More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1578 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_1578  CBS domain containing protein  100 
 
 
537 aa  1044    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.110465  normal  0.116098 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3465  hypothetical protein  59.08 
 
 
436 aa  464  1e-129  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0200076 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3454  hypothetical protein  59.08 
 
 
436 aa  464  1e-129  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0757862  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3517  hypothetical protein  59.08 
 
 
436 aa  464  1e-129  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.70435 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1251  CBS domain-containing protein  60.95 
 
 
435 aa  455  1e-127  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12392  transmembrane protein  58.45 
 
 
435 aa  455  1e-127  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1660  CBS domain containing protein  58.99 
 
 
461 aa  449  1e-125  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3830  CBS domain-containing protein  59.19 
 
 
464 aa  445  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3157  CBS domain containing protein  55.74 
 
 
490 aa  439  9.999999999999999e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.00650526  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3451  CBS domain-containing protein  58.97 
 
 
464 aa  435  1e-121  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.553184  normal  0.0782726 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13600  CBS domain-containing protein  59.75 
 
 
457 aa  435  1e-121  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2708  CBS domain-containing protein  57.73 
 
 
432 aa  432  1e-120  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.642417 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3830  CBS domain-containing protein  58.6 
 
 
432 aa  434  1e-120  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4625  CBS domain-containing protein  58.51 
 
 
426 aa  431  1e-119  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.373685  hitchhiker  0.00665585 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2760  protein of unknown function DUF21  56.59 
 
 
437 aa  429  1e-119  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.24757  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3245  protein of unknown function DUF21  57.93 
 
 
442 aa  416  9.999999999999999e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0319126  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2297  Hemolysin and related protein containing CBS domains-like protein  56.76 
 
 
434 aa  412  1e-113  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0791  CBS domain-containing protein  57.76 
 
 
483 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.847387  normal  0.143113 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1158  CBS domain-containing protein  54.7 
 
 
452 aa  395  1e-109  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.992942  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1914  CBS domain-containing protein  51.97 
 
 
430 aa  397  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7047  CBS domain containing protein  53.96 
 
 
425 aa  385  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1269  CBS  52.61 
 
 
454 aa  365  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.183003 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2114  CBS domain-containing protein  52.25 
 
 
484 aa  363  3e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3385  CBS domain containing protein  49 
 
 
438 aa  327  5e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.669345 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11750  CBS domain-containing protein  47.16 
 
 
495 aa  324  3e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.885708  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0846  CBS domain-containing protein  47.1 
 
 
439 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.330981  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1967  CBS domain containing protein  44.91 
 
 
443 aa  313  3.9999999999999997e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000080224 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0709  CBS domain containing protein  45.68 
 
 
465 aa  300  5e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2230  CBS domain-containing protein  45.61 
 
 
447 aa  294  2e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00904717  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2204  CBS domain containing protein  43.33 
 
 
456 aa  275  2.0000000000000002e-72  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00693904 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13490  CBS domain-containing protein  41.29 
 
 
448 aa  242  1e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.740551  normal  0.0781314 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0594  hemolysin-like protein  39.73 
 
 
477 aa  236  7e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2186  CBS domain containing protein  48.22 
 
 
476 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17230  CBS domain-containing protein  43.07 
 
 
444 aa  217  4e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0117633  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0862  CBS domain protein  49.57 
 
 
499 aa  215  9.999999999999999e-55  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1468  CBS domain containing protein  37.47 
 
 
447 aa  214  1.9999999999999998e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0356908  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12320  CBS domain-containing protein  39.56 
 
 
441 aa  214  1.9999999999999998e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.509948  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4395  hypothetical protein  36.62 
 
 
439 aa  214  4.9999999999999996e-54  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0154532  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0015  CBS domain containing protein  33.56 
 
 
434 aa  211  2e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0531  protein of unknown function DUF21  33.08 
 
 
421 aa  209  1e-52  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0811523  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12560  putative membrane CBS domain protein  31.7 
 
 
420 aa  209  1e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1269  CBS domain containing protein  38.46 
 
 
420 aa  204  3e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3011  hypothetical protein  32.27 
 
 
429 aa  204  4e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0738  CBS domain-containing protein  36.96 
 
 
435 aa  204  5e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2111  CBS domain containing protein  42.31 
 
 
421 aa  203  5e-51  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.241811  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0082  hypothetical protein  29.74 
 
 
455 aa  203  7e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000179952  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0082  hypothetical protein  29.81 
 
 
455 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000182254  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1784  CBS domain-containing protein  44.58 
 
 
284 aa  200  5e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000339521  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2611  protein of unknown function DUF21  40.88 
 
 
445 aa  199  9e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2368  CBS:transporter-associated region  44.89 
 
 
284 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1891  hypothetical protein  32.64 
 
 
425 aa  197  5.000000000000001e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.471251 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1544  CBS domain containing protein  36.84 
 
 
441 aa  194  3e-48  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3277  protein of unknown function DUF21  31.08 
 
 
437 aa  194  4e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000233033  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1507  hypothetical protein  32.42 
 
 
430 aa  192  1e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3544  protein of unknown function DUF21  32.26 
 
 
446 aa  192  2e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0616  protein of unknown function DUF21  28.04 
 
 
422 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000000839014  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2036  CBS domain-containing protein  44 
 
 
296 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1977  hypothetical protein  34.26 
 
 
426 aa  191  4e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.890218  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1002  hypothetical protein  29.02 
 
 
443 aa  189  9e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3512  protein of unknown function DUF21  34.42 
 
 
431 aa  189  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal  0.374436 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1235  putative Mg2+ and co2+ transporter CorC  42.4 
 
 
285 aa  188  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0853  CBS domain-containing protein  38.49 
 
 
444 aa  187  3e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215802  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1153  hypothetical protein  37.54 
 
 
447 aa  187  4e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000974304  normal  0.0417904 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0252  protein of unknown function DUF21  33.67 
 
 
434 aa  186  9e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000514588  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2483  hypothetical protein  33.1 
 
 
442 aa  186  1.0000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.767391  normal  0.0571877 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2282  CBS domain-containing protein  46.19 
 
 
250 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1763  hypothetical protein  33.16 
 
 
446 aa  184  3e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0722  CBS domain-containing protein  38.98 
 
 
276 aa  184  5.0000000000000004e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3095  hypothetical protein  31 
 
 
440 aa  183  6e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0877278  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0036  transporter, putative  32.47 
 
 
421 aa  183  8.000000000000001e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1613  UPF0053 inner membrane protein  32.16 
 
 
433 aa  182  9.000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405489  normal  0.446608 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0036  putative transporter  32.47 
 
 
421 aa  182  1e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3396  CBS domain protein  31.34 
 
 
442 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0247  protein of unknown function DUF21  31.16 
 
 
446 aa  182  2e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3066  hypothetical protein  31.34 
 
 
442 aa  181  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.928407  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1000  CBS domain containing protein  40.16 
 
 
287 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0370099  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3260  CBS domain containing protein  41.33 
 
 
287 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3392  CBS domain-containing protein  31.09 
 
 
442 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3370  CBS domain protein  30.75 
 
 
442 aa  180  4.999999999999999e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2138  hypothetical protein  30.25 
 
 
440 aa  180  5.999999999999999e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0522  hypothetical protein  32.08 
 
 
432 aa  179  8e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2741  transporter-associated region  38.27 
 
 
281 aa  179  8e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.835583  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1855  CBS domain protein  30.6 
 
 
442 aa  179  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7571  CBS domain-containing protein  34.84 
 
 
434 aa  179  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.52117 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1001  CBS domain-containing protein  42.67 
 
 
291 aa  179  1e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.243259  normal  0.0641056 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1066  CBS domain-containing protein  42.67 
 
 
291 aa  179  1e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.354605  normal  0.0599682 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0655  CBS domain containing protein  40.47 
 
 
273 aa  178  2e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3172  CBS domain-containing protein  30.5 
 
 
442 aa  178  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.903732  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3156  hypothetical protein  30.5 
 
 
442 aa  179  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3391  CBS domain protein  30.5 
 
 
442 aa  179  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2212  CBS domain-containing protein  31.36 
 
 
417 aa  178  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000293587  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3015  hypothetical protein  28.42 
 
 
429 aa  179  2e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.204841  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1233  hypothetical protein  28.97 
 
 
424 aa  178  2e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1143  hypothetical protein  36.86 
 
 
432 aa  178  2e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000186322  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4588  hypothetical protein  34.89 
 
 
427 aa  178  3e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0268669  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0751  CBS domain containing protein  43.2 
 
 
291 aa  177  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000558025 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0064  protein of unknown function DUF21  31.34 
 
 
447 aa  178  3e-43  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0599  magnesium and cobalt efflux protein, putative  43.2 
 
 
291 aa  177  3e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1005  CBS domain-containing protein  42.24 
 
 
291 aa  177  4e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0718327 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2578  magnesium and cobalt efflux protein CorC  42.24 
 
 
292 aa  177  4e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0721434 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>