123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3854 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3854  hypothetical protein  100 
 
 
286 aa  573  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.357835  normal  0.508421 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2688  hypothetical protein  89.16 
 
 
286 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.566827  normal  0.214057 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3932  hypothetical protein  71.93 
 
 
286 aa  431  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0176124 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6257  hypothetical protein  67.72 
 
 
285 aa  403  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.949372  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6698  hypothetical protein  50.52 
 
 
291 aa  268  8e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.490421  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0151  hypothetical protein  51.4 
 
 
283 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0952  hypothetical protein  49.48 
 
 
285 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0252  hypothetical protein  49.81 
 
 
290 aa  243  3e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4343  hypothetical protein  48.59 
 
 
288 aa  241  7.999999999999999e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7266  hypothetical protein  48.12 
 
 
334 aa  237  2e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.282695 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5643  hypothetical protein  45.52 
 
 
297 aa  223  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.897056  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38250  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  45.8 
 
 
280 aa  223  3e-57  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.201502  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1071  hypothetical protein  45.99 
 
 
304 aa  221  9.999999999999999e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4349  hypothetical protein  43.06 
 
 
324 aa  220  1.9999999999999999e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1368  hypothetical protein  48.89 
 
 
281 aa  217  2e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233326  normal  0.203451 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0059  hypothetical protein  46.76 
 
 
303 aa  216  4e-55  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3965  hypothetical protein  43.4 
 
 
324 aa  216  4e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3207  putative F420-dependent oxidoreductase  47.04 
 
 
272 aa  214  9.999999999999999e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1068  hypothetical protein  50 
 
 
276 aa  212  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1084  hypothetical protein  50 
 
 
276 aa  212  5.999999999999999e-54  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0372016 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1095  hypothetical protein  50 
 
 
276 aa  211  9e-54  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5006  hypothetical protein  44.91 
 
 
287 aa  207  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13500  hypothetical protein  47.97 
 
 
285 aa  207  1e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000277953  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2620  hypothetical protein  45.12 
 
 
296 aa  207  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1367  hypothetical protein  46.94 
 
 
285 aa  207  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.134083 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5005  hypothetical protein  46.01 
 
 
294 aa  206  5e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0497  hypothetical protein  43.9 
 
 
303 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0508  hypothetical protein  43.9 
 
 
303 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.732723 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0486  hypothetical protein  43.9 
 
 
303 aa  204  1e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1067  hypothetical protein  44.74 
 
 
283 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1083  hypothetical protein  44.74 
 
 
283 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.377526  normal  0.11045 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1094  hypothetical protein  44.74 
 
 
283 aa  204  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1512  hypothetical protein  43.87 
 
 
279 aa  193  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00633715  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3644  hypothetical protein  42.28 
 
 
307 aa  193  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.150808 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3680  putative F420-dependent oxidoreductase  46.35 
 
 
281 aa  193  3e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1545  hypothetical protein  43.8 
 
 
301 aa  186  4e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.0000935429  normal  0.088504 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2385  putative F420-dependent oxidoreductase  42.36 
 
 
288 aa  183  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.742445 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5428  hypothetical protein  36.24 
 
 
275 aa  165  9e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.178927 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5686  hypothetical protein  36.36 
 
 
271 aa  125  7e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0100066 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4154  hypothetical protein  36.68 
 
 
301 aa  115  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.238248  normal  0.605436 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9305  Coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase-like protein  28.16 
 
 
322 aa  90.1  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220711  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3526  luciferase-like monooxygenase  27.65 
 
 
318 aa  87.4  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.854723 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3977  Luciferase-like monooxygenase  28.89 
 
 
318 aa  74.3  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5119  Luciferase-like monooxygenase  27.5 
 
 
327 aa  73.2  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0261  luciferase family protein  26.32 
 
 
309 aa  72  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.110692 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0410  luciferase family protein  25.95 
 
 
306 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0589827 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0507  Luciferase-like monooxygenase  26.25 
 
 
301 aa  61.6  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3116  putative F420-dependent oxidoreductase  26.43 
 
 
344 aa  62  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270575  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4308  luciferase family protein  27.51 
 
 
318 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.502996 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2574  hypothetical protein  27.6 
 
 
346 aa  60.5  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.304728  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2163  luciferase family protein  25.07 
 
 
350 aa  59.7  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3612  luciferase family protein  28.34 
 
 
342 aa  59.7  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2317  luciferase family protein  23.98 
 
 
350 aa  59.7  0.00000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1412  luciferase family protein  26.62 
 
 
318 aa  59.3  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.429972  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3731  luciferase-like protein  29.67 
 
 
318 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3804  luciferase family protein  29.67 
 
 
318 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0754765 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3743  luciferase family protein  29.67 
 
 
318 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2916  luciferase family protein  26.79 
 
 
330 aa  57.4  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4576  putative oxidoreductase  29.78 
 
 
355 aa  57.4  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.248726  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4259  luciferase family protein  25.37 
 
 
318 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.791744 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0980  putative oxidoreductase  22.94 
 
 
345 aa  55.1  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2768  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.64 
 
 
332 aa  55.1  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.121921  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5821  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  32.98 
 
 
334 aa  55.5  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3824  luciferase-like protein  25.18 
 
 
318 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0429165  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3898  luciferase family protein  25.18 
 
 
318 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4198  luciferase family protein  26.71 
 
 
317 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.66157  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3810  luciferase family protein  25.18 
 
 
318 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0990904  normal  0.114325 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2453  luciferase family protein  26.83 
 
 
317 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0205  methylenetetrahydromethanopterin reductase  25.09 
 
 
318 aa  52.8  0.000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.987151  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2908  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.6 
 
 
333 aa  52.8  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3309  luciferase family protein  23.81 
 
 
318 aa  52.4  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.243042 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4934  luciferase-like protein  29.06 
 
 
309 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.470854  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5022  luciferase family protein  29.06 
 
 
309 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.125832  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2389  luciferase family protein  24.63 
 
 
318 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.408058  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1097  Luciferase-like monooxygenase  24.9 
 
 
335 aa  52  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1137  luciferase-like protein  24.92 
 
 
349 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1154  luciferase family protein  24.92 
 
 
349 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0898385  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1164  luciferase family protein  24.92 
 
 
349 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.224617  normal  0.408593 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2758  Luciferase-like monooxygenase  28.29 
 
 
296 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3523  Luciferase-like monooxygenase  26.73 
 
 
349 aa  50.4  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.551464  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1775  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  24.62 
 
 
361 aa  50.4  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.588443  normal  0.359514 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1388  luciferase-like monooxygenase  23.65 
 
 
344 aa  50.1  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.145304 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4047  luciferase family protein  28.29 
 
 
347 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.90526  normal  0.465581 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3206  putative F420-dependent oxidoreductase  29.66 
 
 
346 aa  49.7  0.00006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1056  5,10-methylenetetrahydromethanopterin reductase  23.81 
 
 
336 aa  49.7  0.00006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5315  luciferase family protein  28.73 
 
 
309 aa  49.3  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0813  luciferase family protein  24.57 
 
 
360 aa  48.5  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.861027  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1261  luciferase family protein  27.03 
 
 
300 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.0146024 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1478  luciferase family protein  25.08 
 
 
346 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4941  luciferase family protein  24.77 
 
 
345 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837343  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1995  putative F420-dependent oxidoreductase  23.94 
 
 
346 aa  48.1  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.335211  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13553  coenzyme F420-dependent oxidoreductase  22.9 
 
 
347 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0985147  hitchhiker  0.00000942783 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0106  Luciferase-like monooxygenase  26.54 
 
 
346 aa  48.1  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.827714  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4793  Luciferase-like monooxygenase  25.74 
 
 
349 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4633  luciferase-like protein  23.15 
 
 
343 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4721  luciferase family protein  23.15 
 
 
343 aa  47.4  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.265583  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24470  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  29.75 
 
 
352 aa  47  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0842  luciferase family protein  19.34 
 
 
321 aa  46.6  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000207214 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4020  Luciferase-like monooxygenase  26.55 
 
 
283 aa  46.6  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0169591  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5015  luciferase family protein  23.15 
 
 
343 aa  46.6  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>