151 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3186 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3186  glycosyl transferase group 1  100 
 
 
414 aa  819    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00148125  hitchhiker  0.0000469398 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0784  hypothetical protein  39.79 
 
 
408 aa  236  8e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.246481 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3949  glycosyl transferase, group 1  37.91 
 
 
371 aa  213  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3201  hypothetical protein  31.1 
 
 
391 aa  127  5e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1684  glycosyl transferase, group 1  36.09 
 
 
416 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3879  glycosyl transferase group 1  33.05 
 
 
435 aa  117  3.9999999999999997e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0909048  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0512  glycosyl transferase group 1  41.25 
 
 
274 aa  114  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2362  hypothetical protein  30.33 
 
 
413 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0257  glycosyl transferase family 2  34.72 
 
 
1340 aa  108  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3294  glycosyl transferase group 1  28.67 
 
 
402 aa  100  7e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0823  glycosyl transferase group 1  43.48 
 
 
411 aa  99.4  1e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3661  glycosyl transferase group 1  37.43 
 
 
388 aa  97.8  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3182  glycosyl transferase, group 1  29.11 
 
 
406 aa  97.4  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1627  glycosyl transferase group 1  29.12 
 
 
432 aa  97.1  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.154338  normal  0.324472 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0520  glycosyl transferase group 1  29.46 
 
 
499 aa  94.4  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.22361  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1340  glycosyl transferase, group 1  28.72 
 
 
410 aa  94.7  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3003  hypothetical protein  27.85 
 
 
402 aa  94  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.157248  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35650  hypothetical protein  30.71 
 
 
402 aa  90.9  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.793748  hitchhiker  0.00000000053006 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4281  glycosyl transferase group 1  33.78 
 
 
418 aa  90.9  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0930783  normal  0.115686 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1481  glycosyltransferase-like protein  28.05 
 
 
1119 aa  89.4  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3183  glycosyl transferase, group 1  24.71 
 
 
404 aa  88.6  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0568  glycosyl transferase group 1  45.45 
 
 
394 aa  88.6  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0408  glycosyl transferase group 1  36.42 
 
 
410 aa  87.8  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0800  glycosyl transferase group 1  30.74 
 
 
405 aa  85.9  0.000000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0289  glycosyl transferase group 1  36.63 
 
 
406 aa  85.1  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01594  glycosyltransferase  35.81 
 
 
700 aa  85.5  0.000000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0672  glycosyl transferase, group 1  30.72 
 
 
404 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.203842  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0733  hypothetical protein  30.08 
 
 
409 aa  85.1  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3594  glycosyl transferase, group 1  37.5 
 
 
421 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0454071 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2512  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  30.43 
 
 
413 aa  84.7  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.191861 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3105  glycosyl transferases group 1  34.38 
 
 
399 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.147313  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2501  glycosyl transferase group 1  26.74 
 
 
414 aa  83.6  0.000000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0929  a-glycosyltransferase  25 
 
 
397 aa  82.8  0.000000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0122739 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3796  glycosyl transferase, group 1  33.55 
 
 
387 aa  82.8  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2000  glycosyl transferase, group 1  26.46 
 
 
403 aa  82  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0145  hypothetical protein  28.67 
 
 
414 aa  80.9  0.00000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4233  glycosyl transferase, group 1  33.12 
 
 
405 aa  81.3  0.00000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.968175  hitchhiker  0.000923088 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02591  Glycosyl transferase, group 1  27.74 
 
 
360 aa  80.5  0.00000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.527866  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2482  group 1 glycosyl transferase  27.85 
 
 
399 aa  79  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0288582  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2599  glycosyl transferase group 1  32 
 
 
956 aa  79.3  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0417  glycosyl transferase group 1  35.29 
 
 
402 aa  79  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0824  glycosyl transferase group 1  28.86 
 
 
407 aa  79  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0791  glycosyl transferase family 2  36.49 
 
 
691 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.62869  normal  0.0614605 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0141  glycosyl transferase, group 1  33.73 
 
 
417 aa  78.2  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154481  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4281  glycosyl transferase, group 1  25.73 
 
 
405 aa  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.498177  hitchhiker  0.00385385 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0590  glycosyl transferase, group 1  30.06 
 
 
399 aa  77.4  0.0000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.413906 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0773  glycosyl transferase, group 1  33.14 
 
 
396 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.784478  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1515  glycosyl transferase, group 1  33.16 
 
 
417 aa  77  0.0000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0777934  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4699  glycosyl transferase, group 1  28.85 
 
 
409 aa  76.6  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.793347  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1921  glycosyl transferase, group 1  38.99 
 
 
401 aa  76.3  0.0000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2522  glycosyl transferase, group 1  25.87 
 
 
401 aa  75.9  0.000000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.165629  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1178  glycosyl transferase, group 1  24.37 
 
 
376 aa  75.5  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0762  glycosyl transferase, group 1  32.76 
 
 
422 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0146  glycosyl transferase, group 1  26.79 
 
 
402 aa  75.1  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0724066 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2970  glycosyltransferase-like protein  34.45 
 
 
394 aa  75.1  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.360933  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3274  sugar transferase, PEP-CTERM/EpsH1 system associated  32.24 
 
 
429 aa  75.1  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.736757  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0831  glycosyl transferase family protein  33.15 
 
 
691 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.74925  normal  0.236177 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0157  glycosyltransferase-like protein  25.27 
 
 
402 aa  74.7  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1964  sugar transferase  28.76 
 
 
443 aa  74.3  0.000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.23345  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1898  glycosyl transferase group 1  28.76 
 
 
443 aa  74.7  0.000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3252  glycosyl transferase group 1  30.12 
 
 
409 aa  73.9  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3977  glycosyl transferase, group 1  26.04 
 
 
412 aa  73.9  0.000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.696397 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0734  glycosyltransferase-like protein  29.88 
 
 
442 aa  73.9  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0462  glycosyl transferase group 1  29.19 
 
 
408 aa  73.9  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4192  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
417 aa  73.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4231  glycosyl transferase group 1  28.57 
 
 
417 aa  73.9  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00915385 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0405  glycosyl transferase group 1  21.63 
 
 
400 aa  73.2  0.000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.302496 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01296  glycosyltransferase  26.01 
 
 
354 aa  72.4  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.983218  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4535  glycosyl transferase family protein  35.44 
 
 
760 aa  72.8  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0741652  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2329  glycosyl transferase, group 1  34.32 
 
 
410 aa  72  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.285822  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1550  glycosyl transferase, group 1  24.59 
 
 
414 aa  72  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0173258  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0754  glycosyl transferase family 2  35.42 
 
 
691 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.235056 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1979  glycosyl transferase group 1  32.59 
 
 
429 aa  71.6  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2065  glycosyl transferase, group 1  40.87 
 
 
407 aa  70.5  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.558513 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0636  glycosyl transferase group 1  29.81 
 
 
389 aa  70.5  0.00000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0521552  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2405  glycosyl transferase, group 1  29.52 
 
 
406 aa  69.7  0.00000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0930  a-glycosyltransferase  23.57 
 
 
396 aa  70.1  0.00000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0131712 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0023  glycosyl transferase family 2  24.39 
 
 
703 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0300  glycosyl transferase group 1  29.81 
 
 
399 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0300  glycosyl transferase group 1  29.81 
 
 
399 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2668  hypothetical protein  30.49 
 
 
399 aa  68.6  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.441319  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0401  glycosyl transferase, group 1  35.61 
 
 
397 aa  68.2  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3535  glycosyl transferase, group 1 family protein PslH  23.63 
 
 
405 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.937729  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2350  glycosyl transferase, group 1  32.05 
 
 
422 aa  68.2  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.234853  normal  0.935785 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1089  glycosyl transferase group 1  31.52 
 
 
392 aa  68.2  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3169  glycosyl transferase, group 1  27.27 
 
 
456 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4038  glycosyl transferase, group 1  32.48 
 
 
396 aa  67.4  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.277047  normal  0.431033 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3986  glycosyl transferase group 1  31.15 
 
 
535 aa  67.8  0.0000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.530691  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2880  glycosyl transferase, group 1  33.93 
 
 
391 aa  67.4  0.0000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00760394 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2468  glycosyl transferase, group 1  26.05 
 
 
413 aa  67  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00973  glycosyltransferase  24.71 
 
 
860 aa  65.5  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0118  glycosyl transferase family 2  27.5 
 
 
1156 aa  65.5  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07620  hypothetical protein  23.5 
 
 
410 aa  64.7  0.000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5252  glycosyl transferase, group 1  29.63 
 
 
468 aa  64.7  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.371097 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1494  glycosyl transferase, group 1  32.21 
 
 
435 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1800  glycosyltransferase  25.13 
 
 
402 aa  63.9  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2866  glycosyl transferase group 1  25 
 
 
410 aa  63.5  0.000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.614431  hitchhiker  0.0000195595 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0314  hypothetical protein  38.85 
 
 
369 aa  61.6  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0166902 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1308  glycosyl transferase, group 1  41.25 
 
 
399 aa  61.6  0.00000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.700718  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1213  glycosyl transferase family protein  25.97 
 
 
683 aa  62.4  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>