22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_3741 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_3741  hypothetical protein  100 
 
 
282 aa  584  1e-166  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0952103  normal  0.220518 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0036  hypothetical protein  56.63 
 
 
279 aa  306  3e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2257  hypothetical protein  53.85 
 
 
283 aa  303  3.0000000000000004e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0106481  hitchhiker  0.00981057 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5395  hypothetical protein  47.97 
 
 
281 aa  271  6e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00837362 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1121  hypothetical protein  28.03 
 
 
358 aa  71.2  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.36872  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0142  hypothetical protein  25.26 
 
 
393 aa  65.9  0.0000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.195972  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1752  hypothetical protein  26.14 
 
 
390 aa  64.7  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.739696  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2044  hypothetical protein  28.22 
 
 
383 aa  63.9  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0533  protein of unknown function DUF43  25.98 
 
 
364 aa  63.5  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.745438  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1016  hypothetical protein  25.49 
 
 
390 aa  63.2  0.000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.145107  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3346  hypothetical protein  28.57 
 
 
384 aa  62.4  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.909269  normal  0.156044 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0957  hypothetical protein  29.03 
 
 
396 aa  62.4  0.000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0929  hypothetical protein  24.68 
 
 
390 aa  61.6  0.00000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0209  protein of unknown function DUF43  29.86 
 
 
358 aa  60.5  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0242846  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2478  hypothetical protein  31.17 
 
 
585 aa  59.3  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.627901  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2198  protein of unknown function DUF43  23.31 
 
 
355 aa  57.4  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000324238  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0499  protein of unknown function DUF43  23 
 
 
323 aa  57  0.0000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0296  protein of unknown function DUF43  29.29 
 
 
386 aa  54.7  0.000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0834  protein of unknown function DUF43  25 
 
 
358 aa  50.1  0.00004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1172  methyltransferase  27.56 
 
 
552 aa  50.1  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.318984  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0154  protein of unknown function DUF43  26.76 
 
 
359 aa  48.5  0.0001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2948  methyltransferase-like protein  27.78 
 
 
516 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>