61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0163 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0163  hypothetical protein  100 
 
 
440 aa  914    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000295747 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13852  hypothetical protein  26.41 
 
 
516 aa  93.2  8e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.559931 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5657  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  23.93 
 
 
520 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.302322  normal  0.203451 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0156  Rieske (2Fe-2S) iron-sulfur domain protein  25.97 
 
 
525 aa  88.2  2e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2206  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  25.4 
 
 
516 aa  87.8  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0475184  normal  0.51009 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0116  Rieske (2Fe-2S) domain protein  19.46 
 
 
481 aa  87.4  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.420174  normal  0.988969 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1330  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  22.3 
 
 
529 aa  87.4  5e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1239  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  23.69 
 
 
529 aa  87.4  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00884178 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2842  Rieske (2Fe-2S) domain protein  23.54 
 
 
526 aa  87  7e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1152  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  23.09 
 
 
521 aa  86.3  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.142651  normal  0.0715031 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2184  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.61 
 
 
549 aa  84  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0188  Rieske (2Fe-2S) iron-sulphur domain protein  21.6 
 
 
548 aa  81.6  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1515  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  26.8 
 
 
469 aa  80.5  0.00000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5026  Rieske (2Fe-2S) region  23.81 
 
 
516 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.276564  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5114  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  23.81 
 
 
516 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.363505  normal  0.651796 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5407  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  23.81 
 
 
516 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6475  beta-lactamase domain-containing protein  27.87 
 
 
538 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.642024 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4620  hypothetical protein  31.97 
 
 
259 aa  62  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0411707  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0805  hypothetical protein  25.53 
 
 
248 aa  57  0.0000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3652  hypothetical protein  28.47 
 
 
255 aa  57  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000420556  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1238  polyketide synthase  25.69 
 
 
530 aa  55.8  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2096  beta-lactamase domain-containing protein  28.37 
 
 
535 aa  55.5  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.894663  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03728  hypothetical protein  29.91 
 
 
537 aa  54.3  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.42275 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1563  metallo-beta-lactamase family protein  24.31 
 
 
530 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.177034  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1644  metallo-beta-lactamase family protein  24.31 
 
 
530 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0135  polyketide synthase  24.31 
 
 
530 aa  52.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.474232  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3422  beta-lactamase domain protein  28.04 
 
 
535 aa  50.8  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0195853  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2585  protein Pfam: Lactamase_B  29.32 
 
 
268 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3515  hypothetical protein  24.39 
 
 
434 aa  50.1  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0013  hypothetical protein  28.57 
 
 
250 aa  50.1  0.00008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.660124  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08671  hypothetical protein  24.9 
 
 
479 aa  49.3  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0459434  unclonable  0.0000000643383 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1122  Beta-lactamase-like  29.92 
 
 
325 aa  49.7  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0666  beta-lactamase domain protein  41.54 
 
 
229 aa  48.5  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000389415  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0016  hypothetical protein  25 
 
 
356 aa  48.9  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.439945  hitchhiker  0.00397116 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1073  metal-dependent hydrolase  24.56 
 
 
227 aa  48.9  0.0002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.316137  normal  0.112797 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2296  hypothetical protein  26.61 
 
 
261 aa  47.8  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.6365  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1346  hypothetical protein  34.02 
 
 
260 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3062  hypothetical protein  25.52 
 
 
534 aa  47.4  0.0005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.838657  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5192  hypothetical protein  28.43 
 
 
541 aa  47.4  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.866766  normal  0.107608 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1332  beta-lactamase domain protein  27.18 
 
 
556 aa  47  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.288718  normal  0.0195233 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10841  hypothetical protein  29.37 
 
 
238 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.231765  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06900  hypothetical protein  33.72 
 
 
248 aa  45.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1707  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  35.06 
 
 
386 aa  45.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1284  Zn-dependent hydrolase of the beta-lactamase fold-like protein  27.06 
 
 
393 aa  45.1  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.893751  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2347  putative outer membrane protein  26.61 
 
 
357 aa  45.1  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0404317  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2567  hypothetical protein  20.99 
 
 
245 aa  44.3  0.004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0098  hypothetical protein  26.62 
 
 
277 aa  44.3  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.080433  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1451  hypothetical protein  25.47 
 
 
342 aa  44.3  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0112394  normal  0.158925 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0829  beta-lactamase domain protein  22.86 
 
 
260 aa  44.7  0.004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.362759  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2754  metallo-beta-lactamase family protein  25.47 
 
 
342 aa  44.3  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000143801  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3371  hypothetical protein  26.79 
 
 
259 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.515704  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38030  predicted Zn-dependent hydrolase of beta-lactamase fold protein  20.61 
 
 
211 aa  44.3  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2834  beta-lactamase domain-containing protein  25.47 
 
 
329 aa  44.3  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3111  hypothetical protein  27.91 
 
 
295 aa  43.9  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4707  hypothetical protein  25.2 
 
 
282 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.161538  normal  0.483905 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5715  hypothetical protein  24.59 
 
 
307 aa  43.5  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2548  beta-lactamase domain-containing protein  23.68 
 
 
255 aa  43.1  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2498  beta-lactamase domain-containing protein  23.68 
 
 
255 aa  43.1  0.009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0684369  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1115  hypothetical protein  25.88 
 
 
573 aa  43.1  0.009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1811  metallo-beta-lactamase family protein  30.07 
 
 
645 aa  43.1  0.01  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3362  hypothetical protein  28.24 
 
 
396 aa  43.1  0.01  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>