18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_0036 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_0036  hypothetical protein  100 
 
 
279 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2257  hypothetical protein  58.7 
 
 
283 aa  342  2.9999999999999997e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0106481  hitchhiker  0.00981057 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3741  hypothetical protein  56.63 
 
 
282 aa  306  3e-82  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0952103  normal  0.220518 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5395  hypothetical protein  50 
 
 
281 aa  258  7e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00837362 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1121  hypothetical protein  29.01 
 
 
358 aa  58.5  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.36872  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0533  protein of unknown function DUF43  27.22 
 
 
364 aa  53.9  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.745438  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0499  protein of unknown function DUF43  27.33 
 
 
323 aa  53.1  0.000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0209  protein of unknown function DUF43  26.7 
 
 
358 aa  51.6  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0242846  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2478  hypothetical protein  25.73 
 
 
585 aa  49.7  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.627901  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0142  hypothetical protein  23.53 
 
 
393 aa  49.3  0.00007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195972  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2198  protein of unknown function DUF43  26.52 
 
 
355 aa  48.9  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000324238  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0154  protein of unknown function DUF43  27.89 
 
 
359 aa  47.8  0.0002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1752  hypothetical protein  28.19 
 
 
390 aa  47.4  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.739696  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1016  hypothetical protein  28.26 
 
 
390 aa  47  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.145107  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0929  hypothetical protein  28.97 
 
 
390 aa  45.8  0.0008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0296  protein of unknown function DUF43  25.44 
 
 
386 aa  45.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1462  hypothetical protein  25.63 
 
 
402 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0957  hypothetical protein  23.3 
 
 
396 aa  44.3  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>