83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2311 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2311  protein of unknown function DUF107  100 
 
 		 143 aa  273  4e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00380708  hitchhiker  0.000930423 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3420  protein of unknown function DUF107  53.62 
 
 		 143 aa  108  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19790  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  46.72 
 
 		 143 aa  98.6  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000333903 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2090  protein of unknown function DUF107  46.48 
 
 		 143 aa  91.7  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3654  hypothetical protein  40.74 
 
 		 144 aa  90.1  9e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.642811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11516  hypothetical protein  44.53 
 
 		 144 aa  87.4  5e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.145618 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2052  protein of unknown function DUF107  47.83 
 
 		 157 aa  87.4  6e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1933  protein of unknown function DUF107  39.13 
 
 		 154 aa  87.4  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000898113 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3263  hypothetical protein  43.26 
 
 		 143 aa  85.1  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.154765  normal  0.527503 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3138  hypothetical protein  42.86 
 
 		 144 aa  84  7e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.293022  normal  0.761623 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2226  putative integral membrane protein  43.2 
 
 		 146 aa  84  7e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3188  hypothetical protein  42.86 
 
 		 144 aa  84  7e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.258766 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3127  hypothetical protein  42.86 
 
 		 144 aa  84  7e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3245  hypothetical protein  44.68 
 
 		 156 aa  83.2  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1351  hypothetical protein  39.26 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.927831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1155  hypothetical protein  46.15 
 
 		 143 aa  80.1  0.000000000000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.21889  normal  0.55377 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3019  hypothetical protein  43.26 
 
 		 167 aa  80.1  0.000000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.336534  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0361  hypothetical protein  35.38 
 
 		 141 aa  80.1  0.00000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.213386 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2314  protein of unknown function DUF107  40.43 
 
 		 181 aa  77.4  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2413  protein of unknown function DUF107  44.8 
 
 		 141 aa  77  0.00000000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2190  hypothetical protein  45.26 
 
 		 153 aa  75.5  0.0000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00820926  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14650  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  37.32 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000389934  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2577  hypothetical protein  36.23 
 
 		 153 aa  74.7  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.869725  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2314  protein of unknown function DUF107  40.86 
 
 		 142 aa  73.6  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0062  hypothetical protein  34.51 
 
 		 140 aa  71.2  0.000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.351134  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0062  hypothetical protein  35.42 
 
 		 140 aa  71.2  0.000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0560345  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1428  protein of unknown function DUF107  41.26 
 
 		 152 aa  69.3  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2309  hypothetical protein  32.87 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3685  protein of unknown function DUF107  42.53 
 
 		 143 aa  67  0.00000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.384963 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2500  hypothetical protein  41.43 
 
 		 144 aa  66.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.492618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1178  protein of unknown function DUF107  37.14 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.463854  hitchhiker  0.00363544 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4808  protein of unknown function DUF107  41.76 
 
 		 143 aa  65.9  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8849  protein of unknown function DUF107  44.09 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0728  hypothetical protein  31.62 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3440  protein of unknown function DUF107  38.46 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.782019  normal  0.877312 
 
 
-
 
NC_002950  PG1335  hypothetical protein  34.85 
 
 		 154 aa  63.2  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2758  hypothetical protein  41.53 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.282751 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2110  protein of unknown function DUF107  36.62 
 
 		 147 aa  60.8  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1923  hypothetical protein  30.08 
 
 		 142 aa  57  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.126265  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0403  hypothetical protein  32.65 
 
 		 143 aa  56.6  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.168649 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2145  hypothetical protein  29.5 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2173  hypothetical protein  29.5 
 
 		 142 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2074  hypothetical protein  30.22 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1889  hypothetical protein  30.22 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1927  hypothetical protein  30.22 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2105  hypothetical protein  30.22 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3244  hypothetical protein  30.22 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00265616  normal  0.45038 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1559  hypothetical protein  31.03 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.151405  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2063  hypothetical protein  29.5 
 
 		 142 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00757659  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1879  hypothetical protein  28.78 
 
 		 142 aa  54.7  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1329  hypothetical protein  30.08 
 
 		 136 aa  53.5  0.0000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.259806  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3088  protein of unknown function DUF107  42.86 
 
 		 160 aa  52  0.000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.020627 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1505  hypothetical protein  30.82 
 
 		 147 aa  50.4  0.000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.121654  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0418  protein of unknown function DUF107  30.71 
 
 		 150 aa  48.9  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0465  protein of unknown function DUF107  30.66 
 
 		 147 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0479  protein of unknown function DUF107  30.66 
 
 		 147 aa  47.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4625  hypothetical protein  32.43 
 
 		 145 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.165584 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3608  protein of unknown function DUF107  29.29 
 
 		 151 aa  47  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004151  putative activity regulator of membrane protease YbbK  26.76 
 
 		 153 aa  46.2  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1025  protein of unknown function DUF107  36.75 
 
 		 453 aa  46.6  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3306  protein of unknown function DUF107  29.41 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.471898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4889  hypothetical protein  31.08 
 
 		 145 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0908212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4304  hypothetical protein  31.88 
 
 		 149 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1989  nodulation efficiency protein NfeD  29.37 
 
 		 473 aa  45.1  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00554582  normal  0.0711803 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2246  protein of unknown function DUF107  26.28 
 
 		 143 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0353999 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6549  protein of unknown function DUF107  30.94 
 
 		 144 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4711  hypothetical protein  32.43 
 
 		 145 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.396133 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2216  hypothetical protein  30.94 
 
 		 148 aa  43.9  0.0008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00884783  normal  0.106638 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01316  hypothetical protein  26.12 
 
 		 153 aa  43.9  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18360  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  32.61 
 
 		 141 aa  42.7  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.54278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4268  hypothetical protein  28.78 
 
 		 153 aa  42.7  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4844  hypothetical protein  28.57 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4833  SURF1 domain-containing protein  32.43 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474537  normal  0.511856 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2365  hypothetical protein  29.33 
 
 		 157 aa  42.4  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21700  membrane protein implicated in regulation of membrane protease activity  40.88 
 
 		 154 aa  41.6  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.201609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000357  nfed family protein  31.69 
 
 		 458 aa  42  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0609  protein of unknown function DUF107  28.95 
 
 		 154 aa  42  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1152  hypothetical protein  31.47 
 
 		 153 aa  42  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.243195  hitchhiker  0.000000302368 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2736  hypothetical protein  28.87 
 
 		 153 aa  41.6  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355478  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1704  nucleolar GTP-binding 1  36.11 
 
 		 154 aa  41.6  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0532  protein of unknown function DUF107  31.43 
 
 		 167 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.710342 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2940  hypothetical protein  29.57 
 
 		 146 aa  40.8  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00270236  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1033  protein of unknown function DUF107  30.71 
 
 		 149 aa  40  0.01  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>