More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1323 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1323  TrkA-N domain protein  100 
 
 		 346 aa  697    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2212  TrkA domain-containing protein  49.85 
 
 		 347 aa  294  1e-78  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217414  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2566  TrkA-N  43.89 
 
 		 366 aa  277  2e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.353731  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1744  TrkA-N domain protein  40.43 
 
 		 368 aa  248  1e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.844821 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0303  response regulator receiver domain-containing protein  39.52 
 
 		 384 aa  244  1.9999999999999999e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0063  TrkA family potassium uptake protein  36.02 
 
 		 351 aa  206  7e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0875  TrkA-N domain protein  34.03 
 
 		 350 aa  195  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2971  TrkA domain-containing protein  35.09 
 
 		 350 aa  194  2e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4160  TrkA domain-containing protein  34.66 
 
 		 351 aa  193  4e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2079  TrkA-N domain protein  35.31 
 
 		 371 aa  188  1e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3127  K+ transport systems, NAD-binding component  36.34 
 
 		 337 aa  187  2e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1528  TrkA domain-containing protein  35 
 
 		 347 aa  178  1e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.857437  normal  0.417483 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3794  TrkA-N domain protein  33.64 
 
 		 350 aa  176  4e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.434274  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3877  TrkA-N domain protein  33.64 
 
 		 350 aa  176  6e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.705897 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2743  TrkA domain-containing protein  32.15 
 
 		 333 aa  171  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2095  TrkA family potassium uptake protein  34.6 
 
 		 346 aa  171  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.188907  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3283  TrkA-N  29.76 
 
 		 332 aa  165  9e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.825743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0453  TrkA-N domain protein  31.15 
 
 		 346 aa  160  3e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5545  TrkA-N domain protein  33.74 
 
 		 341 aa  156  4e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.789205 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2518  TrkA-N domain protein  30.47 
 
 		 362 aa  156  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3004  TrkA-N domain-containing protein  28.7 
 
 		 354 aa  155  7e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0471  TrkA domain-containing protein  31.29 
 
 		 325 aa  155  1e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1045  TrkA domain-containing protein  32.27 
 
 		 350 aa  154  2e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.00000596347  hitchhiker  0.00364441 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0064  TrkA-N domain protein  34.23 
 
 		 337 aa  153  4e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00100  potassium channel protein  29.39 
 
 		 335 aa  151  2e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0117  TrkA-N domain protein  29.55 
 
 		 345 aa  150  3e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3731  hypothetical protein  29.6 
 
 		 338 aa  149  6e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.00000000000159336  normal  0.309617 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5153  TrkA-N domain protein  28.91 
 
 		 355 aa  146  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000053583 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0800  TrkA-N domain protein  29.48 
 
 		 331 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.501698  normal  0.632091 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0556  TrkA domain-containing protein  27.03 
 
 		 346 aa  145  1e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2039  TrkA-N domain protein  33.87 
 
 		 350 aa  144  3e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5573  potassium uptake protein, TrkA family  32.24 
 
 		 330 aa  143  5e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5489  potassium uptake protein, TrkA family  32.24 
 
 		 330 aa  143  5e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3915  TrkA domain-containing protein  36.29 
 
 		 330 aa  142  6e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.557122  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5187  TrkA domain-containing protein  37.13 
 
 		 330 aa  142  9e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0451  TrkA domain-containing protein  32.49 
 
 		 336 aa  142  9.999999999999999e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.278158  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5434  potassium uptake protein, TrkA family  31 
 
 		 337 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5075  potassium channel protein  31.91 
 
 		 334 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000793674  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5092  potassium channel protein  31.91 
 
 		 334 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00108262  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0368  TrkA-N domain protein  28.7 
 
 		 356 aa  139  7e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0361  TrkA-N domain protein  28.57 
 
 		 356 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5517  potassium uptake protein, TrkA family  31.58 
 
 		 330 aa  137  4e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2888  TrkA-N  30.77 
 
 		 357 aa  137  4e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0922  TrkA domain-containing protein  30.27 
 
 		 335 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1694  TrkA domain-containing protein  29.74 
 
 		 332 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.249596  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1743  TrkA-N domain protein  35.71 
 
 		 256 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.589845 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1024  TrkA domain-containing protein  30.61 
 
 		 335 aa  132  6e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.282206 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1654  TrkA domain-containing protein  28.96 
 
 		 335 aa  132  7.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.190782  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3909  TrkA domain-containing protein  27.67 
 
 		 355 aa  132  9e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0877338 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1751  TrkA domain-containing protein  29.36 
 
 		 332 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14401  K+ transport system, NAD-binding component  34.96 
 
 		 352 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000716154 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07731  VIC family potassium channel protein  33.48 
 
 		 351 aa  124  3e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3347  TrkA-N  29.72 
 
 		 352 aa  123  5e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.220422  normal  0.349567 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10941  hypothetical protein  31.33 
 
 		 346 aa  122  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00275534 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0403  VIC family potassium channel protein  31.33 
 
 		 346 aa  122  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.133961  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0715  VIC family potassium channel protein  33.04 
 
 		 351 aa  122  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.4714  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07711  VIC family potassium channel protein  33.04 
 
 		 351 aa  122  9.999999999999999e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.584573  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08671  VIC family potassium channel protein  32.2 
 
 		 351 aa  120  1.9999999999999998e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0618  VIC family potassium channel protein  33.76 
 
 		 351 aa  117  3e-25  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1634  TrkA domain-containing protein  29.36 
 
 		 339 aa  117  3e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.853014  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1142  TrkA domain-containing protein  26.58 
 
 		 341 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06531  putative potassium channel, VIC family protein  32.62 
 
 		 359 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0683  potassium channel protein  30.79 
 
 		 341 aa  111  1.0000000000000001e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1120  TrkA-N domain protein  27.3 
 
 		 335 aa  108  1e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000439413  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1744  VIC family potassium channel protein  31.2 
 
 		 352 aa  103  5e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2168  TrkA-N domain protein  35.11 
 
 		 531 aa  103  6e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1529  TrkA-N domain protein  33 
 
 		 395 aa  102  8e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.479554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2680  TrkA domain-containing protein  25.36 
 
 		 397 aa  101  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000721375  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1520  TrkA domain-containing protein  25.26 
 
 		 324 aa  98.6  1e-19  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.639077  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3710  TrkA-N  31.28 
 
 		 364 aa  97.4  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.360814  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4658  TrkA domain-containing protein  31.28 
 
 		 364 aa  97.4  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.677832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5641  TrkA domain-containing protein  31.28 
 
 		 364 aa  97.4  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.289182 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4030  TrkA domain-containing protein  30.05 
 
 		 364 aa  94.4  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.702941  normal  0.742816 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1162  TrkA-like protein  30.52 
 
 		 386 aa  95.1  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.30388 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4504  TrkA domain-containing protein  30.33 
 
 		 364 aa  95.1  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4046  TrkA domain-containing protein  30.33 
 
 		 364 aa  94  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.809582 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4663  TrkA domain-containing protein  28.91 
 
 		 359 aa  93.6  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2999  TrkA-N domain protein  29.65 
 
 		 388 aa  93.2  6e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0353  TrkA-N domain protein  31.31 
 
 		 542 aa  92.8  8e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1364  TrkA domain-containing protein  31.28 
 
 		 369 aa  92.4  9e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0542  TrkA domain-containing protein  30.81 
 
 		 326 aa  92.4  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1293  TrkA domain-containing protein  30.81 
 
 		 326 aa  92.4  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1025  putative potassium channel protein  30.81 
 
 		 326 aa  92.4  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2540  TrkA domain-containing protein  31.28 
 
 		 369 aa  92.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0305515  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1460  TrkA domain-containing protein  30.33 
 
 		 413 aa  92.4  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1286  putative potassium channel protein  31.28 
 
 		 369 aa  92.4  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0270  putative potassium channel protein  30.81 
 
 		 326 aa  92.4  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.435171  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0577  TrkA-N domain protein  30.81 
 
 		 395 aa  91.3  2e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3680  TrkA domain-containing protein  27.59 
 
 		 509 aa  90.1  5e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4906  TrkA-N domain protein  30.2 
 
 		 368 aa  88.6  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0415092 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1590  TrkA-N domain protein  32.89 
 
 		 252 aa  86.7  5e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5245  potassium channel protein, C-terminus  34.62 
 
 		 182 aa  86.7  5e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.835427  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1968  TrkA-N domain protein  27.75 
 
 		 544 aa  85.9  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0623944 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2970  TrkA-N domain protein  29.44 
 
 		 393 aa  85.1  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.489017  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3603  TrkA-N domain protein  27.93 
 
 		 335 aa  85.1  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.497588 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1804  TrkA domain-containing protein  27.5 
 
 		 359 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.008758  normal  0.0737173 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1601  hypothetical protein  26.61 
 
 		 378 aa  83.6  0.000000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13223  transmembrane cation transporter  27.24 
 
 		 355 aa  84  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3372  TrkA-N domain protein  30.82 
 
 		 251 aa  82.4  0.000000000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1256  TrkA-N domain protein  30.15 
 
 		 350 aa  82.4  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.430368  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>