40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2880 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2880  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  100 
 
 		 224 aa  442  1e-123  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.038382 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3049  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  45.12 
 
 		 222 aa  134  8e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2351  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  35.11 
 
 		 233 aa  106  3e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.976848 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0147  hypothetical protein  32.42 
 
 		 226 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00900  hypothetical protein  31.65 
 
 		 226 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2372  hypothetical protein  29.73 
 
 		 243 aa  89.7  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1521  GTP-binding  27.35 
 
 		 258 aa  89.7  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.102823 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2315  hypothetical protein  31.36 
 
 		 229 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00174413  hitchhiker  0.0000205776 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3036  hypothetical protein  29.44 
 
 		 478 aa  82  0.000000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.582352  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0517  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  46.59 
 
 		 208 aa  82  0.000000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1591  hypothetical protein  31.46 
 
 		 231 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.174897  normal  0.265542 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1474  hypothetical protein  26.64 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.56271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2087  hypothetical protein  27.62 
 
 		 176 aa  69.7  0.00000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.253576  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26700  hypothetical protein  29.55 
 
 		 232 aa  65.1  0.0000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00558749  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3847  hypothetical protein  27.09 
 
 		 234 aa  65.1  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00197682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0255  hypothetical protein  32.12 
 
 		 288 aa  62.4  0.000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2463  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  27.54 
 
 		 235 aa  61.6  0.000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000017  protein phosphatase ImpM  24.89 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2838  hypothetical protein  41.18 
 
 		 327 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.451251  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1594  hypothetical protein  34.71 
 
 		 174 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.971877  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0400  hypothetical protein  40 
 
 		 179 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.19105  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0450  hypothetical protein  40 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2963  hypothetical protein  40 
 
 		 328 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.135446  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1203  hypothetical protein  40 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.843106  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1780  hypothetical protein  40 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6040  serine/threonine phosphoprotein phosphatase  28.3 
 
 		 483 aa  57  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3001  hypothetical protein  26.83 
 
 		 240 aa  56.6  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00249  hypothetical protein  36.36 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2812  hypothetical protein  23.57 
 
 		 337 aa  54.3  0.000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0214  type VI secretion-associated protein, BMA_A0400 family  30.77 
 
 		 241 aa  53.1  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.282429  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2500  hypothetical protein  29.2 
 
 		 302 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.399334  normal  0.740206 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2454  hypothetical protein  37.78 
 
 		 171 aa  49.3  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.29717  normal  0.714616 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4058  hypothetical protein  30.68 
 
 		 231 aa  48.9  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000734924 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2632  hypothetical protein  28.78 
 
 		 302 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.608596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2261  hypothetical protein  25 
 
 		 305 aa  47.4  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.274915  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2774  hypothetical protein  28.06 
 
 		 302 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.804609  normal  0.353313 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3132  hypothetical protein  31.37 
 
 		 163 aa  43.5  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0956079  normal  0.131919 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2187  hypothetical protein  26.51 
 
 		 327 aa  43.1  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3488  hypothetical protein  31.87 
 
 		 163 aa  42.7  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0408329  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4963  hypothetical protein  26.62 
 
 		 307 aa  42.4  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.74458  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>