172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0316 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0316  30S ribosomal protein S2  100 
 
 		 207 aa  419  1e-116  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0274  30S ribosomal protein S2  49.2 
 
 		 214 aa  209  3e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1047  ribosomal protein S2  44.44 
 
 		 226 aa  190  1e-47  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.269348  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2140  30S ribosomal protein S2  42.33 
 
 		 225 aa  189  2e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000050996  hitchhiker  0.0000667505 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1302  ribosomal protein S2  48.39 
 
 		 199 aa  189  2.9999999999999997e-47  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.29354  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0058  30S ribosomal protein S2  41.75 
 
 		 206 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0190126 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0061  30S ribosomal protein S2  41.75 
 
 		 208 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.924609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0478  30S ribosomal protein S2  44.57 
 
 		 206 aa  180  2e-44  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1826  30S ribosomal protein S2  44.21 
 
 		 268 aa  179  2e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2514  30S ribosomal protein S2  47.62 
 
 		 267 aa  179  2.9999999999999997e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2599  30S ribosomal protein S2  43.16 
 
 		 259 aa  179  2.9999999999999997e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.11317 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1104  30S ribosomal protein S2  40.72 
 
 		 207 aa  178  4e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0430  ribosomal protein S2  44.39 
 
 		 263 aa  176  2e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.748529  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1423  30S ribosomal protein S2  41.18 
 
 		 247 aa  175  3e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.017125 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2544  ribosomal protein S2  44.39 
 
 		 269 aa  176  3e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1237  30S ribosomal protein S2  42.78 
 
 		 202 aa  174  7e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.161578  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2393  30S ribosomal protein S2  42.25 
 
 		 214 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000018478  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0027  30S ribosomal protein S2  40.21 
 
 		 208 aa  174  9.999999999999999e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0219  30S ribosomal protein S2  42.08 
 
 		 221 aa  169  3e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.664063  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1693  30S ribosomal protein S2  42.08 
 
 		 221 aa  169  4e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2378  30S ribosomal protein S2  44.02 
 
 		 202 aa  168  5e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  hitchhiker  0.00361654  normal  0.260163 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2215  30S ribosomal protein S2  42.78 
 
 		 203 aa  168  7e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0907  30S ribosomal protein S2  41.9 
 
 		 220 aa  167  1e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1524  30S ribosomal protein S2  41.53 
 
 		 221 aa  166  2e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.524219  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0759  30S ribosomal protein S2  42.46 
 
 		 220 aa  166  2e-40  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.817066  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1810  30S ribosomal protein S2  41.58 
 
 		 205 aa  165  5e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_2002  30S ribosomal protein S2  37.24 
 
 		 215 aa  157  7e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2892  30S ribosomal protein S2  41.05 
 
 		 202 aa  154  9e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00129354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13682  predicted protein  33.33 
 
 		 220 aa  126  2.0000000000000002e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03172  40S ribosomal protein S0 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B8F8]  34.97 
 
 		 293 aa  126  3e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.51633 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_76999  ribosomal protein S0A  29.63 
 
 		 261 aa  122  4e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.937942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_12355  Ribosomal protein Sa, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  30.81 
 
 		 290 aa  120  9.999999999999999e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.30496  normal  0.113443 
 
 
-
 
NC_006694  CNI04340  40S ribosomal protein S0, putative  32.78 
 
 		 292 aa  112  3e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.220661  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2044  30S ribosomal protein S2  23.41 
 
 		 257 aa  53.5  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000116198  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2376  ribosomal protein S2  24.76 
 
 		 261 aa  53.1  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3709  30S ribosomal protein S2  20.87 
 
 		 244 aa  53.1  0.000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000237071  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1941  ribosomal protein S2  23.79 
 
 		 262 aa  52.4  0.000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2033  30S ribosomal protein S2  21.84 
 
 		 235 aa  52  0.000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0578  ribosomal protein S2  23.79 
 
 		 243 aa  51.6  0.000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1032  SSU ribosomal protein S2P  24.27 
 
 		 238 aa  50.8  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000205725  unclonable  0.0000000105333 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3213  ribosomal protein S2  22.44 
 
 		 248 aa  51.2  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000321925  unclonable  0.000000000222969 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1398  SSU ribosomal protein S2P  22.76 
 
 		 306 aa  51.2  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000000184086  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3733  30S ribosomal protein S2  22.44 
 
 		 256 aa  51.2  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000926335  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1485  30S ribosomal protein S2  21.95 
 
 		 255 aa  50.4  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00136898 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1141  30S ribosomal protein S2  21.84 
 
 		 235 aa  50.4  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000168885  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1510  30S ribosomal protein S2  24.88 
 
 		 274 aa  50.4  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.954561  normal  0.0221668 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2756  30S ribosomal protein S2  21.46 
 
 		 255 aa  49.7  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000868227  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1548  30S ribosomal protein S2  23.96 
 
 		 259 aa  50.1  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.403357 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2708  30S ribosomal protein S2  23.41 
 
 		 257 aa  50.1  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.52443  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1921  30S ribosomal protein S2  25.36 
 
 		 267 aa  49.3  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.7747799999999994e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1419  ribosomal protein S2  21.36 
 
 		 233 aa  49.3  0.00004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000375862  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0563  30S ribosomal protein S2  23.79 
 
 		 301 aa  49.3  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00000123477  normal  0.223242 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1238  30S ribosomal protein S2  21.15 
 
 		 259 aa  49.3  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000341164  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3868  30S ribosomal protein S2  22.33 
 
 		 233 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000560898  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3678  30S ribosomal protein S2  22.33 
 
 		 233 aa  48.9  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000860084  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3568  30S ribosomal protein S2  22.33 
 
 		 233 aa  48.9  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.7831e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3586  30S ribosomal protein S2  22.33 
 
 		 233 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000193043  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3874  30S ribosomal protein S2  22.33 
 
 		 233 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000491144  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3965  30S ribosomal protein S2  22.33 
 
 		 233 aa  48.9  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000002868  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3839  30S ribosomal protein S2  22.33 
 
 		 233 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  3.22661e-62 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2860  30S ribosomal protein S2  24.88 
 
 		 253 aa  48.9  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0606  ribosomal protein S2  23.79 
 
 		 244 aa  48.9  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000185332  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1433  30S ribosomal protein S2  24.88 
 
 		 251 aa  48.9  0.00006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0086997 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1978  30S ribosomal protein S2  21.46 
 
 		 232 aa  48.5  0.00006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000338661  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3925  30S ribosomal protein S2  24.17 
 
 		 263 aa  48.9  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0841532 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0823  30S ribosomal protein S2  23.17 
 
 		 262 aa  48.5  0.00007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0801  30S ribosomal protein S2  20.69 
 
 		 271 aa  48.5  0.00007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000778728  hitchhiker  8.51058e-18 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2019  30S ribosomal protein S2  25.12 
 
 		 262 aa  48.1  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00418742 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3650  30S ribosomal protein S2  22.33 
 
 		 233 aa  48.1  0.00009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000272591  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1921  30S ribosomal protein S2  22.93 
 
 		 251 aa  48.1  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.264289  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1661  30S ribosomal protein S2  21.63 
 
 		 235 aa  47.8  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000151826  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1318  30S ribosomal protein S2  21.84 
 
 		 233 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000762012  hitchhiker  4.07369e-17 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1816  30S ribosomal protein S2  22.01 
 
 		 257 aa  48.1  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000541904  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3925  30S ribosomal protein S2  21.84 
 
 		 233 aa  47.4  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000230027  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2924  30S ribosomal protein S2  23.3 
 
 		 271 aa  47.4  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.240537 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1278  30S ribosomal protein S2  24.2 
 
 		 247 aa  48.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.235139  normal  0.160579 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2479  30S ribosomal protein S2  21.84 
 
 		 233 aa  47.4  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000168536  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04251  40S ribosomal protein S2, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06570)  25 
 
 		 332 aa  46.6  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.474341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1338  30S ribosomal protein S2  22.97 
 
 		 250 aa  47  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.21078  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1404  30S ribosomal protein S2  24.2 
 
 		 247 aa  47.4  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND04600  ribosomal protein, putative  27.95 
 
 		 307 aa  46.6  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2027  30S ribosomal protein S2  22.49 
 
 		 246 aa  46.6  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1435  30S ribosomal protein S2  24.2 
 
 		 247 aa  47.4  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000403005 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1342  30S ribosomal protein S2  23.74 
 
 		 247 aa  46.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.298701  normal  0.417524 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1427  SSU ribosomal protein S2P  20.57 
 
 		 232 aa  47  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000006523  normal  0.078034 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0105  30S ribosomal protein S2  25.12 
 
 		 255 aa  47  0.0002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000131996  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1203  30S ribosomal protein S2  20.75 
 
 		 246 aa  47  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000000159372  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2039  30S ribosomal protein S2  22.49 
 
 		 246 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0350  30S ribosomal protein S2  32.63 
 
 		 264 aa  46.6  0.0003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.20969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5329  30S ribosomal protein S2  22.49 
 
 		 246 aa  46.6  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0468316  normal  0.288359 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0389  30S ribosomal protein S2  32.63 
 
 		 264 aa  46.6  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0342077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6058  30S ribosomal protein S2  22.49 
 
 		 246 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2455  30S ribosomal protein S2  22.82 
 
 		 255 aa  46.2  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000036372  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2019  30S ribosomal protein S2  22.49 
 
 		 246 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2108  30S ribosomal protein S2  22.82 
 
 		 254 aa  46.6  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1316  30S ribosomal protein S2  23.44 
 
 		 255 aa  46.6  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000315088  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1341  30S ribosomal protein S2  23.44 
 
 		 255 aa  46.6  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000466794  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1881  30S ribosomal protein S2  23.74 
 
 		 247 aa  46.2  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.717146  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0785  SSU ribosomal protein S2P  21.95 
 
 		 248 aa  46.2  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.121352 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0742  ribosomal protein S2  23.36 
 
 		 281 aa  46.2  0.0004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000127244  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>