141 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1809 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_1809  copper resistance D domain protein  100 
 
 		 686 aa  1333    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00146135  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11750  predicted membrane protein  47.85 
 
 		 651 aa  573  1.0000000000000001e-162  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.411615 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1122  copper resistance D domain protein  47.6 
 
 		 687 aa  536  1e-151  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2024  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  46.53 
 
 		 675 aa  528  1e-148  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3617  copper resistance D  48.07 
 
 		 665 aa  508  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3690  copper resistance D domain-containing protein  48.07 
 
 		 665 aa  508  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3622  copper resistance D domain-containing protein  48.07 
 
 		 665 aa  507  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2566  copper resistance D domain-containing protein  47.6 
 
 		 676 aa  465  1e-129  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.420884 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4073  copper resistance D domain-containing protein  47.91 
 
 		 672 aa  458  1e-127  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.794001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2572  membrane protein-like protein  44.72 
 
 		 678 aa  445  1e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.886769 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1244  copper resistance D domain-containing protein  43.55 
 
 		 664 aa  422  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.774538  normal  0.0784531 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6178  copper resistance D domain-containing protein  41.6 
 
 		 691 aa  405  1e-111  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0625  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  42.54 
 
 		 731 aa  400  9.999999999999999e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0427977  normal  0.664507 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0963  hypothetical protein  41.4 
 
 		 692 aa  398  1e-109  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0463859  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0172  copper resistance D domain-containing protein  44.09 
 
 		 651 aa  397  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3692  copper resistance D domain-containing protein  41.21 
 
 		 642 aa  392  1e-107  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16830  predicted membrane protein  40.61 
 
 		 708 aa  390  1e-107  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0178654 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0186  copper resistance D domain-containing protein  43.45 
 
 		 679 aa  387  1e-106  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000295959 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3124  copper resistance D domain protein  42.61 
 
 		 681 aa  387  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.638358  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3915  copper resistance D domain-containing protein  37.18 
 
 		 718 aa  383  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26540  predicted membrane protein  39.39 
 
 		 631 aa  372  1e-101  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.280194 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3717  copper resistance D domain protein  40.49 
 
 		 718 aa  371  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2826  copper resistance D domain-containing protein  40.61 
 
 		 646 aa  367  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.169326  normal  0.177873 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5682  copper resistance D domain-containing protein  41.14 
 
 		 641 aa  365  2e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.50669 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5328  copper resistance D domain-containing protein  41.14 
 
 		 641 aa  365  2e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.102981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5367  copper resistance D domain-containing protein  39.9 
 
 		 637 aa  361  2e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.164782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2770  copper resistance D domain protein  40.71 
 
 		 632 aa  356  1e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00801139  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4275  copper resistance D domain protein  44.42 
 
 		 671 aa  350  7e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.978208  normal  0.70457 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2795  copper resistance D  37.57 
 
 		 736 aa  347  4e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3955  copper resistance D domain protein  45.34 
 
 		 722 aa  343  9e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.58708  normal  0.101965 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10103  integral membrane protein  50.96 
 
 		 661 aa  332  1e-89  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35680  predicted membrane protein  40.57 
 
 		 708 aa  326  7e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4446  copper resistance D domain-containing protein  40.52 
 
 		 697 aa  325  1e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4566  putative copper resistance protein D  33.29 
 
 		 739 aa  314  3.9999999999999997e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3220  copper resistance D domain protein  40.57 
 
 		 711 aa  312  1e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19110  predicted membrane protein  37.83 
 
 		 752 aa  306  8.000000000000001e-82  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00604286  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2471  copper resistance D domain-containing protein  38.1 
 
 		 719 aa  305  2.0000000000000002e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.812246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21870  predicted membrane protein  40.92 
 
 		 671 aa  300  7e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2448  copper resistance D domain protein  36.66 
 
 		 687 aa  291  3e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.020578 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3374  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  40.48 
 
 		 683 aa  271  2.9999999999999997e-71  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0136248  hitchhiker  0.00734648 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2617  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  44.89 
 
 		 654 aa  251  2e-65  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1123  integral membrane protein  46.1 
 
 		 319 aa  226  1e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1345  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  42.57 
 
 		 319 aa  219  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0477592  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1675  hypothetical protein  40.94 
 
 		 310 aa  205  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.247062 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0074  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  31.55 
 
 		 613 aa  205  3e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3816  copper resistance D domain protein  38.64 
 
 		 651 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.733189  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3528  hypothetical protein  39.85 
 
 		 322 aa  185  3e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000675219 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3296  hypothetical protein  39.03 
 
 		 322 aa  181  2.9999999999999997e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.252949  normal  0.179007 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3133  hypothetical protein  36.24 
 
 		 328 aa  180  9e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4448  hypothetical protein  35.19 
 
 		 322 aa  164  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5665  hypothetical protein  32.48 
 
 		 331 aa  145  3e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5346  hypothetical protein  32.48 
 
 		 331 aa  144  4e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3709  hypothetical protein  32.76 
 
 		 326 aa  141  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2813  hypothetical protein  32.41 
 
 		 331 aa  141  4.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5381  hypothetical protein  33.45 
 
 		 308 aa  140  7.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0092  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  32.17 
 
 		 307 aa  131  5.0000000000000004e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4532  copper resistance D domain protein  28.74 
 
 		 653 aa  129  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.405596 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17480  hypothetical protein  32.08 
 
 		 273 aa  108  5e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870932  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1131  integral membrane protein  26.37 
 
 		 327 aa  104  6e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0081  hypothetical protein  34.62 
 
 		 254 aa  103  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1987  putative copper resistance protein D  30.23 
 
 		 354 aa  100  8e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2207  hypothetical protein  28.47 
 
 		 387 aa  100  9e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2497  putative copper resistance protein D  29.87 
 
 		 394 aa  97.4  8e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.128305  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2828  hypothetical protein  25.09 
 
 		 274 aa  91.7  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.266465  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3144  hypothetical protein  26.01 
 
 		 265 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.258333  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3122  hypothetical protein  25.37 
 
 		 277 aa  86.3  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2901  hypothetical protein  25 
 
 		 277 aa  85.1  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.104902  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3119  hypothetical protein  25 
 
 		 277 aa  85.1  0.000000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2871  hypothetical protein  24.63 
 
 		 277 aa  84.3  0.000000000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.016033  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4137  hypothetical protein  28.83 
 
 		 315 aa  80.1  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0485856  normal  0.510961 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0855  putative inner membrane protein  24.16 
 
 		 296 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2884  putative inner membrane protein  22.46 
 
 		 289 aa  74.7  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.712749  normal  0.419558 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00580  putative copper export protein  31.53 
 
 		 343 aa  74.3  0.000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0706587  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2485  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  23.97 
 
 		 326 aa  73.2  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.583606  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1238  putative inner membrane protein  22.26 
 
 		 294 aa  72.4  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1098  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  34.67 
 
 		 246 aa  70.9  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.69968  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2875  hypothetical protein  25.19 
 
 		 290 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.922757  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1749  hypothetical protein  25.19 
 
 		 290 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.185499  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2447  hypothetical protein  25.19 
 
 		 290 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2834  hypothetical protein  25.19 
 
 		 290 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.395343  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2760  hypothetical protein  25.19 
 
 		 290 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2819  hypothetical protein  25.19 
 
 		 290 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.286067  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1770  hypothetical protein  25.19 
 
 		 290 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25350  putative copper export protein  26.07 
 
 		 604 aa  67.4  0.0000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.517394  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0040  copper resistance D domain protein  34.55 
 
 		 339 aa  67.4  0.0000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0562  hypothetical protein  24.9 
 
 		 266 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.522678  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4266  membrane protein  25.83 
 
 		 289 aa  64.3  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.991106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3554  membrane protein-like protein  27.69 
 
 		 264 aa  61.2  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.149309 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1445  hypothetical protein  28.2 
 
 		 300 aa  60.8  0.00000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0680793  normal  0.372569 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1036  membrane protein  24.63 
 
 		 290 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.675997  normal  0.424179 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21060  predicted membrane protein  32.87 
 
 		 277 aa  60.5  0.0000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1898  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  24.81 
 
 		 290 aa  58.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.903451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2018  hypothetical protein  25.77 
 
 		 549 aa  58.2  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000046184  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3065  copper resistance protein CopC  29.2 
 
 		 578 aa  57.8  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000363543  decreased coverage  0.00940115 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1997  hypothetical protein  26.67 
 
 		 544 aa  57.4  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259968  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4602  Cytochrome c oxidase caa3-type, assembly factor CtaG-related protein  25.1 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1731  copper resistance protein  25.67 
 
 		 547 aa  56.6  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119991  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6848  hypothetical protein  27.69 
 
 		 343 aa  57  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0675  membrane protein  24.62 
 
 		 289 aa  56.2  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2267  membrane protein-like protein  28.57 
 
 		 265 aa  55.8  0.000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>