208 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0358 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0358  LAO/AO transport system ATPase  100 
 
 		 318 aa  624  1e-178  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1698  LAO/AO transport system ATPase  66.98 
 
 		 322 aa  389  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0238616  normal  0.0926246 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1798  LAO/AO transport system ATPase  63.34 
 
 		 323 aa  362  4e-99  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4110  LAO/AO transport system ATPase  61.9 
 
 		 316 aa  358  6e-98  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.162136  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1260  LAO/AO transport system ATPase  61.24 
 
 		 319 aa  357  9.999999999999999e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3990  LAO/AO transport system ATPase  62.18 
 
 		 329 aa  352  5e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00072705 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3609  LAO/AO transport system ATPase  60.63 
 
 		 345 aa  347  2e-94  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.802331 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5998  LAO/AO transport system ATPase  61.09 
 
 		 307 aa  337  1.9999999999999998e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0515982 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1045  LAO/AO transport system ATPase  59.26 
 
 		 356 aa  332  4e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.172221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2170  LAO/AO transport system ATPase  58.9 
 
 		 341 aa  314  9.999999999999999e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.300615  normal  0.661007 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1853  LAO/AO transport system ATPase  45.45 
 
 		 309 aa  287  2e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1576  ArgK protein  47.12 
 
 		 320 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000113447  normal  0.451299 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2025  LAO/AO transport system ATPase  49.03 
 
 		 312 aa  284  2.0000000000000002e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82524  decreased coverage  0.000989669 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3108  LAO/AO transport system ATPase  52.26 
 
 		 304 aa  283  4.0000000000000003e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0453606 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0456  LAO/AO transport system ATPase  47.37 
 
 		 325 aa  280  2e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.614853 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4647  LAO/AO transport system ATPase  49.68 
 
 		 325 aa  273  4.0000000000000004e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0480374  normal  0.487392 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2365  LAO/AO transport system ATPase  46.79 
 
 		 318 aa  272  5.000000000000001e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0943  LAO/AO transport system ATPase  46.6 
 
 		 314 aa  271  8.000000000000001e-72  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2533  LAO/AO transport system ATPase  48.24 
 
 		 316 aa  269  5e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.227946  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3795  LAO/AO transport system ATPase  52.77 
 
 		 290 aa  268  1e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.203827  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3868  LAO/AO transport system ATPase  52.77 
 
 		 290 aa  268  1e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.119113  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3799  LAO/AO transport system ATPase  52.77 
 
 		 290 aa  268  1e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.205117  normal  0.899663 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2160  LAO/AO transport system ATPase  49.4 
 
 		 341 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.104519 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2999  LAO/AO transport system ATPase  48.38 
 
 		 316 aa  267  1e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0703569 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2027  LAO/AO transport system ATPase  44.48 
 
 		 316 aa  267  2e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00170815  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1579  LAO/AO transport system ATPase  46.79 
 
 		 319 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1674  LAO/AO transport system ATPase  45.42 
 
 		 312 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1549  LAO/AO transport system ATPase  46.41 
 
 		 314 aa  266  5e-70  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000360873 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0899  LAO/AO transport system ATPase  44.8 
 
 		 357 aa  265  7e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2690  LAO/AO transport system ATPase  46.08 
 
 		 314 aa  265  8e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249774  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3988  LAO/AO transport system ATPase  49.19 
 
 		 324 aa  265  8.999999999999999e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0138367  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0586  LAO/AO transport system ATPase  48.39 
 
 		 310 aa  262  6.999999999999999e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.585715  normal  0.982729 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2297  LAO/AO transport system ATPase  47.8 
 
 		 344 aa  260  2e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.413391  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2806  LAO/AO transport system ATPase  45.28 
 
 		 326 aa  259  5.0000000000000005e-68  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0864794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2473  LAO/AO transport system ATPase  44.02 
 
 		 375 aa  258  1e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2209  LAO/AO transport system ATPase  47.51 
 
 		 344 aa  258  1e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.249756  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0673  LAO/AO transport system ATPase  55.69 
 
 		 340 aa  256  5e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1649  LAO/AO transport system ATPase  47.81 
 
 		 344 aa  255  6e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.840992  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3009  LAO/AO transport system ATPase  48.52 
 
 		 308 aa  254  1.0000000000000001e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.072512 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0511  LAO/AO transport system ATPase  44.9 
 
 		 378 aa  254  1.0000000000000001e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0389  LAO/AO transport system ATPase  43.69 
 
 		 317 aa  252  5.000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000146012  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4359  LAO/AO transport system ATPase  43.48 
 
 		 364 aa  252  5.000000000000001e-66  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.460456  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3103  LAO/AO transport system ATPase  50.31 
 
 		 335 aa  251  8.000000000000001e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0011081  hitchhiker  0.0000652797 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0801  LAO/AO transport system ATPase  59.36 
 
 		 299 aa  251  9.000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1268  LAO/AO transport system ATPase  43.23 
 
 		 312 aa  248  1e-64  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1281  LAO/AO transport system ATPase  46.56 
 
 		 317 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.417761  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4250  LAO/AO transport system ATPase  50.99 
 
 		 322 aa  246  4.9999999999999997e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3772  LAO/AO transport system ATPase  44.34 
 
 		 318 aa  243  3e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.339101 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1321  LAO/AO transport system ATPase  44.28 
 
 		 312 aa  242  7.999999999999999e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2397  LAO/AO transport system ATPase  51.53 
 
 		 303 aa  239  5e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.73846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1911  LAO/AO transport system ATPase  41.64 
 
 		 318 aa  236  3e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0463697  normal  0.161513 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1770  LAO/AO transport system ATPase  42.39 
 
 		 322 aa  236  4e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.292624  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0540  putative transport system kinase  44.72 
 
 		 327 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.167721  hitchhiker  0.00219183 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4301  LAO/AO transport system ATPase  51.54 
 
 		 292 aa  234  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.635078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5042  LAO/AO transport system ATPase  53.78 
 
 		 329 aa  232  5e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.13609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3656  LAO/AO transport system ATPase  41.46 
 
 		 323 aa  232  6e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.959092  normal  0.164513 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2130  LAO/AO transport system ATPase  44.3 
 
 		 327 aa  231  8.000000000000001e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2690  LAO/AO transport system ATPase  44.44 
 
 		 321 aa  229  4e-59  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0512  LAO/AO transport system ATPase  46.75 
 
 		 300 aa  229  6e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1613  LAO/AO transport system ATPase  48.2 
 
 		 312 aa  228  9e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.375817 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5087  LAO/AO transport system ATPase  43.79 
 
 		 333 aa  226  3e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0342  arginine/ornithine transport system ATPase  43.96 
 
 		 329 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0298  arginine/ornithine transport system ATPase  43.96 
 
 		 346 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.206617 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0581  LAO/AO transport system ATPase  42.32 
 
 		 292 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.730832  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0153  LAO/AO transport system ATPase  48.16 
 
 		 296 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.677625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1945  arginine/ornithine transport system ATPase  43.26 
 
 		 332 aa  214  9.999999999999999e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.522383 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05690  arginine/ornithine transport system ATPase  42.32 
 
 		 333 aa  213  2.9999999999999995e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5020  LAO/AO transport system ATPase  41.75 
 
 		 332 aa  213  2.9999999999999995e-54  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.778595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2478  arginine/ornithine transport system ATPase  40.88 
 
 		 333 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.341293  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4372  LAO/AO transport system ATPase  44.41 
 
 		 329 aa  213  4.9999999999999996e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3302  LAO/AO transport system ATPase  40.97 
 
 		 374 aa  212  5.999999999999999e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.107074  normal  0.916816 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0374  arginine/ornithine transport system ATPase  43.55 
 
 		 329 aa  211  1e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3019  arginine/ornithine transport system ATPase  42.68 
 
 		 330 aa  209  5e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.527055 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1086  arginine/ornithine transport system ATPase  44.75 
 
 		 345 aa  208  9e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3480  arginine/ornithine transport system ATPase  42.77 
 
 		 328 aa  206  3e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.46606  normal  0.0872871 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3542  arginine/ornithine transport system ATPase  40.74 
 
 		 330 aa  206  4e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.749977 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3121  arginine/ornithine transport system ATPase  44.4 
 
 		 325 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3182  arginine/ornithine transport system ATPase  44.4 
 
 		 325 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.968151  normal  0.139966 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3132  arginine/ornithine transport system ATPase  44.4 
 
 		 325 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.151852  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5546  LAO/AO transport system ATPase  46.24 
 
 		 372 aa  205  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2421  LAO/AO transport system ATPase  43.71 
 
 		 343 aa  204  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1360  LAO/AO transport system ATPase  36.59 
 
 		 316 aa  203  4e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000000000000108838  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2504  LAO/AO transport system ATPase  44.44 
 
 		 329 aa  202  4e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000648266  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2490  arginine/ornithine transport system ATPase  45.15 
 
 		 328 aa  203  4e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1780  LAO/AO transport system ATPase  54.85 
 
 		 321 aa  202  5e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2114  arginine/ornithine transport system ATPase  44.41 
 
 		 326 aa  202  6e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00605272 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2763  arginine/ornithine transport system ATPase  43.62 
 
 		 332 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3004  arginine/ornithine transport system ATPase  42.68 
 
 		 364 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.487769  normal  0.192606 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1705  arginine/ornithine transport system ATPase  39.69 
 
 		 346 aa  200  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.476262  normal  0.0539762 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3189  arginine/ornithine transport system ATPase  41.83 
 
 		 322 aa  200  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306084  normal  0.363793 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2764  arginine/ornithine transport system ATPase  42.63 
 
 		 331 aa  199  5e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0468013  normal  0.748538 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3543  LAO/AO transport system ATPase  46.62 
 
 		 328 aa  199  6e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.569209  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1922  arginine/ornithine transport system ATPase  40.45 
 
 		 330 aa  199  7e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.597439 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2210  ArgK protein  39.48 
 
 		 330 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000516978  normal  0.0100138 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2033  arginine/ornithine transport system ATPase  39.51 
 
 		 329 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0955  LAO/AO transport system ATPase  36.89 
 
 		 305 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0032483 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3648  arginine/ornithine transport system ATPase  42.58 
 
 		 332 aa  196  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0078  LAO/AO transport system ATPase  39.08 
 
 		 331 aa  195  9e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0546  arginine/ornithine transport system ATPase  42.29 
 
 		 378 aa  194  1e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3873  arginine/ornithine transport system ATPase  40.74 
 
 		 380 aa  193  3e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0439716  normal  0.14687 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>