More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1469 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1692  nucleotidyl transferase  73.59 
 
 
834 aa  1229    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.230386  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4397  nucleotidyl transferase  40.24 
 
 
832 aa  655    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1427  Nucleotidyl transferase  37.09 
 
 
827 aa  646    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1394  mannose-1-phosphate guanylyltransferase / phosphomannomutase  82.47 
 
 
832 aa  1394    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3420  nucleotidyl transferase  40.26 
 
 
835 aa  652    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3774  Nucleotidyl transferase  41.79 
 
 
830 aa  691    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1463  nucleotidyl transferase  69.41 
 
 
828 aa  1152    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0300765  normal  0.0105434 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0740  nucleotidyl transferase  40.84 
 
 
832 aa  652    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.2195  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2437  Nucleotidyl transferase  75.06 
 
 
827 aa  1263    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00386454  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4001  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  73.61 
 
 
828 aa  1240    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.755788  normal  0.793292 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1231  nucleotidyl transferase  68.79 
 
 
841 aa  1175    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.946144 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1469  Nucleotidyl transferase  100 
 
 
833 aa  1666    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5002  nucleotidyl transferase  67.91 
 
 
843 aa  1121    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1501  Nucleotidyl transferase  39.75 
 
 
842 aa  634  1e-180  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0900904  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2028  nucleotidyl transferase  38.8 
 
 
842 aa  628  1e-178  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0525  Nucleotidyl transferase  38.18 
 
 
840 aa  622  1e-177  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0182  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  38.1 
 
 
842 aa  622  1e-177  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150703  normal  0.0187588 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2912  Nucleotidyl transferase  38.95 
 
 
841 aa  623  1e-177  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3188  nucleotidyl transferase  37.38 
 
 
843 aa  607  9.999999999999999e-173  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00738142 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0788  Nucleotidyl transferase  38.21 
 
 
830 aa  598  1e-169  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.233183  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1961  nucleotidyl transferase  36.48 
 
 
816 aa  598  1e-169  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.333619  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3254  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  37.77 
 
 
836 aa  593  1e-168  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.450864  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3178  phosphoglucomutase/phosphomannomutase family protein  38.18 
 
 
836 aa  595  1e-168  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.335265 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1436  nucleotidyl transferase  40.81 
 
 
833 aa  594  1e-168  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.510504  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1040  nucleotidyl transferase  39.68 
 
 
818 aa  592  1e-167  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.189081  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0855  nucleotidyl transferase  37.09 
 
 
835 aa  585  1e-166  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0407  Nucleotidyl transferase  36.25 
 
 
835 aa  578  1.0000000000000001e-163  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2958  mannose-1-phosphate guanyltransferase  38.66 
 
 
842 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3402  Nucleotidyl transferase  36.83 
 
 
836 aa  575  1.0000000000000001e-162  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1079  nucleotidyl transferase  36.31 
 
 
820 aa  574  1.0000000000000001e-162  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0028  nucleotidyl transferase  35.65 
 
 
835 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3465  Nucleotidyl transferase  36.49 
 
 
836 aa  565  1.0000000000000001e-159  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1940  Nucleotidyl transferase  36.65 
 
 
818 aa  559  1e-158  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2334  nucleotidyl transferase  37.39 
 
 
828 aa  551  1e-155  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1001  Nucleotidyl transferase  34.69 
 
 
828 aa  547  1e-154  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0498  mannose-1-phosphate guanyltransferase  34.98 
 
 
837 aa  532  1e-149  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.149757 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15980  phosphoglucomutase  36.54 
 
 
820 aa  531  1e-149  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0348  Nucleotidyl transferase  32.77 
 
 
810 aa  530  1e-149  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1123  nucleotidyl transferase  36.76 
 
 
854 aa  510  1e-143  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1925  nucleotidyl transferase  37.53 
 
 
821 aa  466  1e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.175667 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1013  nucleotidyl transferase  31.36 
 
 
776 aa  442  9.999999999999999e-123  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4347  nucleotidyl transferase family protein  28.8 
 
 
784 aa  397  1e-109  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.114462  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4169  nucleotidyl transferase family protein  29.04 
 
 
784 aa  396  1e-109  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4007  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  29.04 
 
 
784 aa  396  1e-109  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4491  nucleotidyl transferase family protein  29.04 
 
 
784 aa  396  1e-109  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4287  nucleotidyl transferase family protein  28.92 
 
 
784 aa  394  1e-108  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.268164 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4017  nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase  28.92 
 
 
784 aa  393  1e-108  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.688327  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4400  nucleotidyl transferase family protein  28.89 
 
 
784 aa  394  1e-108  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4381  nucleotidyl transferase family protein  28.62 
 
 
784 aa  385  1e-105  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0233  Nucleotidyl transferase  36.29 
 
 
712 aa  380  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.779995  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4120  nucleotidyl transferase  28.19 
 
 
784 aa  382  1e-104  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0853  nucleotidyl transferase family protein  28.17 
 
 
784 aa  381  1e-104  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2995  nucleotidyl transferase  32.53 
 
 
785 aa  371  1e-101  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3282  nucleotidyl transferase  42.22 
 
 
370 aa  307  5.0000000000000004e-82  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.404178 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1852  nucleotidyl transferase  41.94 
 
 
370 aa  300  9e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1937  mannose-1-phosphate guanylyltransferase (GDP)  37.27 
 
 
392 aa  282  1e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.235204  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2250  nucleotidyl transferase  37.01 
 
 
399 aa  282  2e-74  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0940  Nucleotidyl transferase  37.67 
 
 
370 aa  276  1.0000000000000001e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1310  SMC domain-containing protein  35.2 
 
 
392 aa  273  7e-72  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2808  nucleotidyl transferase  43.4 
 
 
346 aa  270  1e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1993  nucleotidyl transferase  33.76 
 
 
392 aa  257  8e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.772939  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1208  nucleotidyltransferase family protein  36.67 
 
 
361 aa  254  4.0000000000000004e-66  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00478172  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_991  nucleotidyltransferase  37.61 
 
 
361 aa  252  2e-65  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00100816  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2168  Nucleotidyl transferase  33.86 
 
 
387 aa  251  3e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1787  nucleotidyl transferase  35.39 
 
 
348 aa  251  4e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1018  nucleotidyl transferase  36.39 
 
 
361 aa  251  5e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000995532  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2619  nucleotidyl transferase  34.72 
 
 
387 aa  249  2e-64  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2137  mannose-1-phosphate guanyltransferase  38.2 
 
 
343 aa  245  1.9999999999999999e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.908001  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0359  Nucleotidyl transferase  36.81 
 
 
347 aa  245  1.9999999999999999e-63  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4613  Nucleotidyl transferase  38.48 
 
 
366 aa  241  2.9999999999999997e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01801  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  38.51 
 
 
392 aa  241  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1973  mannose-1-phosphate guanyltransferase  37.92 
 
 
389 aa  241  5e-62  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.878472 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2404  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  38.86 
 
 
392 aa  240  8e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.271478  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3932  Nucleotidyl transferase  37.64 
 
 
381 aa  240  9e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.541197 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1143  nucleotidyl transferase  38.2 
 
 
388 aa  239  1e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00149781 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0289  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  38.25 
 
 
392 aa  238  5.0000000000000005e-61  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1899  nucleotidyl transferase  31.66 
 
 
387 aa  236  9e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.399282 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3113  nucleotidyl transferase  35.96 
 
 
349 aa  236  1.0000000000000001e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.409116  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01711  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  37.36 
 
 
392 aa  235  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.602072  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0154  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  37.36 
 
 
392 aa  236  2.0000000000000002e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01691  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  37.36 
 
 
392 aa  235  3e-60  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1518  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  37.05 
 
 
392 aa  233  1e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02241  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  37.05 
 
 
392 aa  233  1e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1239  Nucleotidyl transferase  34.8 
 
 
347 aa  232  2e-59  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1511  Nucleotidyl transferase  36.69 
 
 
388 aa  232  3e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00125436 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3422  nucleotidyl transferase  36.97 
 
 
389 aa  231  4e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4603  Nucleotidyl transferase  36.49 
 
 
329 aa  231  6e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.726116  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01681  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  37.95 
 
 
392 aa  228  3e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1624  nucleotidyl transferase  35.54 
 
 
367 aa  228  3e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.344481  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0925  Nucleotidyl transferase  35.57 
 
 
388 aa  226  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0952  Nucleotidyl transferase  35.57 
 
 
388 aa  226  1e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26731  putative sugar-phosphate nucleotidyl transferase  36.21 
 
 
392 aa  226  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1847  nucleotidyl transferase  36.41 
 
 
389 aa  222  1.9999999999999999e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.315582  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06180  Nucleoside-diphosphate-sugar pyrophosphorylase family protein  37.02 
 
 
359 aa  222  3e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0622435  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1064  Nucleotidyl transferase  37.57 
 
 
363 aa  220  8.999999999999998e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.292184  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1855  Nucleotidyl transferase  38.17 
 
 
370 aa  215  2.9999999999999995e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2225  phosphomannomutase / alpha-phosphoglucomutase  29.93 
 
 
458 aa  209  2e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.161781  normal  0.0953517 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4179  Nucleotidyl transferase  32.8 
 
 
365 aa  208  3e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.219549  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0827  nucleotidyl transferase  35.79 
 
 
388 aa  207  7e-52  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5876  nucleotidyl transferase  32.55 
 
 
357 aa  206  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.624445  normal  0.732322 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>