52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1271 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_1271  PaaX domain-containing protein, C- domain  100 
 
 		 237 aa  460  1e-129  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00141132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5085  PaaX domain-containing protein, C- domain  80.93 
 
 		 244 aa  370  1e-102  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.706044 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0977  PaaX-like protein  75.42 
 
 		 243 aa  345  3e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0995  PaaX domain-containing protein, C- domain  75.42 
 
 		 243 aa  345  3e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1005  PaaX domain-containing protein, C- domain  75.42 
 
 		 243 aa  345  3e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.457167 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10688  hypothetical protein  70.64 
 
 		 240 aa  336  9.999999999999999e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4285  PaaX domain protein protein domain protein  48.7 
 
 		 244 aa  192  5e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.246767  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6140  putative transcriptional regulator, PaaX family  48.02 
 
 		 251 aa  167  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.353105  normal  0.192867 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2859  transcriptional regulator, PaaX family  23.64 
 
 		 285 aa  75.1  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19070  phenylacetic acid-responsive transcriptional repressor  28.63 
 
 		 292 aa  68.6  0.00000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0202563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0915  PaaX domain-containing protein  33.33 
 
 		 275 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1609  PaaX family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 258 aa  65.5  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0196  transcriptional regulator, PaaX family  28.16 
 
 		 319 aa  62.8  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4899  transcriptional regulator, PaaX family  29.38 
 
 		 276 aa  62.4  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.425131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0655  PaaX family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 272 aa  61.2  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0748596  hitchhiker  0.00291671 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0980  transcriptional regulator, PaaX family  27.56 
 
 		 259 aa  58.9  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.148761 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2835  transcriptional regulator, PaaX family  24.44 
 
 		 285 aa  58.2  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1206  PaaX domain-containing protein, C- domain  33.76 
 
 		 258 aa  58.2  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0708  PaaX family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 272 aa  57.4  0.0000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.719013  normal  0.640912 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2864  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein paaX  28.24 
 
 		 293 aa  56.2  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00499823  normal  0.0484276 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0289  transcriptional regulator, PaaX family  31.8 
 
 		 280 aa  56.2  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.010887  hitchhiker  0.0000784974 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2629  PaaX family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.495501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2473  PaaX family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 334 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.303711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8420  putative transcriptional regulator, PaaX family  31.08 
 
 		 260 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289328  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3286  PaaX family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 307 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.17765  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2025  transcriptional regulator, PaaX family  28.51 
 
 		 306 aa  52.8  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0588  transcriptional regulator, PaaX family  27.35 
 
 		 276 aa  52  0.000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2610  PaaX family transcriptional regulator  28.12 
 
 		 334 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.218497  normal  0.0704814 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0787  transcriptional regulator, PaaX family  29.13 
 
 		 268 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6455  transcriptional regulator, PaaX family  29.61 
 
 		 260 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3103  PaaX family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 307 aa  50.1  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000000661945  decreased coverage  0.0000397547 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0895  PaaX family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 305 aa  48.9  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.947925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3480  hypothetical protein  28.95 
 
 		 278 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1827  hypothetical protein  28.95 
 
 		 278 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0069  hypothetical protein  28.95 
 
 		 278 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0067  hypothetical protein  28.95 
 
 		 278 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0283  hypothetical protein  28.95 
 
 		 278 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.535361  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2726  hypothetical protein  28.95 
 
 		 278 aa  47.8  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3734  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein PaaX  28.94 
 
 		 307 aa  47.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2623  PaaX family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 334 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.312733  normal  0.0873289 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0294  transcriptional regulator, PaaX family  27.31 
 
 		 318 aa  46.6  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0429653  hitchhiker  0.0000864342 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00945  PaaX-like protein  24.31 
 
 		 266 aa  45.8  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.067887  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0703  transcriptional regulator, PaaX family  26.59 
 
 		 259 aa  45.8  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2246  transcriptional regulator, PaaX family  26.94 
 
 		 316 aa  45.4  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.218129  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2009  transcriptional regulator, PaaX family  27.8 
 
 		 281 aa  45.4  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.429433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1585  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein PaaX  27.06 
 
 		 316 aa  45.4  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0058  hypothetical protein  26.87 
 
 		 278 aa  44.3  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3083  PaaX family transcriptional regulator  23.18 
 
 		 312 aa  43.9  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.415086 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4146  PaaX family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 305 aa  43.5  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.85173 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2256  PaaX family transcriptional regulator  26.48 
 
 		 316 aa  43.5  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.203735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1486  phenylacetic acid degradation operon negative regulatory protein PaaX  26.48 
 
 		 316 aa  43.5  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3911  PaaX-like  24.88 
 
 		 239 aa  43.1  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.547243  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>