270 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2101 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_2101  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  100 
 
 		 244 aa  477  1e-134  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4675  NmrA family protein  51.65 
 
 		 254 aa  245  4.9999999999999997e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.120446  normal  0.764449 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4738  NmrA family protein  48.76 
 
 		 254 aa  233  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.210315  normal  0.761332 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5577  NmrA family protein  51.26 
 
 		 251 aa  232  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5446  NmrA family protein  47.93 
 
 		 267 aa  231  1e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.491998 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5821  NmrA family protein  47.74 
 
 		 250 aa  228  6e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0877464 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4281  NmrA family protein  49.79 
 
 		 250 aa  227  1e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1115  NmrA-like  47.92 
 
 		 273 aa  223  2e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000012808 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5169  NmrA-like protein  47.93 
 
 		 251 aa  221  6e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.269967  hitchhiker  0.0024207 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2924  NmrA-like  52.12 
 
 		 250 aa  221  9.999999999999999e-57  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5787  NmrA family protein  50 
 
 		 247 aa  220  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.461264 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0090  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.67 
 
 		 251 aa  218  7e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5436  NmrA family protein  50.83 
 
 		 251 aa  218  7.999999999999999e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5307  NmrA family protein  51.44 
 
 		 254 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2275  NmrA-like  47.95 
 
 		 251 aa  215  4e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.489802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4925  NmrA-like protein  51.03 
 
 		 252 aa  215  5e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5014  NmrA family protein  51.03 
 
 		 252 aa  215  5e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.519146  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2517  NmrA family protein  45.42 
 
 		 251 aa  214  9e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.192065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5558  NmrA family protein  49.58 
 
 		 247 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5255  NmrA-like  50 
 
 		 251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5604  NmrA family protein  50 
 
 		 251 aa  213  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.446699 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4624  NmrA family protein  49.58 
 
 		 251 aa  212  4.9999999999999996e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000639596 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1347  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.68 
 
 		 258 aa  210  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.716316  hitchhiker  0.0000000415542 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2341  NmrA family protein  49.58 
 
 		 251 aa  210  2e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7959  NmrA family protein  47.93 
 
 		 252 aa  210  2e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.757877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2094  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.63 
 
 		 249 aa  208  7e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.40627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1319  NAD-dependent epimerase/dehydratase  45.27 
 
 		 258 aa  207  8e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2773  NmrA family protein  44.17 
 
 		 251 aa  207  9e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.298271  normal  0.534883 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4349  NmrA family protein  47.48 
 
 		 250 aa  206  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.971724  normal  0.637435 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0993  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.02 
 
 		 246 aa  206  2e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5191  NmrA family protein  44.03 
 
 		 250 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0102681  normal  0.158749 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7641  NmrA family protein  49.17 
 
 		 251 aa  206  4e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0787849  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5449  NAD-dependent epimerase/dehydratase  42.8 
 
 		 251 aa  205  6e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.349092 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1995  NmrA family protein  48.75 
 
 		 255 aa  205  6e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0991  NmrA family protein  50.21 
 
 		 243 aa  204  8e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1579  NAD-dependent epimerase/dehydratase:dTDP-4-dehydrorhamnose reductase:NmrA-like  47.08 
 
 		 250 aa  202  5e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5001  NmrA family protein  48.96 
 
 		 252 aa  201  8e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3574  NmrA family protein  46.91 
 
 		 244 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.764024 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5460  NmrA family protein  44.44 
 
 		 250 aa  199  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.13563  normal  0.193679 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5937  NAD-dependent epimerase/dehydratase  44.86 
 
 		 254 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.525182 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4025  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  54.13 
 
 		 249 aa  199  5e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.409748  normal  0.676846 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4584  NmrA family protein  45.18 
 
 		 250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.907742 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4579  NmrA family protein  45.18 
 
 		 250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.421298 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2094  NmrA family protein  48.16 
 
 		 246 aa  194  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0905  NmrA family protein  42.39 
 
 		 251 aa  193  2e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.596498  normal  0.269728 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5436  hypothetical protein  44.86 
 
 		 244 aa  187  9e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.557208 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3956  GCN5-related N-acetyltransferase  46.64 
 
 		 402 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0442969 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0904  NmrA family protein  39.26 
 
 		 246 aa  181  1e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.705633  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5747  NmrA family protein  40.5 
 
 		 247 aa  171  9e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.474702 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0611  NmrA family protein  39.17 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.465508 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9038  hypothetical protein  39.42 
 
 		 247 aa  159  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.84 
 
 		 248 aa  159  5e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05170  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  40.48 
 
 		 251 aa  149  3e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3002  NmrA family protein  37.76 
 
 		 249 aa  148  9e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.284221  normal  0.832187 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3222  NmrA family protein  38.17 
 
 		 264 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5437  hypothetical protein  51.13 
 
 		 137 aa  139  4.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.201154 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20710  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  41.06 
 
 		 251 aa  137  2e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4049  hypothetical protein  38.6 
 
 		 261 aa  132  3.9999999999999996e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.000562723  normal  0.100478 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3992  NmrA family protein  36.97 
 
 		 248 aa  132  6.999999999999999e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01680  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  40.64 
 
 		 253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.576893  normal  0.223324 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0060  dTDP-4-dehydrorhamnose reductase  38.53 
 
 		 252 aa  129  6e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4374  hypothetical protein  37.82 
 
 		 244 aa  122  6e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.04339  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1560  hypothetical protein  37.74 
 
 		 263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0351056  normal  0.0354487 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2007  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.7 
 
 		 250 aa  104  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.702052 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05940  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  35.71 
 
 		 252 aa  103  3e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.511116  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8718  NmrA family protein  34.98 
 
 		 256 aa  102  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.428087  hitchhiker  0.00954025 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3102  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.82 
 
 		 248 aa  102  8e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.346824  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1659  NmrA family protein  36.2 
 
 		 264 aa  99.8  4e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1652  hypothetical protein  34.19 
 
 		 255 aa  92.8  4e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0228  NmrA family protein  31.34 
 
 		 255 aa  92  7e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27560  predicted nucleoside-diphosphate sugar epimerase  32.06 
 
 		 258 aa  91.3  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.235843  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1698  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.14 
 
 		 259 aa  90.5  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4557  hypothetical protein  34.25 
 
 		 247 aa  88.2  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.278817  normal  0.177631 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3321  NmrA family protein  32.14 
 
 		 279 aa  80.1  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3276  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.03 
 
 		 275 aa  78.2  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4107  NmrA family protein  30.4 
 
 		 269 aa  75.9  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.824515 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0940  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.47 
 
 		 253 aa  74.3  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.681358  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1279  hypothetical protein  36.99 
 
 		 312 aa  70.9  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0266126  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0977  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.09 
 
 		 459 aa  68.2  0.0000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0520232 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1654  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.28 
 
 		 305 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.655749  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3561  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.2 
 
 		 295 aa  65.5  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3627  NAD-dependent epimerase/dehydratase  24.2 
 
 		 295 aa  65.1  0.0000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1891  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.8 
 
 		 298 aa  64.7  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0168492  normal  0.486121 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1322  NmrA family protein  26.16 
 
 		 513 aa  63.9  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.180223  normal  0.0774954 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1299  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.83 
 
 		 291 aa  63.2  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3144  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.44 
 
 		 294 aa  63.5  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0638  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.34 
 
 		 306 aa  63.5  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2861  NmrA family protein  36.53 
 
 		 266 aa  61.2  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4905  NmrA family protein  26.17 
 
 		 327 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.554615 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2629  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.2 
 
 		 309 aa  60.5  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.262596  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5088  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.56 
 
 		 264 aa  60.8  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0184  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.23 
 
 		 296 aa  60.8  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2425  chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  28.19 
 
 		 320 aa  60.5  0.00000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.126236 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1106  NADH dehydrogenase-like protein  24.11 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0798797  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0063  NmrA family protein  27.52 
 
 		 323 aa  59.3  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000216715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5369  NAD-dependent epimerase/dehydratase  27.24 
 
 		 474 aa  59.3  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.837731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0065  NmrA family protein  27.52 
 
 		 323 aa  59.3  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0380  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.01 
 
 		 294 aa  58.5  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.270994  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1324  hypothetical protein  24.82 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000450557  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1986  putative chaperon-like protein for quinone binding in photosystem II  26.85 
 
 		 320 aa  57.4  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0663634 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>