3167  protein of unknown function DUF43  24.68 
 
 
600 aa  61.6  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6272  protein of unknown function DUF43  28.47 
 
 
519 aa  60.8  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3741  hypothetical protein  23.31 
 
 
282 aa  57.4  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0952103  normal  0.220518 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3028  methyltransferases-like  27.82 
 
 
610 aa  57  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.274424 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5395  hypothetical protein  25.35 
 
 
281 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00837362 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30610  predicted methyltransferase  27.43 
 
 
464 aa  51.6  0.00002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.603423  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0036  hypothetical protein  26.52 
 
 
279 aa  48.9  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>