More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0398 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0398  class II aldolase/adducin family protein  100 
 
 
214 aa  439  9.999999999999999e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1177  class II aldolase/adducin family protein  47.8 
 
 
264 aa  212  2.9999999999999995e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000951199  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1290  class II aldolase/adducin family protein  44.5 
 
 
265 aa  187  9e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.984063  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1051  L-fuculose phosphate aldolase  45.77 
 
 
234 aa  177  1e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.698084  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2580  class II aldolase/adducin family protein  42.21 
 
 
216 aa  175  4e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000288741  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0704  class II aldolase/adducin-like  43.94 
 
 
207 aa  167  8e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0019609 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4482  class II aldolase/adducin-like  40.3 
 
 
220 aa  156  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0177289  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2465  class II aldolase/adducin family protein  44.74 
 
 
215 aa  155  4e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430266  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1747  class II aldolase/adducin family protein  37.25 
 
 
303 aa  153  2e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.241807  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3402  class II aldolase/adducin family protein  41.06 
 
 
225 aa  149  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.852747  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4065  class II aldolase/adducin-like  42.35 
 
 
235 aa  142  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4213  class II aldolase/adducin family protein  41.62 
 
 
235 aa  141  7e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.511631  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4188  class II aldolase/adducin family protein  41.46 
 
 
235 aa  141  8e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0319  class II aldolase/adducin-like protein  33.98 
 
 
214 aa  141  9e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.294023  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4769  class II aldolase/adducin family protein  38.12 
 
 
227 aa  139  4.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0362  class II aldolase/adducin family protein  42.42 
 
 
241 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0763324  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1298  class II aldolase/adducin family protein  37.87 
 
 
398 aa  132  3.9999999999999996e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.65057  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32120  ribulose-5-phosphate 4-epimerase-like epimerase or aldolase  39.71 
 
 
216 aa  122  4e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.441837  normal  0.216686 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0128  class II aldolase/adducin family protein  29.86 
 
 
214 aa  122  5e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.717156  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5310  putative aldolase  34.43 
 
 
222 aa  116  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0747891  normal  0.711943 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2434  putative aldolase  33.98 
 
 
211 aa  115  5e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4650  putative aldolase  35.85 
 
 
221 aa  115  5e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.590566  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0116  putative aldolase  33.81 
 
 
218 aa  115  6e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2551  putative aldolase  34.13 
 
 
210 aa  115  6e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189319  hitchhiker  0.00972731 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1853  putative aldolase  34.91 
 
 
220 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.414205  normal  0.470298 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5014  putative aldolase  33.96 
 
 
224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0583347  normal  0.341145 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0110  putative aldolase  33.81 
 
 
218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0035  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  29.47 
 
 
214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1030  putative aldolase  33.96 
 
 
228 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.579014 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04752  putative aldolase  33.65 
 
 
215 aa  111  8.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2896  putative aldolase  34.47 
 
 
220 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0811936 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2628  putative aldolase  35.38 
 
 
218 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.170697 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2082  putative aldolase  33.49 
 
 
220 aa  110  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.966031  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3105  putative aldolase  33.17 
 
 
212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.851697 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3225  putative aldolase  33.17 
 
 
212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3121  putative aldolase  33.17 
 
 
212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0531321 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4323  putative aldolase  32.86 
 
 
225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.138256 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3037  putative aldolase  33.17 
 
 
212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3066  putative aldolase  33.17 
 
 
212 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.494057 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0210  putative aldolase  33.01 
 
 
210 aa  109  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02588  hypothetical protein  32.86 
 
 
212 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0950  class II aldolase/adducin family protein  32.86 
 
 
212 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3035  putative aldolase  32.86 
 
 
212 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2876  putative aldolase  32.86 
 
 
212 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0974  putative aldolase  32.86 
 
 
212 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.776053  normal  0.938908 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3136  putative aldolase  32.86 
 
 
212 aa  109  4.0000000000000004e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02553  hypothetical protein  32.86 
 
 
212 aa  109  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1465  class II aldolase/adducin family protein  37.37 
 
 
215 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.835747  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7708  class II aldolase/adducin family protein  37.31 
 
 
215 aa  104  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2825  putative aldolase  34.03 
 
 
243 aa  104  1e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4427  class II aldolase/adducin family protein  37 
 
 
266 aa  103  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.113248  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2747  putative aldolase  34.03 
 
 
231 aa  103  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.339118  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0014  putative aldolase  32.06 
 
 
210 aa  103  2e-21  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1137  putative aldolase  32.38 
 
 
226 aa  102  3e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.73575 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1678  class II aldolase/adducin-like protein  35.15 
 
 
215 aa  103  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.672374  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0464  putative aldolase  31.58 
 
 
212 aa  102  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3180  putative aldolase  34.91 
 
 
219 aa  102  4e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.438286  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0642  class II aldolase/adducin family protein  31.58 
 
 
215 aa  102  5e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.606774  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1632  putative aldolase  31.75 
 
 
220 aa  101  7e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5062  class II aldolase/adducin domain protein  31.05 
 
 
212 aa  101  9e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.754976  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1829  class II aldolase/adducin family protein  31.61 
 
 
271 aa  100  1e-20  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  decreased coverage  0.00738652  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5929  putative aldolase  33.02 
 
 
220 aa  100  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0434  class II aldolase/adducin family protein  29.61 
 
 
180 aa  100  1e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.192772  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0711  class II aldolase/adducin family protein  34.2 
 
 
222 aa  100  1e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00125122  unclonable  2.5701e-17 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09610  class II aldolase/adducin family protein  30.92 
 
 
214 aa  100  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0403  class II aldolase/adducin family protein  28.89 
 
 
181 aa  100  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.631542  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1486  class II aldolase/adducin family protein  30 
 
 
190 aa  99.8  3e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2170  putative aldolase  34.41 
 
 
220 aa  99.4  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.842805  normal  0.213675 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3498  putative aldolase  31.77 
 
 
213 aa  98.6  6e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.392898  normal  0.194137 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1884  L-fuculose phosphate aldolase  31.22 
 
 
213 aa  98.2  7e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6218  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  34.47 
 
 
215 aa  98.2  8e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.948817 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3030  L-fuculose-1-phosphate aldolase  30.92 
 
 
220 aa  97.8  1e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0672732  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2019  L-fuculose-phosphate aldolase  33.49 
 
 
236 aa  97.8  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.465614 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1490  putative aldolase  31.6 
 
 
210 aa  97.4  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0695  class II aldolase/adducin family protein  27.98 
 
 
428 aa  96.7  2e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18470  L-fuculose phosphate aldolase  30 
 
 
214 aa  97.1  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0254505  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1224  class II aldolase/adducin family protein  34.31 
 
 
220 aa  96.3  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.190003 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5143  putative aldolase  33.33 
 
 
222 aa  96.3  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2494  L-fuculose-phosphate aldolase  34.09 
 
 
222 aa  95.9  4e-19  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0503  class II aldolase/adducin family protein  30.68 
 
 
181 aa  95.9  4e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5075  putative aldolase  31.13 
 
 
212 aa  95.5  6e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2543  class II aldolase/adducin family protein  31.88 
 
 
237 aa  95.5  6e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0424  class II aldolase/adducin family protein  26.07 
 
 
222 aa  95.1  7e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.130241  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2791  L-fuculose-phosphate aldolase  36.73 
 
 
223 aa  95.1  8e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1425  putative aldolase  28.35 
 
 
217 aa  94  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4425  putative aldolase  30.52 
 
 
218 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.869936  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3411  putative aldolase  31.46 
 
 
214 aa  94  2e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1837  putative aldolase  32.11 
 
 
212 aa  93.6  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0769134  normal  0.0677306 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1736  class II aldolase/adducin family protein  29.25 
 
 
219 aa  93.2  2e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0966  class II aldolase/adducin family protein  32.69 
 
 
217 aa  93.6  2e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1553  putative aldolase  30.05 
 
 
216 aa  93.6  2e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.593965  normal  0.465696 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0975  putative aldolase  31.77 
 
 
213 aa  92.4  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2482  class II aldolase/adducin family protein  30.22 
 
 
221 aa  92.8  4e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000186834  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3382  class II aldolase/adducin family protein  30.99 
 
 
217 aa  92  6e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.610835 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2227  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  30.65 
 
 
214 aa  91.7  7e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2485  class II aldolase/adducin family protein  35.58 
 
 
226 aa  91.7  8e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5136  L-fuculose-phosphate aldolase  31.47 
 
 
228 aa  91.7  8e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3734  putative aldolase  30.99 
 
 
214 aa  91.3  9e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0476  putative aldolase  31.38 
 
 
212 aa  90.9  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.369646  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0629  L-ribulose-5-phosphate 4-epimerase  31.44 
 
 
212 aa  90.9  1e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>