More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1961 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1961  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
444 aa  862  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  3.67534e-07  hitchhiker  6.31341e-07 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4728  histidine kinase  44.91 
 
 
429 aa  311  2e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5647  histidine kinase  40.68 
 
 
433 aa  310  4e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.559873  normal  0.146404 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2927  histidine kinase  46.47 
 
 
383 aa  278  2e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  9.36268e-05  hitchhiker  1.01948e-05 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3546  histidine kinase  49.7 
 
 
489 aa  275  9e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.871685 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2757  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  46.44 
 
 
433 aa  273  3e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.128423  normal  0.0502627 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2507  Signal transduction histidine kinase-like protein  39.82 
 
 
405 aa  273  5e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401085  normal  0.727575 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0635  histidine kinase  45.12 
 
 
430 aa  271  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.181904 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9331  Signal transduction histidine kinase-like protein  48.91 
 
 
508 aa  267  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.542521 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2700  histidine kinase  42.94 
 
 
429 aa  263  6e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  3.94923e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3934  histidine kinase  38.69 
 
 
442 aa  252  8e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2249  histidine kinase  41.4 
 
 
420 aa  228  1e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.795375  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4456  histidine kinase  41.28 
 
 
410 aa  221  2e-56  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4415  Signal transduction histidine kinase-like protein  43.49 
 
 
386 aa  216  8e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0384972 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0199  histidine kinase  40.46 
 
 
452 aa  215  1e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4726  histidine kinase  43.13 
 
 
405 aa  215  2e-54  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0386  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.34 
 
 
418 aa  214  2e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.62 
 
 
428 aa  213  6e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4333  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  48.8 
 
 
343 aa  212  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0375931  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1916  histidine kinase  44.62 
 
 
410 aa  202  7e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3718  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.07 
 
 
586 aa  199  8e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118329  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1255  histidine kinase  43.16 
 
 
463 aa  196  8e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2758  histidine kinase  49.57 
 
 
389 aa  194  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00845914  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6198  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.84 
 
 
415 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.129005  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0949  histidine kinase  46.61 
 
 
416 aa  194  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0308  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.64 
 
 
405 aa  192  8e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.130128 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0609  histidine kinase  41.91 
 
 
442 aa  191  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54142 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4688  histidine kinase  36.34 
 
 
419 aa  186  5e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3763  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.87 
 
 
375 aa  186  5e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.200679  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0354  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.19 
 
 
438 aa  186  9e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2301  Histidine kinase  46.12 
 
 
412 aa  182  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2298  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.34 
 
 
432 aa  181  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.317439  normal  0.783172 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4660  histidine kinase  45.58 
 
 
402 aa  180  4e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2281  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.98 
 
 
445 aa  180  6e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.67096  normal  0.255683 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2642  histidine kinase  36.14 
 
 
426 aa  176  1e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.992033  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1652  Histidine kinase  35.24 
 
 
439 aa  174  2e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.527879  normal  0.680022 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2091  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.98 
 
 
466 aa  174  4e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3200  Signal transduction histidine kinase-like protein  44.55 
 
 
395 aa  172  8e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0329  signal transduction histidine kinase  39.44 
 
 
435 aa  171  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.982298  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2525  histidine kinase  35.75 
 
 
434 aa  172  2e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0362104  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3923  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.17 
 
 
435 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534106  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0262  putative signal transduction histidine kinase  36.7 
 
 
465 aa  171  3e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.186103 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3908  putative signal transduction histidine kinase  42.17 
 
 
435 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3982  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  42.17 
 
 
435 aa  171  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.335335  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2433  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.37 
 
 
461 aa  170  4e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.189775  normal  0.142881 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0424  histidine kinase  34.05 
 
 
438 aa  169  7e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.680525  hitchhiker  0.00719111 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0204  histidine kinase  34.95 
 
 
446 aa  169  9e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6138  Signal transduction histidine kinase-like protein  45.89 
 
 
403 aa  168  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278868  normal  0.229544 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1360  histidine kinase  36.81 
 
 
476 aa  167  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.388977 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0211  histidine kinase  46.64 
 
 
463 aa  166  9e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4385  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.17 
 
 
445 aa  165  1e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4606  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.29 
 
 
417 aa  164  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0890367  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3867  histidine kinase  38.31 
 
 
434 aa  163  6e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.265271  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09220  signal transduction histidine kinase  39.35 
 
 
492 aa  163  7e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.253701 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2340  histidine kinase  40.18 
 
 
388 aa  162  8e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12660  signal transduction histidine kinase  43.86 
 
 
444 aa  159  1e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.224023  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.23 
 
 
422 aa  155  9e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4021  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.78 
 
 
411 aa  155  1e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185539  normal  0.088504 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3330  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  46.34 
 
 
398 aa  152  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0149067  normal  0.138525 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3491  putative signal transduction histidine kinase  40.09 
 
 
624 aa  151  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0531  histidine kinase  41.33 
 
 
429 aa  148  2e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.005431  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3516  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.19 
 
 
388 aa  148  2e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.370817  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4050  Histidine kinase  41.96 
 
 
374 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.313821  hitchhiker  0.00550271 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2132  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.9 
 
 
433 aa  147  5e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.569038  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3916  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  45.33 
 
 
431 aa  147  5e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.257994  normal  0.0672811 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35880  signal transduction histidine kinase  43.33 
 
 
454 aa  144  3e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.263807 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17590  signal transduction histidine kinase  40.08 
 
 
326 aa  144  3e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0109488  normal  0.353356 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0971  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.8 
 
 
417 aa  143  7e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3104  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  43.78 
 
 
459 aa  142  1e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.8316  hitchhiker  0.000380562 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6699  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.2 
 
 
621 aa  141  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0085  putative signal transduction histidine kinase  42.92 
 
 
587 aa  130  3e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07210  histidine kinase  41.03 
 
 
237 aa  130  4e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0319  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.87 
 
 
382 aa  129  8e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.499307  normal  0.099987 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0811  histidine kinase  39.81 
 
 
580 aa  124  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2071  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.18 
 
 
725 aa  124  5e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.249392  normal  0.37167 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0967  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.77 
 
 
408 aa  123  6e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.849709 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11900  signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 
447 aa  121  2e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2540  putative signal transduction histidine kinase  38.07 
 
 
570 aa  120  4e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8723  Histidine kinase  37.95 
 
 
365 aa  120  4e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7224  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.37 
 
 
594 aa  114  4e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4245  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.71 
 
 
595 aa  110  5e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 
408 aa  109  8e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.155683  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2641  histidine kinase  31.28 
 
 
453 aa  108  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0175588  hitchhiker  0.00721729 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1533  histidine kinase  35.9 
 
 
451 aa  107  6e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0016197  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6491  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.74 
 
 
576 aa  101  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.194722  normal  0.40327 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1568  histidine kinase  31.43 
 
 
462 aa  99  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2605  Histidine kinase  36.97 
 
 
650 aa  98.2  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209527  normal  0.327771 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0631  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.85 
 
 
381 aa  97.4  5e-19  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  9.82334e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2603  Histidine kinase  38.65 
 
 
720 aa  96.7  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00739798  normal  0.140215 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3049  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.52 
 
 
565 aa  96.3  9e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0199075  normal  0.598323 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_600  sensor histidine kinase  31.88 
 
 
381 aa  94.7  3e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0751439  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0662  sensor histidine kinase  31.88 
 
 
381 aa  94.7  3e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1357  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.41 
 
 
403 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246673  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6031  Histidine kinase  36.18 
 
 
338 aa  93.6  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.542402  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3280  histidine kinase  32.79 
 
 
664 aa  93.2  9e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00155771  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3391  histidine kinase  33.33 
 
 
356 aa  93.2  9e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.382044  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0248  putative signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
470 aa  92  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2790  Sensor DegS domain protein  30.73 
 
 
393 aa  92.4  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3261  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
463 aa  91.3  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1983  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.14 
 
 
469 aa  90.9  5e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.143525 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>