More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0460 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0460  PfkB  100 
 
 		 308 aa  622  1e-177  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.413409  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0616  PfkB domain protein  68.77 
 
 		 312 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.246916  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0671  PfkB  69.7 
 
 		 309 aa  411  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0090  PfkB  68.46 
 
 		 309 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.125237 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4851  PfkB  67.11 
 
 		 309 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.733485  normal  0.689596 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4029  carbohydrate kinase, PfkB  38.16 
 
 		 299 aa  159  5e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5471  PfkB domain protein  37.12 
 
 		 324 aa  159  5e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.784292 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4413  PfkB family kinase  34.11 
 
 		 298 aa  154  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4235  kinase, PfkB family  34.11 
 
 		 298 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.907464  normal  0.927219 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4257  kinase, PfkB family  34.11 
 
 		 298 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4348  kinase, PfkB family  34.11 
 
 		 298 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4302  kinase PfkB family  34.11 
 
 		 298 aa  152  5e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03768  predicted sugar kinase  34.45 
 
 		 298 aa  150  2e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4103  PfkB domain protein  34.45 
 
 		 298 aa  150  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03717  hypothetical protein  34.45 
 
 		 298 aa  150  2e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.953641  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4406  PfkB family kinase  34.45 
 
 		 298 aa  150  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4268  PfkB family kinase  34.45 
 
 		 298 aa  150  4e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5201  PfkB domain protein  35.37 
 
 		 326 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal  0.135366 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5330  kinase, PfkB family  34.11 
 
 		 298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.574224 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4349  kinase, PfkB family  33.11 
 
 		 298 aa  140  3e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4140  ribokinase-like domain-containing protein  32.78 
 
 		 298 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.682006  normal  0.581205 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4103  PfkB family kinase  32.78 
 
 		 298 aa  139  4.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2455  PfkB domain-containing protein  37.29 
 
 		 282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.287722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0358  ribokinase-like domain-containing protein  33.99 
 
 		 306 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0799  ribokinase-like domain-containing protein  35.29 
 
 		 310 aa  117  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1019  PfkB domain protein  35 
 
 		 284 aa  114  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.485278 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3386  ribokinase-like domain-containing protein  31.67 
 
 		 298 aa  107  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0970  carbohydrate kinase  32.14 
 
 		 314 aa  104  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5483  PfkB domain protein  30.43 
 
 		 313 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.235286 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl642  ribokinase  21.17 
 
 		 308 aa  94.7  2e-18  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3869  ribokinase  27.69 
 
 		 299 aa  92.4  9e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.559054 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2817  PfkB domain protein  29.67 
 
 		 295 aa  92  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.575722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0344  ribokinase  28.85 
 
 		 308 aa  90.9  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0662  PfkB domain-containing protein  27.99 
 
 		 327 aa  89.4  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.478793  normal  0.638402 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0518  ribokinase  27.36 
 
 		 307 aa  89.4  7e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7623  ribokinase  29.97 
 
 		 308 aa  88.2  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.921063  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  30.77 
 
 		 304 aa  87.8  2e-16  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  23.05 
 
 		 309 aa  88.2  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2526  ribokinase  26.06 
 
 		 301 aa  87  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0576  putative ribokinase  27.63 
 
 		 312 aa  86.7  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.588326 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3332  ribokinase  29.45 
 
 		 297 aa  86.3  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3631  ribokinase  24.34 
 
 		 304 aa  86.7  5e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2057  PfkB family kinase  26.4 
 
 		 315 aa  86.3  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124987  normal  0.010035 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1368  ribokinase  27.45 
 
 		 305 aa  85.1  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.176905  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2496  kinase, pfkB family  26.3 
 
 		 310 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4160  ribokinase  27.54 
 
 		 310 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  27.41 
 
 		 315 aa  83.2  0.000000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0147  ribokinase-like domain-containing protein  29.68 
 
 		 318 aa  83.2  0.000000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.719935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  27.95 
 
 		 315 aa  83.2  0.000000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  27.41 
 
 		 315 aa  82.8  0.000000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  27.41 
 
 		 315 aa  82.8  0.000000000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  27.41 
 
 		 315 aa  82.4  0.000000000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  27.1 
 
 		 315 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1488  PfkB  27.24 
 
 		 401 aa  81.6  0.00000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3654  PfkB  28.39 
 
 		 300 aa  82  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.349862 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1343  ribokinase  27.74 
 
 		 309 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  27.1 
 
 		 315 aa  81.6  0.00000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1383  ribokinase  28.06 
 
 		 309 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2909  ribokinase  29.33 
 
 		 302 aa  81.3  0.00000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0179509 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5220  PfkB domain protein  29.77 
 
 		 313 aa  81.3  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.946183  normal  0.655823 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06142  ribokinase  27.16 
 
 		 305 aa  81.6  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0692  carbohydrate kinase  28.67 
 
 		 304 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.19709  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1976  putative ribokinase  31.73 
 
 		 305 aa  79.7  0.00000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.191043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0007  ribokinase  27.39 
 
 		 306 aa  79.3  0.00000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.328015  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000338  ribokinase  27.18 
 
 		 305 aa  79.3  0.00000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2155  carbohydrate kinase, PfkB  27.92 
 
 		 306 aa  79.3  0.00000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00604172  normal  0.881399 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1805  PfkB  27.92 
 
 		 318 aa  79.3  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.512756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0697  ribokinase  24.84 
 
 		 298 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0813613  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0733  ribokinase  24.5 
 
 		 298 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0034  PfkB domain protein  27.81 
 
 		 308 aa  78.6  0.0000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0204225  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0980  ribokinase-like domain-containing protein  26.07 
 
 		 300 aa  79  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.167032 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0575  ribokinase  25.42 
 
 		 298 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1913  PfkB domain-containing protein  25.98 
 
 		 288 aa  77.8  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0579  ribokinase  25 
 
 		 298 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  28.48 
 
 		 305 aa  78.2  0.0000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1546  PfkB domain protein  27.05 
 
 		 285 aa  77.4  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.418317 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4641  ribokinase  25.25 
 
 		 298 aa  77  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.184783  unclonable  5.38833e-26 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4302  PfkB domain protein  28.16 
 
 		 297 aa  77  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4112  ribokinase  29.3 
 
 		 309 aa  77  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2812  PfkB  29.31 
 
 		 321 aa  77  0.0000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0722  ribokinase  24.75 
 
 		 298 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.83177e-24 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0794  ribokinase  25.25 
 
 		 298 aa  77  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00121525  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1940  PfkB  25 
 
 		 294 aa  77  0.0000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.123547  normal  0.0238447 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3342  ribokinase  27.18 
 
 		 308 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.133779  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39280  ribokinase  25.49 
 
 		 308 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.145597  normal  0.325767 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1622  PfkB domain protein  21.22 
 
 		 297 aa  77  0.0000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3225  ribokinase  23.05 
 
 		 311 aa  77  0.0000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.195342  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0921  ketohexokinase  27.62 
 
 		 292 aa  77  0.0000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0632  ribokinase  25.25 
 
 		 298 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0576  ribokinase  25.5 
 
 		 298 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0665  ribokinase  25.25 
 
 		 298 aa  76.6  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4591  ribokinase  25.77 
 
 		 295 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01230  fructokinase  27.79 
 
 		 328 aa  75.5  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0230962  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0008  ribokinase  27.13 
 
 		 308 aa  75.5  0.000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000914124  normal  0.985734 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0008  ribokinase  27.13 
 
 		 308 aa  75.5  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0252287  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4218  ribokinase  28.98 
 
 		 309 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.980767 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4168  ribokinase  28.98 
 
 		 309 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2689  ribokinase  23.55 
 
 		 345 aa  75.1  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4209  ribokinase  27.39 
 
 		 308 aa  75.1  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.847437  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4277  ribokinase  28.98 
 
 		 309 aa  75.1  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.136431  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>