More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2227 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2227  30S ribosomal protein S17  100 
 
 
87 aa  179  8.000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.706142  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0344  30S ribosomal protein S17  82.56 
 
 
86 aa  148  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.72971  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1917  30S ribosomal protein S17  82.56 
 
 
85 aa  146  8e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.189253  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2132  30S ribosomal protein S17  89.33 
 
 
88 aa  142  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.250662  normal  0.493518 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2171  30S ribosomal protein S17  88 
 
 
88 aa  142  2e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.275223 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2449  30S ribosomal protein S17  88 
 
 
88 aa  142  2e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.345542  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1688  30S ribosomal protein S17  70.13 
 
 
82 aa  119  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000888762  hitchhiker  0.00000000386563 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1363  30S ribosomal protein S17  71.79 
 
 
80 aa  118  3e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.355182  normal  0.0197009 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0571  30S ribosomal protein S17  71.25 
 
 
81 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1669  30S ribosomal protein S17  66.25 
 
 
80 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0457334  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1849  30S ribosomal protein S17  66.67 
 
 
78 aa  112  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0814594  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0995  30S ribosomal protein S17  66.67 
 
 
78 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0284701 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3658  30S ribosomal protein S17  67.53 
 
 
82 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1373  30S ribosomal protein S17  66.23 
 
 
82 aa  110  7.000000000000001e-24  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.241761  normal  0.534013 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3439  30S ribosomal protein S17  66.23 
 
 
82 aa  110  7.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.510545  normal  0.502362 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5061  30S ribosomal protein S17  66.23 
 
 
82 aa  110  8.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.723055 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1439  30S ribosomal protein S17  65.79 
 
 
79 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.329181  normal  0.13779 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1341  30S ribosomal protein S17  65.79 
 
 
79 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.173733  normal  0.105866 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1554  30S ribosomal protein S17  66.23 
 
 
82 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1786  30S ribosomal protein S17  68.92 
 
 
78 aa  109  2.0000000000000002e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0432349  normal  0.0801565 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2745  ribosomal protein S17  66.67 
 
 
78 aa  108  4.0000000000000004e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0171881  normal  0.184511 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2304  30S ribosomal protein S17  63.64 
 
 
82 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.000928394  normal  0.101475 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3175  30S ribosomal protein S17  63.64 
 
 
82 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.909718 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0675  30S ribosomal protein S17  64 
 
 
80 aa  105  3e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000101254  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0707  30S ribosomal protein S17  64 
 
 
80 aa  105  3e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000487385  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1623  30S ribosomal protein S17  62.03 
 
 
79 aa  104  3e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0968495  normal  0.305137 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6017  30S ribosomal protein S17  68.92 
 
 
80 aa  104  4e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.462181  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0370  30S ribosomal protein S17  68.92 
 
 
80 aa  104  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2525  30S ribosomal protein S17  68.92 
 
 
80 aa  104  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1965  30S ribosomal protein S17  60.76 
 
 
80 aa  104  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0487108  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0263  30S ribosomal protein S17  64.47 
 
 
76 aa  103  7e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.308255  normal  0.630615 
 
 
-
 
NC_004310  BR1224  30S ribosomal protein S17  60.76 
 
 
80 aa  103  8e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1187  30S ribosomal protein S17  60.76 
 
 
80 aa  103  8e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.328591  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0294  30S ribosomal protein S17  60.81 
 
 
76 aa  99  2e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0768  30S ribosomal protein S17  62.82 
 
 
82 aa  99  2e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.193836  normal  0.777752 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0600  30S ribosomal protein S17  59.21 
 
 
76 aa  97.8  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2679  30S ribosomal protein S17  58.97 
 
 
79 aa  96.3  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.548519  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1937  30S ribosomal protein S17  63.38 
 
 
90 aa  96.3  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2975  30S ribosomal protein S17  52.87 
 
 
92 aa  95.9  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0506  ribosomal protein S17  55.95 
 
 
91 aa  95.1  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0458965  hitchhiker  0.000000000246265 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0336  ribosomal protein S17  55.95 
 
 
91 aa  95.1  3e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.131982  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0430  SSU ribosomal protein S17P  61.11 
 
 
86 aa  95.1  3e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.179877  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2809  30S ribosomal protein S17  61.36 
 
 
88 aa  91.7  3e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.718975  normal  0.451487 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1301  30S ribosomal protein S17  58.11 
 
 
107 aa  90.5  7e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000654359  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0856  SSU ribosomal protein S17P  53.01 
 
 
83 aa  89  2e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000349571  hitchhiker  0.000457351 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0467  SSU ribosomal protein S17P  57.75 
 
 
87 aa  87.8  5e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1258  30S ribosomal protein S17  62.79 
 
 
89 aa  87  7e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.406914  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1385  30S ribosomal protein S17  56.76 
 
 
107 aa  87  7e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000761749  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0288  30S ribosomal protein S17  58.57 
 
 
90 aa  87  7e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000125562  hitchhiker  0.00000171329 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1565  ribosomal protein S17  57.14 
 
 
86 aa  86.7  9e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00149156  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4740  30S ribosomal protein S17  56.94 
 
 
88 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0349479  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0463  30S ribosomal protein S17  56.94 
 
 
88 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.903355  hitchhiker  0.00000264542 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0776  ribosomal protein S17  56.94 
 
 
88 aa  85.1  3e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000000337654  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0493  30S ribosomal protein S17  56.94 
 
 
88 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.221769  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0496  30S ribosomal protein S17  56.94 
 
 
88 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000477154  normal  0.104043 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0849  30S ribosomal protein S17  56.34 
 
 
86 aa  84.7  4e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2702  30S ribosomal protein S17  57.53 
 
 
89 aa  84.7  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3015  30S ribosomal protein S17  58.82 
 
 
89 aa  84.3  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0267958  hitchhiker  0.00844971 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3515  ribosomal protein S17  54.17 
 
 
83 aa  84.3  5e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000390975  hitchhiker  0.000000987028 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1858  30S ribosomal protein S17  49.46 
 
 
94 aa  84.3  5e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.147715  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00739  30S ribosomal protein S17  56.16 
 
 
84 aa  84  6e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3906  ribosomal protein s17  50.62 
 
 
88 aa  83.6  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000281241  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0193  30S ribosomal protein S17  52.78 
 
 
82 aa  83.6  9e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000114051  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0728  30S ribosomal protein S17  55.56 
 
 
88 aa  83.2  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00313213  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0240  30S ribosomal protein S17  52.78 
 
 
82 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2637  30S ribosomal protein S17  52.05 
 
 
91 aa  82.8  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.107035  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3742  30S ribosomal protein S17  54.93 
 
 
84 aa  82.8  0.000000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000425306  hitchhiker  0.00355064 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0292  30S ribosomal protein S17  54.93 
 
 
84 aa  83.2  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000607542  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0968  30S ribosomal protein S17  58.33 
 
 
88 aa  82.8  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000132893  hitchhiker  0.000000938527 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0208  30S ribosomal protein S17  52.78 
 
 
82 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000014726  unclonable  0.0000000000149425 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0203  30S ribosomal protein S17  52.78 
 
 
82 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000279278  hitchhiker  0.00162508 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0208  30S ribosomal protein S17  52.78 
 
 
82 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000159917  hitchhiker  0.0000000011379 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03162  30S ribosomal protein S17  54.93 
 
 
84 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0016617  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0402  ribosomal protein S17  54.93 
 
 
84 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000755989  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3329  30S ribosomal protein S17  56.34 
 
 
89 aa  82.4  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000398832  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001733  SSU ribosomal protein S17p (S11e)  54.79 
 
 
84 aa  82  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000075143  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3992  30S ribosomal protein S17  54.93 
 
 
84 aa  82.4  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000847939  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3798  30S ribosomal protein S17  54.93 
 
 
84 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0301634  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0329  30S ribosomal protein S17  52.11 
 
 
84 aa  82.4  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00017601  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3794  30S ribosomal protein S17  54.93 
 
 
84 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000413516  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0328  SSU ribosomal protein S17P  59.42 
 
 
88 aa  82.4  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.11157e-25  unclonable  0.0000000432201 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3735  30S ribosomal protein S17  54.93 
 
 
84 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.000974473  normal  0.0213342 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0402  30S ribosomal protein S17  54.93 
 
 
84 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000858813  hitchhiker  0.0000630078 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03113  hypothetical protein  54.93 
 
 
84 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00156817  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0347  30S ribosomal protein S17  57.97 
 
 
89 aa  82.4  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.451528  decreased coverage  0.000267992 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3627  30S ribosomal protein S17  54.93 
 
 
84 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000562694  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3700  30S ribosomal protein S17  54.93 
 
 
84 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000665408  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3627  30S ribosomal protein S17  54.93 
 
 
84 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00167821  normal  0.881176 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0337  ribosomal protein S17  50.7 
 
 
89 aa  82  0.000000000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.177398  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3606  30S ribosomal protein S17  54.93 
 
 
84 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000146035  normal  0.0220451 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3696  30S ribosomal protein S17  54.93 
 
 
84 aa  82.8  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000629724  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2315  30S ribosomal protein S17  50.68 
 
 
87 aa  82  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0524873  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3505  30S ribosomal protein S17  54.93 
 
 
84 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141629  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4634  30S ribosomal protein S17  54.93 
 
 
84 aa  82.8  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000429697  normal  0.304682 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0689  30S ribosomal protein S17  54.93 
 
 
82 aa  82.8  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.138415  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06340  30S ribosomal protein S17  55.71 
 
 
88 aa  82  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.543967  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4535  30S ribosomal protein S17  52.11 
 
 
84 aa  82  0.000000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000000011061  hitchhiker  0.0016313 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23111  30S ribosomal protein S17  48.75 
 
 
88 aa  82  0.000000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08940  30S ribosomal protein S17  52.78 
 
 
88 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.299482  normal  0.0340675 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1344  SSU ribosomal protein S17P  62.67 
 
 
86 aa  81.6  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0736316 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>