More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1081 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1081  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 		 217 aa  421  1e-117  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.831593 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3914  SNARE associated Golgi protein  55.5 
 
 		 213 aa  211  4.9999999999999996e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.148472 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4966  SNARE associated Golgi protein  52.78 
 
 		 214 aa  206  2e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.248557 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4503  SNARE associated Golgi protein  52.78 
 
 		 214 aa  206  2e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.711425  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5019  SNARE associated Golgi protein  53.11 
 
 		 214 aa  202  2e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.432695  normal  0.972374 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0626  SNARE associated Golgi protein  50.72 
 
 		 215 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228359  decreased coverage  0.00442875 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1186  membrane-associated protein-like protein  48.46 
 
 		 355 aa  180  1e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1082  SNARE associated Golgi protein  50.72 
 
 		 205 aa  178  4e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2256  SNARE associated Golgi protein  50.51 
 
 		 224 aa  179  4e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2070  SNARE associated Golgi protein-related protein  43.5 
 
 		 215 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000366664  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2255  SNARE associated Golgi protein  52.51 
 
 		 213 aa  161  6e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3975  hypothetical protein  48.76 
 
 		 245 aa  159  3e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1944  SNARE associated Golgi protein  44.69 
 
 		 199 aa  144  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0186  SNARE associated Golgi protein  43.29 
 
 		 209 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0010  hypothetical protein  40.32 
 
 		 208 aa  126  3e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.163704  normal  0.0549348 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2490  hypothetical protein  47.59 
 
 		 218 aa  124  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4907  SNARE associated Golgi protein  34.91 
 
 		 227 aa  122  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.703178 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1260  SNARE associated Golgi protein  39.02 
 
 		 212 aa  122  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1291  SNARE associated Golgi protein  39.02 
 
 		 212 aa  121  8e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.677756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2069  hypothetical protein  41.61 
 
 		 209 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.873256  normal  0.0385471 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4889  SNARE associated Golgi protein-like protein  39.13 
 
 		 209 aa  114  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0232  phosphoesterase, PA-phosphatase related  44.44 
 
 		 457 aa  112  5e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0628  hypothetical protein  32.83 
 
 		 199 aa  106  2e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12655  transmembrane protein dedA  37.68 
 
 		 218 aa  100  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000783251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5318  hypothetical protein  36.22 
 
 		 206 aa  94.7  8e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745456  normal  0.776913 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1699  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  33.72 
 
 		 521 aa  94  1e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.422307  normal  0.249913 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3614  SNARE associated Golgi protein  28.99 
 
 		 204 aa  90.9  1e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1401  hypothetical protein  31.44 
 
 		 200 aa  90.9  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0480  dedA family protein  29.65 
 
 		 197 aa  90.1  2e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4843  dedA family protein  29.65 
 
 		 197 aa  89.4  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5176  dedA protein  30.29 
 
 		 204 aa  89.4  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0972  SNARE associated Golgi protein  29.63 
 
 		 210 aa  89.4  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.764938  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4741  dedA protein  29.81 
 
 		 204 aa  89  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.98218  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5141  dedA protein  29.81 
 
 		 204 aa  88.6  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0074  dedA protein  30.77 
 
 		 204 aa  88.6  6e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4897  dedA protein  29.81 
 
 		 204 aa  88.6  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4760  DedA family protein  29.81 
 
 		 204 aa  88.6  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5272  dedA protein  29.81 
 
 		 204 aa  88.6  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0395  SNARE associated Golgi protein  28.64 
 
 		 197 aa  88.6  6e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4020  SNARE associated Golgi protein-related protein  37.57 
 
 		 211 aa  88.6  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0932432  normal  0.0663531 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0394  hypothetical protein  29.15 
 
 		 198 aa  88.2  8e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0390  hypothetical protein  29.15 
 
 		 198 aa  88.2  8e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0461  dedA family protein  29.15 
 
 		 198 aa  88.2  8e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5170  dedA protein  29.81 
 
 		 204 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0403  dedA family protein  29.44 
 
 		 196 aa  88.2  1e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0415  DedA family protein  29.44 
 
 		 196 aa  88.2  1e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0531  dedA family protein  29.15 
 
 		 198 aa  87.8  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4856  SNARE associated Golgi protein  30.18 
 
 		 204 aa  87.8  1e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0439  dedA family protein  34.18 
 
 		 197 aa  87.4  1e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0530  dedA family protein  29.15 
 
 		 198 aa  87  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1709  SNARE associated Golgi protein-related protein  39.1 
 
 		 217 aa  87.4  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5185  dedA protein  29.81 
 
 		 204 aa  87  2e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2610  hypothetical protein  33.74 
 
 		 222 aa  86.7  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3002  SNARE associated Golgi protein  31.58 
 
 		 205 aa  86.3  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0432  dedA family protein  34.64 
 
 		 172 aa  85.9  4e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4992  SNARE associated Golgi protein  32.66 
 
 		 200 aa  85.9  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0402  SNARE associated Golgi protein  28.57 
 
 		 198 aa  85.9  4e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1806  hypothetical protein  27.41 
 
 		 203 aa  85.9  4e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.87635  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0543  SNARE associated Golgi protein  36.91 
 
 		 172 aa  85.9  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.582875  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0174  alkaline phosphatase  32.08 
 
 		 206 aa  84.7  9e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0970262  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0601  SNARE associated Golgi protein-related protein  32.24 
 
 		 205 aa  84.3  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0915  hypothetical protein  33 
 
 		 206 aa  84.7  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00745427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1810  SNARE associated Golgi protein  34.78 
 
 		 206 aa  84.3  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2081  putative integral membrane protein dedA-like protein  28.19 
 
 		 202 aa  84  0.000000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.253435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0566  DedA family protein  34.38 
 
 		 206 aa  84  0.000000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.180728 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0812  DedA family protein  33.74 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000122435  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0719  hypothetical protein  27.41 
 
 		 208 aa  83.2  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000531966  normal  0.139707 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0751  SNARE associated Golgi protein  32.81 
 
 		 223 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0704  SNARE associated Golgi protein  35.4 
 
 		 202 aa  82.8  0.000000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.693025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2620  SNARE associated Golgi protein  33.94 
 
 		 227 aa  82.8  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  36.42 
 
 		 198 aa  82.4  0.000000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0260  alkaline phosphatase-like protein  28.73 
 
 		 202 aa  82  0.000000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.894036  normal  0.360147 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0360  hypothetical protein  32.74 
 
 		 220 aa  81.6  0.000000000000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  33.33 
 
 		 220 aa  81.6  0.000000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1421  hypothetical protein  32.74 
 
 		 220 aa  81.6  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1530  hypothetical protein  32.74 
 
 		 220 aa  81.6  0.000000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0575  DedA family protein  32.52 
 
 		 213 aa  81.6  0.000000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.684924  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1030  SNARE associated Golgi protein-like protein  30.99 
 
 		 203 aa  81.6  0.000000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2473  hypothetical protein  31.98 
 
 		 219 aa  81.3  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1391  SNARE associated Golgi protein-related protein  30.19 
 
 		 201 aa  80.9  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0191  hypothetical protein  33.18 
 
 		 220 aa  80.9  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2412  SNARE associated Golgi protein  33.33 
 
 		 202 aa  80.5  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000349657  normal  0.38034 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02242  conserved inner membrane protein  33.73 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1339  SNARE associated Golgi protein-like protein  33.73 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.217693  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2597  hypothetical protein  33.14 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.651507 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2718  hypothetical protein  33.14 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2468  hypothetical protein  33.73 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1335  hypothetical protein  33.73 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.64425 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2555  hypothetical protein  33.14 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3851  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.08 
 
 		 671 aa  80.1  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.294206  normal  0.711383 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2609  hypothetical protein  33.14 
 
 		 219 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36856  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3457  hypothetical protein  33.73 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2509  hypothetical protein  33.14 
 
 		 219 aa  80.9  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02202  hypothetical protein  33.73 
 
 		 219 aa  80.1  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1601  hypothetical protein  30.86 
 
 		 202 aa  80.1  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.851852  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46140  DedA family membrane-associated protein  26.47 
 
 		 202 aa  79.3  0.00000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0874332  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1749  hypothetical protein  32.28 
 
 		 212 aa  79.3  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.17424 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2484  SNARE associated Golgi protein  33.8 
 
 		 229 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.87707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2611  hypothetical protein  30.96 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3933  DedA family transmembrane protein  32.98 
 
 		 223 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.95062  hitchhiker  0.00056893 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>