More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5654 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_5654  Cof-like hydrolase  100 
 
 
267 aa  529  1e-149  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.166656 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1155  Cof-like hydrolase  87.97 
 
 
270 aa  481  1e-135  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.269988  normal  0.0161592 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5023  Cof protein  80.45 
 
 
271 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5111  Cof-like hydrolase  80.45 
 
 
271 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.569864 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5404  Cof-like hydrolase  80.08 
 
 
271 aa  436  1e-121  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.365978 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13847  hypothetical protein  80.38 
 
 
273 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.320421 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0158  Cof-like hydrolase  57.78 
 
 
277 aa  293  3e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0193  Cof-like hydrolase  54.28 
 
 
277 aa  275  4e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0121  Cof-like hydrolase  50.37 
 
 
273 aa  252  3e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01290  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  46.99 
 
 
278 aa  231  1e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.384246  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0293  Cof-like hydrolase  43.82 
 
 
268 aa  192  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4318  Cof protein  42.11 
 
 
264 aa  185  6e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.873657 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0277  Cof-like hydrolase  42.91 
 
 
259 aa  181  9.000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2103  Cof-like hydrolase  40.75 
 
 
281 aa  172  3.9999999999999995e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.519808 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0144  phosphatase YbhA  39.25 
 
 
265 aa  166  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101549  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07610  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  37.79 
 
 
265 aa  166  5e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0517229 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0111  Cof-like hydrolase  37.36 
 
 
272 aa  161  1e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0177  HAD family hydrolase  41.22 
 
 
264 aa  160  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0958993  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0228  Cof-like hydrolase  38.29 
 
 
272 aa  160  3e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5588  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase type 3  40 
 
 
272 aa  159  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.16228  normal  0.729842 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0126  Cof-like hydrolase  35.82 
 
 
285 aa  159  6e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0074  HAD-superfamily hydrolase  37.23 
 
 
269 aa  154  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.542278  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0255  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  39.85 
 
 
290 aa  150  2e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.962827  hitchhiker  0.00110837 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1954  Cof-like hydrolase  39.02 
 
 
274 aa  149  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0280  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  37.45 
 
 
267 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.309237  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0560  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  32.45 
 
 
265 aa  135  8e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.111062 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0299  Cof-like hydrolase  37.55 
 
 
259 aa  133  3e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2937  HAD-superfamily hydrolase subfamily IIB  38.66 
 
 
261 aa  130  3e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0182848  hitchhiker  0.000402295 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4525  Cof-like hydrolase  38.29 
 
 
273 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.992091 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3241  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  37.92 
 
 
274 aa  129  4.0000000000000003e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4106  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  32.58 
 
 
272 aa  129  7.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.607815  normal  0.307406 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0505  Cof-like hydrolase  36.4 
 
 
303 aa  127  1.0000000000000001e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.930441  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2207  Cof-like hydrolase  30.94 
 
 
273 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0250  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  35.19 
 
 
266 aa  125  9e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.452319  hitchhiker  0.00105022 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00960  Cof subfamily of IIB subfamily of haloacid dehalogenase superfamily/HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  34.89 
 
 
282 aa  124  1e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5035  HAD family hydrolase  37.55 
 
 
273 aa  124  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0548232 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3183  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  38.06 
 
 
265 aa  124  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0375981 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0646  HAD superfamily hydrolase  30.51 
 
 
267 aa  123  3e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0141  Cof-like hydrolase  35.58 
 
 
284 aa  123  4e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01160  Cof subfamily of IIB subfamily of haloacid dehalogenase superfamily/HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  35.82 
 
 
269 aa  121  9.999999999999999e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16120  Cof-like hydrolase  32 
 
 
267 aa  119  3.9999999999999996e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7012  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  36.33 
 
 
261 aa  118  9e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00675343  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0594  HAD family hydrolase  30.43 
 
 
266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0380  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  35.85 
 
 
295 aa  115  6.9999999999999995e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.890791 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0175  HAD family hydrolase  33.09 
 
 
282 aa  115  6.9999999999999995e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.646059  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1821  HAD family hydrolase  30.25 
 
 
276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0131582  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0583  HAD family hydrolase  30.18 
 
 
266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000118993  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01700  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  34.07 
 
 
275 aa  113  3e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.616457 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1545  Cof-like hydrolase  32.34 
 
 
268 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06840  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  34.56 
 
 
288 aa  111  2.0000000000000002e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.324919  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1541  HAD family hydrolase  29.89 
 
 
276 aa  111  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.145336  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01730  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  34.21 
 
 
311 aa  110  3e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.330616  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2136  Cof-like hydrolase  28.88 
 
 
279 aa  109  4.0000000000000004e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0870  HAD superfamily hydrolase  27.64 
 
 
281 aa  109  4.0000000000000004e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000525914  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0279  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  34.78 
 
 
308 aa  108  8.000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.333001  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3917  Cof-like hydrolase  30.38 
 
 
273 aa  108  1e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3699  Cof-like hydrolase  32.5 
 
 
265 aa  107  2e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.143093  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5491  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.38 
 
 
273 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003397  predicted hydrolase  29.89 
 
 
270 aa  107  2e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1678  HAD superfamily hydrolase  31.1 
 
 
460 aa  107  2e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.000161748  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0977  hypothetical protein  30.63 
 
 
273 aa  107  2e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5248  HAD superfamily hydrolase  30.38 
 
 
273 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.50022  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5077  HAD superfamily hydrolase  30.38 
 
 
273 aa  107  2e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000418838  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5094  HAD superfamily hydrolase  30.38 
 
 
273 aa  107  2e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0970006  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6169  HAD-superfamily hydrolase subfamily IIB  34.05 
 
 
271 aa  107  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5646  HAD superfamily hydrolase  30.38 
 
 
273 aa  107  2e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2017  Cof-like hydrolase  22.47 
 
 
269 aa  106  4e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4113  sugar phosphatase  30.82 
 
 
279 aa  106  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1302  Cof-like hydrolase  26.98 
 
 
274 aa  105  5e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.241456  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5525  HAD superfamily hydrolase  30.77 
 
 
273 aa  105  6e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6168  HAD-superfamily hydrolase subfamily IIB  33.21 
 
 
268 aa  105  7e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5575  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.77 
 
 
273 aa  105  7e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5519  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.77 
 
 
273 aa  105  8e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5432  hydrolase, haloacid dehalogenase-like family  30.77 
 
 
273 aa  105  9e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5189  Cof-like hydrolase  28.85 
 
 
273 aa  105  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0719  Cof-like hydrolase  30.11 
 
 
268 aa  103  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4223  sugar phosphatase  29.86 
 
 
281 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0257  HAD family hydrolase  31.73 
 
 
272 aa  103  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4116  sugar phosphatase  29.86 
 
 
281 aa  102  5e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3191  Cof-like hydrolase  32.97 
 
 
291 aa  102  6e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0779  Cof-like hydrolase  28.31 
 
 
275 aa  102  8e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0853  Cof-like hydrolase  30.53 
 
 
265 aa  102  8e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3946  HAD family hydrolase  32.35 
 
 
273 aa  102  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.292051  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1822  Cof-like hydrolase  31.52 
 
 
268 aa  101  1e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1388  Cof-like hydrolase  30.77 
 
 
267 aa  101  1e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.323635  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0971  Cof-like hydrolase  27.27 
 
 
274 aa  101  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.254704  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0990  Cof-like hydrolase  27.27 
 
 
274 aa  101  1e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.275233  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0726  HAD superfamily hydrolase  28.21 
 
 
274 aa  101  2e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0414  Cof-like hydrolase  26.57 
 
 
268 aa  100  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0522924  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4043  sugar phosphatase  29.86 
 
 
270 aa  100  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0437  Cof-like hydrolase  28.87 
 
 
273 aa  100  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000100765  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0534  HAD superfamily hydrolase  27.37 
 
 
273 aa  100  2e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0561  HAD superfamily hydrolase  28.68 
 
 
273 aa  100  3e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0216  Cof-like hydrolase  28.16 
 
 
265 aa  100  3e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0590  HAD family hydrolase  24.92 
 
 
279 aa  100  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.24971  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0366  HAD superfamily hydrolase  29.43 
 
 
271 aa  100  3e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1675  HAD family hydrolase  31.99 
 
 
273 aa  99.8  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2869  Cof-like hydrolase  31.99 
 
 
273 aa  99.8  4e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3106  HAD family hydrolase  31.99 
 
 
273 aa  99.8  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.24744  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3444  HAD family hydrolase  31.99 
 
 
273 aa  99.8  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.722541  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>