67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3710 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3710  exopolysaccharide biosynthesis protein-like  100 
 
 		 420 aa  846    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0492868  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5794  Exopolysaccharide biosynthesis protein related to N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein  36.05 
 
 		 1138 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0776912 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2529  metallophosphoesterase  35.44 
 
 		 1118 aa  151  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3415  hypothetical protein  30.22 
 
 		 402 aa  140  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.71607  hitchhiker  0.00737957 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1065  metallophosphoesterase  31.44 
 
 		 1327 aa  137  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5836  Collagen triple helix repeat protein  32.34 
 
 		 1426 aa  130  6e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5835  metallophosphoesterase  29.77 
 
 		 1421 aa  118  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0189418  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1092  exopolysaccharide biosynthesis protein-like N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N-acetylglucosaminidase  30.63 
 
 		 756 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.830982 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3267  hypothetical protein  31.48 
 
 		 652 aa  113  6e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2182  Ig-like, group 2  38.89 
 
 		 929 aa  106  9e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.951381  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3107  copper amine oxidase domain-containing protein  30.97 
 
 		 480 aa  102  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000580148  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4447  Ig-like, group 2  25.71 
 
 		 913 aa  94.4  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000209553  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3406  Ig-like, group 2  28.12 
 
 		 952 aa  89.7  9e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.68054  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2287  copper amine oxidase domain protein  27.78 
 
 		 718 aa  86.3  9e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.954621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3582  S-layer domain protein  25.49 
 
 		 921 aa  82.4  0.00000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000137339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3693  hypothetical protein  32.88 
 
 		 986 aa  80.9  0.00000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0175129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4167  Ig domain protein group 2 domain protein  27.78 
 
 		 1164 aa  79.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.608426  normal  0.0215824 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4413  hypothetical protein  28.23 
 
 		 430 aa  77  0.0000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.788807 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1397  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like exopolysaccharide biosynthesis protein  25.77 
 
 		 486 aa  75.9  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4427  Ig domain protein group 2 domain protein  28.62 
 
 		 1174 aa  75.1  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.407706  normal  0.105272 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0002  hypothetical protein  41.59 
 
 		 289 aa  68.2  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1938  Exopolysaccharide biosynthesis protein related to N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein  26.98 
 
 		 487 aa  67.8  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4128  hypothetical protein  36.75 
 
 		 328 aa  67  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0321104  normal  0.774041 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0445  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N-acetylglucosaminidase-like exopolysaccharide biosynthesis protein  44.44 
 
 		 345 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.809516  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1360  Exopolysaccharide biosynthesis protein  36.84 
 
 		 303 aa  65.1  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.372504  normal  0.614697 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2600  hypothetical protein  35.53 
 
 		 877 aa  64.3  0.000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00322139  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2213  hypothetical protein  44.94 
 
 		 346 aa  64.3  0.000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  45.98 
 
 		 646 aa  62.8  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2909  putative lipoprotein  28.21 
 
 		 563 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.733186  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3025  putative lipoprotein  28.21 
 
 		 563 aa  60.5  0.00000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.330625  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0378  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like exopolysaccharide biosynthesis protein  51.56 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0303009  normal  0.022945 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1293  hypothetical protein  26.17 
 
 		 660 aa  60.1  0.00000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00805945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0380  putative lipoprotein  27.95 
 
 		 563 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1719  putative lipoprotein  27.95 
 
 		 563 aa  59.7  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.84187  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1529  putative lipoprotein  27.95 
 
 		 559 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.548058  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0346  putative lipoprotein  27.95 
 
 		 559 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0655  hypothetical protein  27.19 
 
 		 642 aa  57  0.0000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4308  hypothetical protein  43.42 
 
 		 350 aa  56.6  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000143065  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0854  hypothetical protein  34.94 
 
 		 215 aa  56.2  0.000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.16843  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1257  hypothetical protein  27.34 
 
 		 540 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16520  SpoIID/LytB domain protein  41.57 
 
 		 833 aa  55.8  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000390469  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0665  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein exopolysaccharide biosynthesis protein  29.61 
 
 		 352 aa  55.1  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0776  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein exopolysaccharide biosynthesis protein  31.87 
 
 		 296 aa  54.7  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2044  hypothetical protein  26.6 
 
 		 625 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1815  hypothetical protein  45.76 
 
 		 259 aa  53.5  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.185976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32650  exopolysaccharide biosynthesis protein  42.16 
 
 		 331 aa  53.5  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.190914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1118  hypothetical protein  23.24 
 
 		 686 aa  53.1  0.000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.699386  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2623  exopolysaccharide biosynthesis protein  39.78 
 
 		 382 aa  53.1  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.102775  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2070  hypothetical protein  25.87 
 
 		 625 aa  53.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.436802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1210  hypothetical protein  29.46 
 
 		 179 aa  53.1  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3223  hypothetical protein  54.24 
 
 		 203 aa  52.8  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1485  hypothetical protein  36.19 
 
 		 338 aa  51.6  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.804579  normal  0.567255 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1603  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein exopolysaccharide biosynthesis protein  30.32 
 
 		 338 aa  51.2  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.530926  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3827  hypothetical protein  25.89 
 
 		 603 aa  50.8  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.739864 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0635  hypothetical protein  37.23 
 
 		 293 aa  50.4  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3222  peptidase M56 BlaR1  33.33 
 
 		 747 aa  50.1  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2779  hypothetical protein  47.46 
 
 		 322 aa  49.7  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000153302  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1484  hypothetical protein  40.24 
 
 		 332 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.555771 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2255  hypothetical protein  39.77 
 
 		 336 aa  49.3  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.473897  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2399  hypothetical protein  32.32 
 
 		 296 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.735883 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3098  exopolysaccharide biosynthesis protein  37.5 
 
 		 383 aa  48.9  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000562756  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1967  hypothetical protein  39.77 
 
 		 336 aa  48.1  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1177  hypothetical protein  23.01 
 
 		 553 aa  47  0.0007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.303184  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2497  hypothetical protein  36.26 
 
 		 365 aa  46.6  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5078  hypothetical protein  28.31 
 
 		 304 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.988054  normal  0.794905 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4701  hypothetical protein  29.01 
 
 		 272 aa  43.9  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0889  hypothetical protein  22.56 
 
 		 605 aa  43.9  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.914068  decreased coverage  0.000140666 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>