More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5907 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_5907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
408 aa  798    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.155683  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0967  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  75.74 
 
 
408 aa  618  1e-176  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.849709 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4606  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.81 
 
 
417 aa  174  1.9999999999999998e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0890367  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3200  Signal transduction histidine kinase-like protein  37.8 
 
 
395 aa  169  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2433  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.8 
 
 
461 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.189775  normal  0.142881 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6138  Signal transduction histidine kinase-like protein  36.86 
 
 
403 aa  163  4.0000000000000004e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278868  normal  0.229544 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1255  histidine kinase  37.18 
 
 
463 aa  157  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4660  histidine kinase  43.46 
 
 
402 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2132  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.94 
 
 
433 aa  149  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.569038  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0971  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 
417 aa  147  3e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2340  histidine kinase  40.09 
 
 
388 aa  144  3e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0308  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.01 
 
 
405 aa  144  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.130128 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0199  histidine kinase  40.28 
 
 
452 aa  141  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3934  histidine kinase  36.18 
 
 
442 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1360  histidine kinase  41.2 
 
 
476 aa  139  7.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.388977 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0949  histidine kinase  40.85 
 
 
416 aa  139  7.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2091  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.02 
 
 
466 aa  139  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2540  putative signal transduction histidine kinase  41.38 
 
 
570 aa  138  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3908  putative signal transduction histidine kinase  39.82 
 
 
435 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3982  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.82 
 
 
435 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.335335  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3923  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.82 
 
 
435 aa  134  3e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.534106  normal  0.212662 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5647  histidine kinase  38.79 
 
 
433 aa  132  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.559873  normal  0.146404 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2281  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.72 
 
 
445 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.67096  normal  0.255683 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0329  signal transduction histidine kinase  38.38 
 
 
435 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.982298  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2525  histidine kinase  39.39 
 
 
434 aa  129  9.000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0362104  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3718  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.38 
 
 
586 aa  129  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118329  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0386  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.86 
 
 
418 aa  128  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.482475 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4385  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.29 
 
 
445 aa  127  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2301  Histidine kinase  40.64 
 
 
412 aa  127  3e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09220  signal transduction histidine kinase  36.8 
 
 
492 aa  127  4.0000000000000003e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.253701 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0354  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.69 
 
 
438 aa  127  5e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0424  histidine kinase  36.84 
 
 
438 aa  127  5e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.680525  hitchhiker  0.00719111 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4333  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.96 
 
 
343 aa  125  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0375931  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4415  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.92 
 
 
386 aa  124  4e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0384972 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4726  histidine kinase  31.54 
 
 
405 aa  123  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1652  Histidine kinase  44.16 
 
 
439 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.527879  normal  0.680022 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2507  Signal transduction histidine kinase-like protein  32.45 
 
 
405 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401085  normal  0.727575 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2249  histidine kinase  36.5 
 
 
420 aa  120  3.9999999999999996e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.795375  normal  0.159293 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0635  histidine kinase  36.74 
 
 
430 aa  120  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.181904 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4456  histidine kinase  40.57 
 
 
410 aa  120  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2700  histidine kinase  35.74 
 
 
429 aa  120  4.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000394923  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3546  histidine kinase  37.74 
 
 
489 aa  119  7e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.871685 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3491  putative signal transduction histidine kinase  34.74 
 
 
624 aa  118  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12660  signal transduction histidine kinase  39.91 
 
 
444 aa  117  3.9999999999999997e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.224023  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2757  histidine kinase, dimerisation and phosphoacceptor region  33.83 
 
 
433 aa  117  3.9999999999999997e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.128423  normal  0.0502627 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3763  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.71 
 
 
375 aa  116  6e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.200679  normal  0.834979 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2298  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.68 
 
 
432 aa  115  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.317439  normal  0.783172 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2927  histidine kinase  36.24 
 
 
383 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000936268  hitchhiker  0.0000101948 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6198  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.88 
 
 
415 aa  114  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.129005  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4728  histidine kinase  37.09 
 
 
429 aa  114  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3516  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.98 
 
 
388 aa  113  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.370817  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1916  histidine kinase  34.38 
 
 
410 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2758  histidine kinase  34.58 
 
 
389 aa  110  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00845914  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3867  histidine kinase  37.85 
 
 
434 aa  111  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.265271  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0085  putative signal transduction histidine kinase  41.5 
 
 
587 aa  111  3e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4050  Histidine kinase  36.79 
 
 
374 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.313821  hitchhiker  0.00550271 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4021  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.4 
 
 
411 aa  110  6e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0185539  normal  0.088504 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1961  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 
444 aa  109  8.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  unclonable  0.000000367534  hitchhiker  0.000000631341 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3907  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.29 
 
 
428 aa  107  3e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8723  Histidine kinase  36.61 
 
 
365 aa  107  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17590  signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 
326 aa  106  6e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0109488  normal  0.353356 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6699  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.43 
 
 
621 aa  106  8e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0211  histidine kinase  37.83 
 
 
463 aa  106  1e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0319  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.44 
 
 
382 aa  105  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.499307  normal  0.099987 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3104  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
459 aa  104  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.8316  hitchhiker  0.000380562 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4688  histidine kinase  38.87 
 
 
419 aa  103  4e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0609  histidine kinase  33.1 
 
 
442 aa  103  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54142 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3049  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.5 
 
 
565 aa  102  1e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0199075  normal  0.598323 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0204  histidine kinase  34.6 
 
 
446 aa  101  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9331  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.85 
 
 
508 aa  100  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.542521 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0262  putative signal transduction histidine kinase  29.03 
 
 
465 aa  99.8  8e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.186103 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07210  histidine kinase  34.88 
 
 
237 aa  99.4  1e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3916  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.47 
 
 
431 aa  99  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.257994  normal  0.0672811 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35880  signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 
454 aa  98.6  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.263807 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7224  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38 
 
 
594 aa  96.7  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0811  histidine kinase  35.29 
 
 
580 aa  94  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3330  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.33 
 
 
398 aa  94  5e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0149067  normal  0.138525 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2071  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.76 
 
 
725 aa  92.8  9e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.249392  normal  0.37167 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0456  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.54 
 
 
775 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00143274 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2642  histidine kinase  32.92 
 
 
426 aa  92  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.992033  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1993  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.32 
 
 
422 aa  92  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0893  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 
359 aa  90.5  5e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3669  histidine kinase  31.49 
 
 
489 aa  89.7  8e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1231  histidine kinase  29.82 
 
 
482 aa  89.7  9e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1677  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 
770 aa  89  1e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4898  ATPase domain-containing protein  33.47 
 
 
491 aa  88.6  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.246184  normal  0.165682 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1215  PAS  30.87 
 
 
515 aa  87.8  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1880  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.81 
 
 
662 aa  86.7  7e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0862215  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1965  histidine kinase  30.81 
 
 
662 aa  86.7  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632766  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1706  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 
564 aa  86.3  8e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.98975  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5166  putative signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 
537 aa  85.9  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.153671  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11900  signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 
447 aa  85.1  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4289  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.49 
 
 
552 aa  85.1  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0248  putative signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 
470 aa  85.1  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  30.33 
 
 
658 aa  84.7  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1357  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 
403 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.246673  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.31 
 
 
352 aa  82  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0257  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 
404 aa  81.3  0.00000000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.5208 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3187  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 
459 aa  80.9  0.00000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.134921 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4034  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 
775 aa  80.9  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>