More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3420 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_3420  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  100 
 
 
252 aa  492  9.999999999999999e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2117  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  67.81 
 
 
262 aa  292  5e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20560  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  62.18 
 
 
246 aa  272  4.0000000000000004e-72  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.497192 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02150  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  58.01 
 
 
246 aa  253  2.0000000000000002e-66  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09390  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  60.25 
 
 
248 aa  244  8e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0307  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  58.19 
 
 
250 aa  233  2.0000000000000002e-60  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4270  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  54.2 
 
 
258 aa  231  8.000000000000001e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0530  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  53.94 
 
 
257 aa  231  9e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1775  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  46.31 
 
 
1314 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.563736  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1014  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  50.21 
 
 
313 aa  219  3e-56  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.125364 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27200  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  50.84 
 
 
249 aa  216  2e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.182706  normal  0.5893 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6404  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  50 
 
 
254 aa  211  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.929591 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1172  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  50.42 
 
 
263 aa  209  3e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.207951  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1189  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  50.42 
 
 
263 aa  209  3e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.832835  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2161  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  51.05 
 
 
525 aa  208  6e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.135077 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1810  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  50.21 
 
 
238 aa  207  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1199  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  50 
 
 
263 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0392368 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0344  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  46.41 
 
 
250 aa  205  4e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.118132  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4370  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  50.4 
 
 
1088 aa  205  6e-52  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.402344  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0240  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  52.1 
 
 
268 aa  204  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.414523 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0927  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  44.12 
 
 
1055 aa  203  3e-51  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1613  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  45.76 
 
 
1052 aa  202  4e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.885412  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1312  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  45.15 
 
 
1053 aa  201  9.999999999999999e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0437  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  50.21 
 
 
244 aa  198  6e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1512  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  44.07 
 
 
1053 aa  198  7e-50  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4348  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  49.79 
 
 
253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0954836  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2717  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  54.47 
 
 
243 aa  197  2.0000000000000003e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1027  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  43.83 
 
 
1051 aa  195  5.000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1640  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  44.49 
 
 
1051 aa  195  5.000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2512  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  51.27 
 
 
244 aa  194  8.000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0524  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  50.64 
 
 
251 aa  194  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0185005 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13435  hydrolase  47.48 
 
 
262 aa  191  1e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0866526  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0342  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  46.96 
 
 
1053 aa  188  9e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5751  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  47.7 
 
 
236 aa  186  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.511728  normal  0.030519 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1462  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  44.68 
 
 
1050 aa  186  3e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3043  HAD family beta-phosphoglucomutase hydrolase  47.48 
 
 
260 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.720241  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1072  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  47.3 
 
 
243 aa  181  1e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.253685 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2886  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  50.42 
 
 
248 aa  180  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21740  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED/beta-phosphoglucomutase family hydrolase  46.4 
 
 
1125 aa  179  4.999999999999999e-44  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.976778  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1473  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  53.94 
 
 
252 aa  177  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.302617  normal  0.209688 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1494  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  46.41 
 
 
240 aa  178  1e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.981223  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4810  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  43.32 
 
 
252 aa  159  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.657489 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0397  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  35.59 
 
 
223 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12038  trehalose-6-phosphate phosphatase otsB1  38.27 
 
 
1327 aa  118  7e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2868  HAD family hydrolase  34.18 
 
 
246 aa  94  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.537085  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0561  HAD family hydrolase  32.93 
 
 
248 aa  87.4  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.213608  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0484  HAD family sugar phosphatase  33.19 
 
 
221 aa  87  3e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0496  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.52 
 
 
248 aa  86.3  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.527594  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8721  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.05 
 
 
242 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.966182  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00430  beta-phosphoglucomutase  30.52 
 
 
216 aa  85.5  8e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6157  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.33 
 
 
245 aa  84  0.000000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5088  beta-phosphoglucomutase  29.49 
 
 
219 aa  84  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00016924  normal  0.408522 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1875  beta-phosphoglucomutase  31.82 
 
 
215 aa  82.8  0.000000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2757  beta-phosphoglucomutase  32.08 
 
 
216 aa  82.8  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.273253 
 
 
-
 
NC_002936  DET0395  glycoprotease family protein/hydrolase, beta-phosphoglucomutase family  28.21 
 
 
456 aa  79.3  0.00000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2424  HAD family hydrolase  31.3 
 
 
221 aa  79.3  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2198  beta-phosphoglucomutase  29.24 
 
 
215 aa  79.3  0.00000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.102511  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2877  beta-phosphoglucomutase  28.85 
 
 
219 aa  77.8  0.0000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2602  HAD family hydrolase  30.43 
 
 
227 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.852152 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2263  beta-phosphoglucomutase  34.45 
 
 
218 aa  77.8  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000132741  hitchhiker  0.000000451899 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2742  HAD family hydrolase  30.47 
 
 
218 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0039  HAD family hydrolase  33.06 
 
 
242 aa  77  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_338  hypothetical protein  28.21 
 
 
456 aa  76.3  0.0000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00693249  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1282  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.07 
 
 
242 aa  75.9  0.0000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3590  HAD-superfamily hydrolase  33.19 
 
 
218 aa  75.9  0.0000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.906124  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10160  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.49 
 
 
217 aa  75.9  0.0000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0374  HAD family hydrolase  27.27 
 
 
456 aa  76.3  0.0000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000852801  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0214  beta-phosphoglucomutase  30.37 
 
 
965 aa  75.5  0.0000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.387733  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4442  HAD superfamily hydrolase  25.97 
 
 
228 aa  75.1  0.000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.536318  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2701  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  29.71 
 
 
232 aa  74.7  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0141  beta-phosphoglucomutase  26.72 
 
 
214 aa  74.3  0.000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0461  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.8 
 
 
217 aa  73.2  0.000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0319  HAD family sugar phosphatase  28.29 
 
 
223 aa  72.8  0.000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4152  HAD family hydrolase  31.71 
 
 
217 aa  72  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3752  HAD family hydrolase  28.86 
 
 
978 aa  71.2  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625857  normal  0.249828 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3918  beta-phosphoglucomutase  30.77 
 
 
208 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0371171 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0767  beta-phosphoglucomutase  28.45 
 
 
220 aa  70.9  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.180027  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3242  beta-phosphoglucomutase  29.24 
 
 
219 aa  70.5  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0670  beta-phosphoglucomutase  30.43 
 
 
207 aa  70.1  0.00000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.922957  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1649  beta-phosphoglucomutase family hydrolase  33.17 
 
 
202 aa  70.5  0.00000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.382766 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0979  putative beta-phosphoglucomutase  28.63 
 
 
221 aa  69.7  0.00000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1388  putative phosphatase  31.55 
 
 
218 aa  69.7  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00329661  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1805  beta-phosphoglucomutase  30.92 
 
 
219 aa  68.9  0.00000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.185945  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05389  phosphatase YqaB  26.98 
 
 
200 aa  68.6  0.00000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1021  beta-phosphoglucomutase  29.27 
 
 
209 aa  68.6  0.00000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0660798  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3929  HAD family hydrolase  29.17 
 
 
224 aa  68.6  0.00000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.436954  normal  0.193081 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1279  CbbY family protein  29.54 
 
 
230 aa  67.8  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.183021  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05080  predicted phosphatase/phosphohexomutase  25.76 
 
 
227 aa  68.2  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.071348  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0905  HAD family hydrolase  37.5 
 
 
204 aa  68.2  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.427836  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0680  HAD family hydrolase  24.39 
 
 
227 aa  68.2  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0123656 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35659  predicted protein  37.11 
 
 
267 aa  68.6  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2938  HAD family hydrolase  29.54 
 
 
230 aa  67.8  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4630  HAD family hydrolase  27.23 
 
 
225 aa  67.8  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00554039 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1528  putative beta-phosphoglucomutase  30.73 
 
 
219 aa  67.8  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3170  fructose-1-phosphatase  28.64 
 
 
188 aa  67  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00217793  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0272  HAD-superfamily hydrolase  31.33 
 
 
221 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1962  beta-phosphoglucomutase  30.43 
 
 
219 aa  66.6  0.0000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.619448 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2091  Beta-phosphoglucomutase hydrolase  30 
 
 
233 aa  66.2  0.0000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2709  HAD family hydrolase  29.66 
 
 
230 aa  66.6  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.672792 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1933  beta-phosphoglucomutase  29.41 
 
 
230 aa  66.2  0.0000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>