More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1682 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_1682  phosphoserine phosphatase SerB  100 
 
 
400 aa  804    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2283  3-phosphoserine phosphatase  38.66 
 
 
398 aa  268  2e-70  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.000000752134  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0314  phosphoserine phosphatase SerB  37.53 
 
 
410 aa  259  5.0000000000000005e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0906615 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1598  phosphoserine phosphatase SerB  36.72 
 
 
408 aa  258  2e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5336  phosphoserine phosphatase SerB  39.55 
 
 
419 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414905  normal  0.119609 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2041  phosphoserine phosphatase  37.35 
 
 
404 aa  252  9.000000000000001e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.143406  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2786  phosphoserine phosphatase SerB  37.28 
 
 
410 aa  251  2e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0506  phosphoserine phosphatase  37.84 
 
 
404 aa  248  1e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.138167  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0409  phosphoserine phosphatase SerB  36.86 
 
 
438 aa  247  3e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0341  phosphoserine phosphatase SerB  37.65 
 
 
412 aa  247  3e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0264  phosphoserine phosphatase SerB  36.84 
 
 
404 aa  246  4.9999999999999997e-64  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1075  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer / phosphoserine phosphatase  36.1 
 
 
405 aa  246  6e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.314545 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4701  phosphoserine phosphatase SerB  36.88 
 
 
404 aa  245  8e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.995062 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1948  phosphoserine phosphatase SerB  34.96 
 
 
406 aa  242  9e-63  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.656763 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4962  phosphoserine phosphatase SerB  37.1 
 
 
404 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.414119 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4909  phosphoserine phosphatase SerB  37.19 
 
 
415 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.45946  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3017  phosphoserine phosphatase SerB  36.97 
 
 
411 aa  241  2e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4785  phosphoserine phosphatase SerB  37.1 
 
 
404 aa  241  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.174471  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65560  phosphoserine phosphatase  37.93 
 
 
429 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2803  phosphoserine phosphatase SerB  36.2 
 
 
398 aa  240  4e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.749544  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5689  phosphoserine phosphatase SerB  38.06 
 
 
404 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0618  phosphoserine phosphatase  36.67 
 
 
429 aa  239  9e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0653  phosphoserine phosphatase  36.82 
 
 
413 aa  238  2e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.184974 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0557  phosphoserine phosphatase SerB  36.3 
 
 
418 aa  238  2e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29300  phosphoserine phosphatase  37.08 
 
 
409 aa  238  2e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.78907  normal  0.19351 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4957  ACT domain protein/phosphoserine phosphatase SerB  35.96 
 
 
418 aa  236  8e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2664  phosphoserine phosphatase SerB  36.1 
 
 
405 aa  233  3e-60  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00356785  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0250  phosphoserine phosphatase  36.34 
 
 
405 aa  232  7.000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0216  phosphoserine phosphatase SerB  36.1 
 
 
405 aa  232  9e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2574  phosphoserine phosphatase  36.08 
 
 
420 aa  231  1e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.335719  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1712  phosphoserine phosphatase SerB  34.4 
 
 
410 aa  229  6e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0136  phosphoserine phosphatase  37.37 
 
 
432 aa  228  2e-58  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.357065  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07410  Phosphoserine phosphatase  36.52 
 
 
404 aa  226  4e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.403165  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0500  Phosphoserine phosphatase  36.57 
 
 
407 aa  225  9e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0225  phosphoserine phosphatase SerB  35.77 
 
 
406 aa  219  1e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1350  phosphoserine phosphatase SerB  45.08 
 
 
419 aa  217  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4820  phosphoserine phosphatase SerB  36.32 
 
 
403 aa  216  5e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2542  phosphoserine phosphatase  39.22 
 
 
411 aa  211  2e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2310  phosphoserine phosphatase SerB  36.25 
 
 
429 aa  209  6e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.54597 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2940  phosphoserine phosphatase SerB  34.82 
 
 
421 aa  207  2e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2240  phosphoserine phosphatase SerB  45.92 
 
 
281 aa  206  8e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00113806  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0990  phosphoserine phosphatase SerB  35.94 
 
 
406 aa  203  5e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3280  phosphoserine phosphatase SerB  32.81 
 
 
414 aa  201  1.9999999999999998e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13058  phosphoserine phosphatase  32.31 
 
 
409 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.128552 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5506  phosphoserine phosphatase SerB  44.59 
 
 
306 aa  196  8.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.933575  normal 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5907  phosphoserine phosphatase SerB  44.59 
 
 
306 aa  196  8.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.580138  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0351  phosphoserine phosphatase SerB  46.6 
 
 
213 aa  196  9e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00704526  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1066  phosphoserine phosphatase SerB  46.6 
 
 
213 aa  196  9e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.702614  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3588  phosphoserine phosphatase  43.23 
 
 
325 aa  194  3e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.606019  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3469  phosphoserine phosphatase  42.36 
 
 
325 aa  192  7e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1560  phosphoserine phosphatase SerB  45.63 
 
 
213 aa  191  1e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.223935 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03372  phosphoserine phosphatase  46.57 
 
 
326 aa  191  2e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0666  phosphoserine phosphatase  44.8 
 
 
325 aa  190  4e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2083  phosphoserine phosphatase SerB  33.16 
 
 
419 aa  190  5e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.726973  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1368  phosphoserine phosphatase  42.51 
 
 
284 aa  189  5.999999999999999e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0127039  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1052  phosphoserine phosphatase SerB  45.89 
 
 
210 aa  189  8e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.53193  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0687  phosphoserine phosphatase  42.79 
 
 
317 aa  188  1e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.189531  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1688  phosphoserine phosphatase SerB  35.2 
 
 
380 aa  189  1e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0594827 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1924  phosphoserine phosphatase  45.89 
 
 
328 aa  188  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0935  phosphoserine phosphatase  43.56 
 
 
224 aa  187  2e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2146  phosphoserine phosphatase SerB  44.2 
 
 
400 aa  187  4e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1962  phosphoserine phosphatase  44.8 
 
 
279 aa  186  5e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.436827  normal  0.668349 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1857  phosphoserine phosphatase  43.44 
 
 
400 aa  186  7e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.982407 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2903  phosphoserine phosphatase SerB  31.85 
 
 
410 aa  185  1.0000000000000001e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.854311  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002634  phosphoserine phosphatase  46.08 
 
 
326 aa  184  2.0000000000000003e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1094  phosphoserine phosphatase  42.93 
 
 
230 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.494414 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0547  phosphoserine phosphatase  42.99 
 
 
322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0971338 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2504  phosphoserine phosphatase SerB  45.63 
 
 
278 aa  184  3e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000000707909  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0547  phosphoserine phosphatase  42.22 
 
 
325 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0450  phosphoserine phosphatase  42.67 
 
 
325 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0421726  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2012  phosphoserine phosphatase SerB  43.87 
 
 
295 aa  183  5.0000000000000004e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1640  putative phosphoserine phosphatase protein  40.96 
 
 
285 aa  182  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.791178  normal  0.179226 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1577  phosphoserine phosphatase SerB  40.32 
 
 
285 aa  182  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0191931 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2446  phosphoserine phosphatase SerB  40.48 
 
 
369 aa  181  1e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.252251  normal  0.102746 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1906  phosphoserine phosphatase SerB  40.32 
 
 
310 aa  181  2e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0401863  normal  0.165029 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02993  SerB  41.36 
 
 
327 aa  181  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3222  phosphoserine phosphatase SerB  46.57 
 
 
326 aa  180  4e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2184  phosphoserine phosphatase SerB  41.07 
 
 
435 aa  180  4e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0738013  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1690  phosphoserine phosphatase SerB  39.49 
 
 
281 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.656788  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1718  phosphoserine phosphatase SerB  39.49 
 
 
316 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4276  phosphoserine phosphatase SerB  31.61 
 
 
410 aa  179  5.999999999999999e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.759953 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1107  phosphoserine phosphatase  45.37 
 
 
306 aa  179  7e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1492  phosphoserine phosphatase SerB  42.29 
 
 
281 aa  179  8e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.806128  normal  0.053472 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1073  phosphoserine phosphatase  41.74 
 
 
281 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2157  phosphoserine phosphatase  41.74 
 
 
281 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.752004  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0094  phosphoserine phosphatase  41.74 
 
 
281 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.188283  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2194  phosphoserine phosphatase  41.74 
 
 
281 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3223  phosphoserine phosphatase SerB  45.59 
 
 
326 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1802  phosphoserine phosphatase  41.74 
 
 
281 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4936  phosphoserine phosphatase  44.12 
 
 
322 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0826  phosphoserine phosphatase  41.48 
 
 
326 aa  177  2e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2322  phosphoserine phosphatase  41.74 
 
 
454 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3493  phosphoserine phosphatase  41.48 
 
 
326 aa  177  2e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1145  phosphoserine phosphatase SerB  46.08 
 
 
326 aa  177  2e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000532777 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4990  phosphoserine phosphatase  44.12 
 
 
322 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4902  phosphoserine phosphatase  44.12 
 
 
322 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4829  phosphoserine phosphatase  44.12 
 
 
322 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0624  phosphoserine phosphatase  43.14 
 
 
322 aa  177  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.184048  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4988  phosphoserine phosphatase  44.12 
 
 
322 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5077  phosphoserine phosphatase  41.49 
 
 
281 aa  177  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>